初，平陵竇融累世仕宦河西，知其土俗，與更始右大司馬趙萌善，私謂兄弟曰：“天下安危未可知。河西殷富，帶河為固，張掖屬國精兵萬騎，一旦緩急，杜絕河津，足以自守，此遺種處也！”乃因萌求往河西。萌薦融於更始，以為張掖屬國都尉。融既到，撫結雄桀，懷輯羌虜，甚得其歡心。是時，酒泉太守安定梁統、金城太守庫鈞、張掖都尉茂陵史苞、酒泉都尉竺曾、敦煌都尉辛肜，並州郡英俊，融皆與厚善。及更始敗，融與梁統等計議曰：“今天下擾亂，未知所歸。河西鬥絕在羌、胡中，不同心戮力，則不能自守，權鈞力齊，複無以相率，當推一人為大將軍，共全五部，觀時變動。”議既定，而各謙讓。以位次，鹹共推梁統；統固辭，乃推融行河西五郡大將軍事。武威太守馬期、張掖太守任仲並孤立無黨，乃共移書告示之，二人即解印綬去。於是以梁統為武威太守，史苞為張掖太守，竺曾為酒泉太守，辛肜為敦煌太守。融居屬國，領都尉職如故；置從事，監察五郡。河西民俗質樸，而融等政亦寬和，上下相親，晏然富殖。修兵馬，習戰射，明烽燧，羌、胡犯塞，融輒自將與諸郡相救，皆如符要，每輒破之。其後羌、胡皆震服親附，內郡流民避兇饑者歸之不絕。
王莽之世，天下鹹思漢德，安定三水盧芳居左穀中，詐稱武帝曾孫劉文伯，雲“曾祖母，匈奴渾邪王之姊也”。常以是言誑惑安定間。王莽末，乃與三水屬國羌、胡起兵。更始至長安，征芳為騎都尉，使鎮撫安定以西。更始敗，三水豪桀共立芳為上將軍、西平王，使使與西羌、匈奴結和親。單於以為：“漢氏中絕，劉氏來歸，我亦當如唿韓邪立之，令尊事我。”乃使句林王將數千騎迎芳兄弟入匈奴，立芳為漢帝，以芳弟程為中郎將，將胡騎還入安定。
帝以關中未定，而鄧禹久不進兵，賜書責之曰：“司徒，堯也；亡賊，桀也。長安吏民遑遑無所依歸，宜以時進討，鎮慰西京，係百姓之心。”禹猶執前意，別攻上郡諸縣，更征兵引穀，歸至大要。積弩將軍馮愔、車騎將軍宗歆守栒邑，二人爭權相攻，愔遂殺歆，因反擊禹，禹遣使以聞。帝問使人：“愔所親愛為誰？”對曰：“護軍黃防。”帝度愔、防不能久和，勢必相忤，因報禹曰：“縛馮愔者，必黃防也。”乃遣尚書宗廣持節往降之。後月餘，防果執愔，將其眾歸罪。更始諸將王匡、胡殷、成丹等皆詣廣降，廣與東歸；至安邑，道欲亡，廣悉斬之。愔之叛也，引兵西向天水；隗囂逆擊，破之於高平，盡獲其輜重。於是禹承製遣使持節命囂為西州大將軍，得專製涼州、朔方事。
臘日，赤眉設樂大會，酒未行，群臣更相辯鬥；而兵眾遂各逾宮，斬關入，掠酒肉，互相殺傷。衛尉諸葛穉聞之，勒兵入，格殺百餘人，乃定。劉盆子惶恐，日夜啼泣，從官皆憐之。
帝遣宗正劉延攻天井關，與田邑連戰十餘合，延不得進。及更始敗，邑遣使請降；即拜為上黨太守。帝又遣諫議大夫儲大伯持節征鮑永；永未知更始存亡，疑不肯從，收係大伯，遣使馳至長安，詗問虛實。
初，帝從更始在宛，納新野陰氏之女麗華。是歲，遣使迎麗華與帝姊湖陽公主、妹寧平公主俱到洛陽；以麗華為貴人。更始西平王李通先娶寧平公主，上征通為衛尉。
初，更始以王閎為琅邪太守，張步據郡拒之。閎諭降，得贛榆等六縣；收兵與步戰，不勝。步既受劉永官號，治兵於劇，遣將徇泰山、東萊、城陽、膠東、北海、濟南、齊郡，皆下之。閎力不敵，乃詣步相見。步大陳兵而見之。怒曰：“步有何罪，君前見攻之甚！”閎按劍曰：“太守奉朝命，而文公擁兵相拒。閎攻賊耳，何謂甚邪！”步起跪謝，與之宴飲，待為上賓，令閎關掌郡事。
建武二年丙戌，公元二六年春，正月，甲子朔，日有食之。
劉恭知赤眉必敗，密教弟盆子歸璽綬，習為辭讓之言。及正旦大會，恭先曰：“諸君共立恭弟為帝，德誠深厚！立且一年，殽亂日甚，誠不足以相成，恐死而無益，願得退為庶人，更求賢知，唯諸君省察！”樊崇等謝曰：“此者崇等罪也。”恭複固請，或曰：“此寧式侯事邪？”恭惶恐起去。盆子乃下床解璽綬，叩頭曰：“今設置縣官而為賊如故，四方怨恨，不複信向，此皆立非其人所致。願乞骸骨，避賢聖路！必欲殺盆子以塞責者，無所離死！”因涕泣噓唏。崇等及會者數百人，莫不哀憐之，乃皆避席頓首曰：“臣無狀，負陛下，請自今已後，不敢複放縱！”因共抱持盆子，帶以璽綬；盆子號唿，不得已。既罷出，各閉營自守。三輔翕然，稱天子聰明，百姓爭還長安，市裏且滿。後二十餘日，複出，大掠如故。
刁子都為其部曲所殺，餘黨與諸賊會檀鄉，號檀鄉賊，寇魏郡、清河。魏郡大吏李熊弟陸謀反城迎檀鄉，或以告魏郡太守潁川銚期，期召問熊，熊叩頭首服，願與老母俱就死。期曰：“為吏儻不若為賊樂者，可歸與老母往就陸也！”使吏送出城。熊行，求得陸，將詣鄴城西門；陸不勝愧感，自殺以謝期。期嗟歎，以禮葬之，而還熊故職。於是郡中服其威信。帝遣吳漢率王梁等九將軍擊檀鄉於鄴東漳水上，大破之，十餘萬眾皆降。又使梁與大將軍杜茂將兵安輯魏郡、清河、東郡，悉平諸營保，三郡清靜，邊路流通。
庚辰，悉封諸功臣為列侯；梁侯鄧禹、廣平侯吳漢皆食四縣。博士丁恭議曰：“古者封諸侯不過百裏，強幹弱枝，所以為治也。今封四縣，不合法製。”帝曰：“古之亡國皆以無道，未嚐聞功臣地多而滅亡者也。”陰鄉侯陰識，貴人之兄也，以軍功當增封，識叩頭讓曰：“天下初定，將帥有功者眾，臣托屬掖廷，仍加爵邑，不可以示天下。此為親戚受賞，國人計功也。”帝從之。帝令諸將各言所樂，皆占美縣；河南太守潁川丁綿獨求封本鄉。或問其故，綿曰：“綿能薄功微，得鄉亭厚矣！”帝從其誌，封新安鄉侯。帝使郎中魏郡馮勤典諸侯封事，勤差量功次輕重，國土遠近，地勢豐薄，不相逾越，莫不厭服焉。帝以為能，尚書眾事皆令總錄之。故事：尚書郎以令史久次補之，帝始用孝廉為尚書郎。
起高廟於洛陽，四時合祀高祖、太宗、世宗；建社稷於宗廟之右；立郊兆於城南。
長安城中糧盡，赤眉收載珍寶，大縱火燒宮室、市裏，恣行殺掠，長安城中無複人行；乃引兵而西，眾號百萬，自南山轉掠城邑，遂入安定、北地。鄧禹引兵南至長安，軍昆明池，謁祠高廟，收十一帝神主，送詣洛陽；因巡行園陵，為置吏士奉守焉。
真定王楊造讖記曰：“赤九之後，癭楊為主。”楊病癭，欲以惑眾；與綿曼賊交通。帝遣騎都尉陳副、遊擊將軍鄧隆征之，楊閉城門不內。帝複遣前將軍耿純持節行幽、冀，所過勞慰王、侯，密敕收楊。純至真定，止傳舍，邀楊相見。純，真定宗室之出也，故楊不以為疑，且自恃眾強，而純意安靜，即從官屬詣之；楊兄弟並將輕兵在門外。楊入，見純，純接以禮敬，因延請其兄弟皆入，乃閉閣，悉誅之，因勒兵而出。真定震怖，無敢動者。帝憐楊謀未發而誅，複封其子為真定王。
二月，己酉，車駕幸修武。
鮑永、馮衍審知更始已亡，乃發喪，出儲大伯等，封上印綬，悉罷兵，幅巾詣河內，帝見永，問曰：“卿眾安在？”永離席叩頭曰：“臣事更始，不能令全，誠慚以其眾幸富貴，故悉罷之。”帝曰：“卿言大。”而意不悅。既而永以立功見用，衍遂廢棄。永謂衍曰：“昔高祖賞季布之罪，誅丁固之功；今遭明主，亦何憂哉！”衍曰：“人有挑其鄰人之妻者，其長者罵而少者報之。後其夫死，取其長者。或謂之曰：‘夫非罵爾者邪？’曰：‘在人欲其報我，在我欲其罵人也！’夫天命難知，人道易守，守道之臣，何患死亡！”
大司空王梁屢違詔命，帝怒，遣尚書宗廣持節即軍中斬梁；廣檻車送京師。既至，赦之，以為中郎將，北守箕關。
王莽之世，天下鹹思漢德，安定三水盧芳居左穀中，詐稱武帝曾孫劉文伯，雲“曾祖母，匈奴渾邪王之姊也”。常以是言誑惑安定間。王莽末，乃與三水屬國羌、胡起兵。更始至長安，征芳為騎都尉，使鎮撫安定以西。更始敗，三水豪桀共立芳為上將軍、西平王，使使與西羌、匈奴結和親。單於以為：“漢氏中絕，劉氏來歸，我亦當如唿韓邪立之，令尊事我。”乃使句林王將數千騎迎芳兄弟入匈奴，立芳為漢帝，以芳弟程為中郎將，將胡騎還入安定。
帝以關中未定，而鄧禹久不進兵，賜書責之曰：“司徒，堯也；亡賊，桀也。長安吏民遑遑無所依歸，宜以時進討，鎮慰西京，係百姓之心。”禹猶執前意，別攻上郡諸縣，更征兵引穀，歸至大要。積弩將軍馮愔、車騎將軍宗歆守栒邑，二人爭權相攻，愔遂殺歆，因反擊禹，禹遣使以聞。帝問使人：“愔所親愛為誰？”對曰：“護軍黃防。”帝度愔、防不能久和，勢必相忤，因報禹曰：“縛馮愔者，必黃防也。”乃遣尚書宗廣持節往降之。後月餘，防果執愔，將其眾歸罪。更始諸將王匡、胡殷、成丹等皆詣廣降，廣與東歸；至安邑，道欲亡，廣悉斬之。愔之叛也，引兵西向天水；隗囂逆擊，破之於高平，盡獲其輜重。於是禹承製遣使持節命囂為西州大將軍，得專製涼州、朔方事。
臘日，赤眉設樂大會，酒未行，群臣更相辯鬥；而兵眾遂各逾宮，斬關入，掠酒肉，互相殺傷。衛尉諸葛穉聞之，勒兵入，格殺百餘人，乃定。劉盆子惶恐，日夜啼泣，從官皆憐之。
帝遣宗正劉延攻天井關，與田邑連戰十餘合，延不得進。及更始敗，邑遣使請降；即拜為上黨太守。帝又遣諫議大夫儲大伯持節征鮑永；永未知更始存亡，疑不肯從，收係大伯，遣使馳至長安，詗問虛實。
初，帝從更始在宛，納新野陰氏之女麗華。是歲，遣使迎麗華與帝姊湖陽公主、妹寧平公主俱到洛陽；以麗華為貴人。更始西平王李通先娶寧平公主，上征通為衛尉。
初，更始以王閎為琅邪太守，張步據郡拒之。閎諭降，得贛榆等六縣；收兵與步戰，不勝。步既受劉永官號，治兵於劇，遣將徇泰山、東萊、城陽、膠東、北海、濟南、齊郡，皆下之。閎力不敵，乃詣步相見。步大陳兵而見之。怒曰：“步有何罪，君前見攻之甚！”閎按劍曰：“太守奉朝命，而文公擁兵相拒。閎攻賊耳，何謂甚邪！”步起跪謝，與之宴飲，待為上賓，令閎關掌郡事。
建武二年丙戌，公元二六年春，正月，甲子朔，日有食之。
劉恭知赤眉必敗，密教弟盆子歸璽綬，習為辭讓之言。及正旦大會，恭先曰：“諸君共立恭弟為帝，德誠深厚！立且一年，殽亂日甚，誠不足以相成，恐死而無益，願得退為庶人，更求賢知，唯諸君省察！”樊崇等謝曰：“此者崇等罪也。”恭複固請，或曰：“此寧式侯事邪？”恭惶恐起去。盆子乃下床解璽綬，叩頭曰：“今設置縣官而為賊如故，四方怨恨，不複信向，此皆立非其人所致。願乞骸骨，避賢聖路！必欲殺盆子以塞責者，無所離死！”因涕泣噓唏。崇等及會者數百人，莫不哀憐之，乃皆避席頓首曰：“臣無狀，負陛下，請自今已後，不敢複放縱！”因共抱持盆子，帶以璽綬；盆子號唿，不得已。既罷出，各閉營自守。三輔翕然，稱天子聰明，百姓爭還長安，市裏且滿。後二十餘日，複出，大掠如故。
刁子都為其部曲所殺，餘黨與諸賊會檀鄉，號檀鄉賊，寇魏郡、清河。魏郡大吏李熊弟陸謀反城迎檀鄉，或以告魏郡太守潁川銚期，期召問熊，熊叩頭首服，願與老母俱就死。期曰：“為吏儻不若為賊樂者，可歸與老母往就陸也！”使吏送出城。熊行，求得陸，將詣鄴城西門；陸不勝愧感，自殺以謝期。期嗟歎，以禮葬之，而還熊故職。於是郡中服其威信。帝遣吳漢率王梁等九將軍擊檀鄉於鄴東漳水上，大破之，十餘萬眾皆降。又使梁與大將軍杜茂將兵安輯魏郡、清河、東郡，悉平諸營保，三郡清靜，邊路流通。
庚辰，悉封諸功臣為列侯；梁侯鄧禹、廣平侯吳漢皆食四縣。博士丁恭議曰：“古者封諸侯不過百裏，強幹弱枝，所以為治也。今封四縣，不合法製。”帝曰：“古之亡國皆以無道，未嚐聞功臣地多而滅亡者也。”陰鄉侯陰識，貴人之兄也，以軍功當增封，識叩頭讓曰：“天下初定，將帥有功者眾，臣托屬掖廷，仍加爵邑，不可以示天下。此為親戚受賞，國人計功也。”帝從之。帝令諸將各言所樂，皆占美縣；河南太守潁川丁綿獨求封本鄉。或問其故，綿曰：“綿能薄功微，得鄉亭厚矣！”帝從其誌，封新安鄉侯。帝使郎中魏郡馮勤典諸侯封事，勤差量功次輕重，國土遠近，地勢豐薄，不相逾越，莫不厭服焉。帝以為能，尚書眾事皆令總錄之。故事：尚書郎以令史久次補之，帝始用孝廉為尚書郎。
起高廟於洛陽，四時合祀高祖、太宗、世宗；建社稷於宗廟之右；立郊兆於城南。
長安城中糧盡，赤眉收載珍寶，大縱火燒宮室、市裏，恣行殺掠，長安城中無複人行；乃引兵而西，眾號百萬，自南山轉掠城邑，遂入安定、北地。鄧禹引兵南至長安，軍昆明池，謁祠高廟，收十一帝神主，送詣洛陽；因巡行園陵，為置吏士奉守焉。
真定王楊造讖記曰：“赤九之後，癭楊為主。”楊病癭，欲以惑眾；與綿曼賊交通。帝遣騎都尉陳副、遊擊將軍鄧隆征之，楊閉城門不內。帝複遣前將軍耿純持節行幽、冀，所過勞慰王、侯，密敕收楊。純至真定，止傳舍，邀楊相見。純，真定宗室之出也，故楊不以為疑，且自恃眾強，而純意安靜，即從官屬詣之；楊兄弟並將輕兵在門外。楊入，見純，純接以禮敬，因延請其兄弟皆入，乃閉閣，悉誅之，因勒兵而出。真定震怖，無敢動者。帝憐楊謀未發而誅，複封其子為真定王。
二月，己酉，車駕幸修武。
鮑永、馮衍審知更始已亡，乃發喪，出儲大伯等，封上印綬，悉罷兵，幅巾詣河內，帝見永，問曰：“卿眾安在？”永離席叩頭曰：“臣事更始，不能令全，誠慚以其眾幸富貴，故悉罷之。”帝曰：“卿言大。”而意不悅。既而永以立功見用，衍遂廢棄。永謂衍曰：“昔高祖賞季布之罪，誅丁固之功；今遭明主，亦何憂哉！”衍曰：“人有挑其鄰人之妻者，其長者罵而少者報之。後其夫死，取其長者。或謂之曰：‘夫非罵爾者邪？’曰：‘在人欲其報我，在我欲其罵人也！’夫天命難知，人道易守，守道之臣，何患死亡！”
大司空王梁屢違詔命，帝怒，遣尚書宗廣持節即軍中斬梁；廣檻車送京師。既至，赦之，以為中郎將，北守箕關。