卻說朱由崧於五月即皇帝位於南京紫禁城武英殿，年號弘光，以次年為弘光元年。其國號依舊為“明”，史稱“南明”。
多爾袞聞報，召洪承疇洪老先生來府中秘議。此時這洪老先生，已讬史可法兄弟寄書招降，又與多爾袞代作一書，命故明副將韓拱薇，及參將陳萬春秘密遣送。
多爾袞照常辦事，除處理國務外，仍是監視工作，1644年（清順治元年、明崇禎十七年、李自成大順朝永昌元年，張獻忠大西朝大順元年）六月，多爾袞與諸王貝勒大臣商議決定，遷都北京。清廷遷都北京既是出於統一中原、雄霸九州的目光，也是基於退可出關外的戰略考慮。清廷以多爾袞為首者認為要“以圖進取”，必須遷都北京，隻有占據這個關口才能進而統一全國，“以建萬年不拔之業”。
多爾袞遂派降臣金之俊為監工大臣修築宮殿，從京城至山海關，填築大道；又招集侍女太監，派往各宮承值，宮中需用的器具物件，特遣專員往各處采辦；多爾袞當政務餘閑的時候，亦親去監察，足足忙了兩個多月，方報竣工。
八月二十日，清朝開始遷都。多爾袞派阿濟格、多鐸等，率兵出城巡察，又令於通州城外，先設行殿，命司設監去設帷幄禦座，尚衣監去呈冠服，錦衣衛去監鹵簿儀仗，旗手衛去陳金鼓旗幟，教坊司去備各種細樂。大致齊備，聞禦駕已入山海關，進次永平，即傳集滿漢王大臣，統穿著吉服，往行殿接駕。是日鑾駕已到京城，龍旗煥采，鸞輅和鈴，兩旁侍衛擁著一位七齡天子，生得秀眉隆準，器宇非凡，後麵便是兩宮皇太後。這位吉特氏，華服雍容，舉止端莊。多爾袞忙率王大臣等，排班跪接。由太監傳旨平身，始一齊起立，隨鑾駕而行。從永定門入大清門，王大臣等仍送迎如儀。是時城內的居民，早已奉到命令，家家門前，各設香案，煙雲繚繞，氣象升平。鑾駕徐徐經過，入了紫禁城，王大臣等始起身而退，隻多爾袞隨駕而入。
接連忙了數日，無非是安頓行裝，排設器具，十月初一，順治帝在皇極門（順治二年改稱太和門）祭告天地社稷，並將曆代神主，奉安太廟，並向全國頒布登基詔書，大旨為“國號大清，定都燕京，紀元順治”等語。加封多爾袞為叔父攝政王，命禮部為多爾袞建碑紀績，加賜多爾袞冊寶、上飾十三顆東珠的黑狐冠一頂、黑狐裘一襲，金銀、馬駝等。又加封濟爾哈朗為信義輔政王，晉封阿濟格為武英親王，念豪格跟從清軍平定中原有功，複肅親王豪格爵，賜吳三桂平西王冊印。
至此清王朝正式定都北京，開始了以北京為都城的長達260多年的統治。而且從順治令人為多爾袞建碑紀功，“永垂功名於萬世”開始，在待遇上，多爾袞開始淩駕於諸王之上。
此時全國的形式仍不容樂觀，李自成火燒紫禁城後七月渡黃河敗歸西安，不久，棄西安，經藍田，商州，走武關，西奔入陝。由於南明弘光帝朝廷的建立和大順軍的節節敗退，很多投降大順的原明朝將領複投南明或清朝，於是李自成疑心日盛。另一支農民軍在張獻忠率領下也於十月建大西國於成都，統一了全川。殘明勢力也已於五月中旬擁戴福王朱由崧為帝，定都於南京，改年號為弘光，尚擁有中國南部的半壁富庶江山，兵多糧足，構成清朝統一中國的障礙。
多爾袞在這種形式下，定下了對農民軍的主要力量堅決消滅，而對南明政權則是“先禮後兵”的戰略。遂授阿濟格為靖遠大將軍，率同吳三桂、尚可喜等，由大同邊外，會諸蒙古兵，入榆林延安，攻陝西的背後。多鐸為定國大將軍，率同孔有德等，由河南趨潼關，攻陝西的前麵。多爾袞又遣豪格出師山東，豪格不敢違慢，亦即奉令而去。
多爾袞則留京輔助順治處理政務，一日，正自大內迴邸，忽由洪承疇入見，報稱江南遣使左懋第、陳洪範、馬紹愉等，攜帶白金十萬兩，綢緞數萬匹，來此犒師。
多爾袞道：“何處的軍士，要他犒賞？”
洪承疇道：“說來可笑。他說是犒我朝軍士呢！還有史可法一封複書。”說至此，即袖出一書呈上，多爾袞拆開一閱，不禁驚歎，因史公來書，是洋洋二大篇。當即交洪承疇朗誦，承疇遂徐聲念道：“大明國督師兵部尚書，兼東閣大學士史可法頓首，謹啟大清國攝政王殿下，等等等等。”幾千字總結下來，我史可法是不會降順的。
洪承疇讀畢，隨道：“照陳洪範傳說，現在明福王用了馬士英、阮大铖等人，入閣辦事，恐怕就要滅亡。”
多爾袞問他何故？洪承疇道：“馬士英向來貪鄙，阮大铖是魏忠賢的幹兒，這等人執掌朝綱，還有何幸？”
多爾袞道：“還有史可法在。”
洪承疇道：“單靠這史可法一人，也怕是獨木難支。”
洪承疇接著道：“來使左懋第恰有四件事要求我朝：第一件，是要在天壽山特立園陵，改葬崇禎帝；第二件，是要索還北京，隻肯把山海關外，割畀我朝，每年贈我歲幣，隻有十萬兩；第三件，我朝與他國書，隻許稱可汗，不能稱帝；第四件，來使聘問，要照故明會典，不肯屈膝。”
多爾袞勃然道：“左懋第何人？敢說這樣的話！”
洪承疇道：“聞他為兵部右侍郎，兼右僉都禦史。
多爾袞陳思片刻，便道：“且令他三人暫居鴻臚寺中，再作計較。”
歇了幾天，洪承疇因染病乞假，不去上朝，忽聞朝中已遣迴南使，大吃一驚，忙來見多爾袞，問道：“王爺把南使都遣迴了麽？”
多爾袞道：“兩國相爭，不斬來使，自然令他迴去。”
承疇道：“老臣已與陳洪範密約，願招降江南將士。洪範可去，左、馬二人不應遣歸。”
多爾袞道：“你日前未曾聲明，今已遣歸，奈何？”
承疇道：“請速派得力人員，追迴左懋第、馬紹愉二人，隻放陳洪範迴南。”多爾袞點頭，即令學士詹霸，帶著禁軍，飛騎南追，不到兩三日工夫，即將左、馬二人截迴，並將其軟禁起來。
多爾袞聞報，召洪承疇洪老先生來府中秘議。此時這洪老先生，已讬史可法兄弟寄書招降，又與多爾袞代作一書，命故明副將韓拱薇，及參將陳萬春秘密遣送。
多爾袞照常辦事，除處理國務外，仍是監視工作，1644年（清順治元年、明崇禎十七年、李自成大順朝永昌元年，張獻忠大西朝大順元年）六月，多爾袞與諸王貝勒大臣商議決定，遷都北京。清廷遷都北京既是出於統一中原、雄霸九州的目光，也是基於退可出關外的戰略考慮。清廷以多爾袞為首者認為要“以圖進取”，必須遷都北京，隻有占據這個關口才能進而統一全國，“以建萬年不拔之業”。
多爾袞遂派降臣金之俊為監工大臣修築宮殿，從京城至山海關，填築大道；又招集侍女太監，派往各宮承值，宮中需用的器具物件，特遣專員往各處采辦；多爾袞當政務餘閑的時候，亦親去監察，足足忙了兩個多月，方報竣工。
八月二十日，清朝開始遷都。多爾袞派阿濟格、多鐸等，率兵出城巡察，又令於通州城外，先設行殿，命司設監去設帷幄禦座，尚衣監去呈冠服，錦衣衛去監鹵簿儀仗，旗手衛去陳金鼓旗幟，教坊司去備各種細樂。大致齊備，聞禦駕已入山海關，進次永平，即傳集滿漢王大臣，統穿著吉服，往行殿接駕。是日鑾駕已到京城，龍旗煥采，鸞輅和鈴，兩旁侍衛擁著一位七齡天子，生得秀眉隆準，器宇非凡，後麵便是兩宮皇太後。這位吉特氏，華服雍容，舉止端莊。多爾袞忙率王大臣等，排班跪接。由太監傳旨平身，始一齊起立，隨鑾駕而行。從永定門入大清門，王大臣等仍送迎如儀。是時城內的居民，早已奉到命令，家家門前，各設香案，煙雲繚繞，氣象升平。鑾駕徐徐經過，入了紫禁城，王大臣等始起身而退，隻多爾袞隨駕而入。
接連忙了數日，無非是安頓行裝，排設器具，十月初一，順治帝在皇極門（順治二年改稱太和門）祭告天地社稷，並將曆代神主，奉安太廟，並向全國頒布登基詔書，大旨為“國號大清，定都燕京，紀元順治”等語。加封多爾袞為叔父攝政王，命禮部為多爾袞建碑紀績，加賜多爾袞冊寶、上飾十三顆東珠的黑狐冠一頂、黑狐裘一襲，金銀、馬駝等。又加封濟爾哈朗為信義輔政王，晉封阿濟格為武英親王，念豪格跟從清軍平定中原有功，複肅親王豪格爵，賜吳三桂平西王冊印。
至此清王朝正式定都北京，開始了以北京為都城的長達260多年的統治。而且從順治令人為多爾袞建碑紀功，“永垂功名於萬世”開始，在待遇上，多爾袞開始淩駕於諸王之上。
此時全國的形式仍不容樂觀，李自成火燒紫禁城後七月渡黃河敗歸西安，不久，棄西安，經藍田，商州，走武關，西奔入陝。由於南明弘光帝朝廷的建立和大順軍的節節敗退，很多投降大順的原明朝將領複投南明或清朝，於是李自成疑心日盛。另一支農民軍在張獻忠率領下也於十月建大西國於成都，統一了全川。殘明勢力也已於五月中旬擁戴福王朱由崧為帝，定都於南京，改年號為弘光，尚擁有中國南部的半壁富庶江山，兵多糧足，構成清朝統一中國的障礙。
多爾袞在這種形式下，定下了對農民軍的主要力量堅決消滅，而對南明政權則是“先禮後兵”的戰略。遂授阿濟格為靖遠大將軍，率同吳三桂、尚可喜等，由大同邊外，會諸蒙古兵，入榆林延安，攻陝西的背後。多鐸為定國大將軍，率同孔有德等，由河南趨潼關，攻陝西的前麵。多爾袞又遣豪格出師山東，豪格不敢違慢，亦即奉令而去。
多爾袞則留京輔助順治處理政務，一日，正自大內迴邸，忽由洪承疇入見，報稱江南遣使左懋第、陳洪範、馬紹愉等，攜帶白金十萬兩，綢緞數萬匹，來此犒師。
多爾袞道：“何處的軍士，要他犒賞？”
洪承疇道：“說來可笑。他說是犒我朝軍士呢！還有史可法一封複書。”說至此，即袖出一書呈上，多爾袞拆開一閱，不禁驚歎，因史公來書，是洋洋二大篇。當即交洪承疇朗誦，承疇遂徐聲念道：“大明國督師兵部尚書，兼東閣大學士史可法頓首，謹啟大清國攝政王殿下，等等等等。”幾千字總結下來，我史可法是不會降順的。
洪承疇讀畢，隨道：“照陳洪範傳說，現在明福王用了馬士英、阮大铖等人，入閣辦事，恐怕就要滅亡。”
多爾袞問他何故？洪承疇道：“馬士英向來貪鄙，阮大铖是魏忠賢的幹兒，這等人執掌朝綱，還有何幸？”
多爾袞道：“還有史可法在。”
洪承疇道：“單靠這史可法一人，也怕是獨木難支。”
洪承疇接著道：“來使左懋第恰有四件事要求我朝：第一件，是要在天壽山特立園陵，改葬崇禎帝；第二件，是要索還北京，隻肯把山海關外，割畀我朝，每年贈我歲幣，隻有十萬兩；第三件，我朝與他國書，隻許稱可汗，不能稱帝；第四件，來使聘問，要照故明會典，不肯屈膝。”
多爾袞勃然道：“左懋第何人？敢說這樣的話！”
洪承疇道：“聞他為兵部右侍郎，兼右僉都禦史。
多爾袞陳思片刻，便道：“且令他三人暫居鴻臚寺中，再作計較。”
歇了幾天，洪承疇因染病乞假，不去上朝，忽聞朝中已遣迴南使，大吃一驚，忙來見多爾袞，問道：“王爺把南使都遣迴了麽？”
多爾袞道：“兩國相爭，不斬來使，自然令他迴去。”
承疇道：“老臣已與陳洪範密約，願招降江南將士。洪範可去，左、馬二人不應遣歸。”
多爾袞道：“你日前未曾聲明，今已遣歸，奈何？”
承疇道：“請速派得力人員，追迴左懋第、馬紹愉二人，隻放陳洪範迴南。”多爾袞點頭，即令學士詹霸，帶著禁軍，飛騎南追，不到兩三日工夫，即將左、馬二人截迴，並將其軟禁起來。