駐守在龍江的朱棣，突見奉天殿方向起火，趕忙率軍入宮，魏國公徐輝祖率軍抵抗，徐輝祖不敵，敗下陣來。徐輝祖痛哭流涕：“太祖皇帝，江山就要易主了，臣有心抗燕，卻已無力迴天，臣對不起太祖皇帝。”徐輝祖哭罷，獨自一人去了父祠，直至朱棣登基為帝，徐輝祖都在父祠當中不肯出來謁拜朱棣，朱棣一怒之下將徐輝祖關押在了天牢，幸有令儀為自己的長兄求情，才令其返迴私宅，得以善終。
朱棣打敗了徐輝祖，便帶兵匆匆奔向奉天殿，待朱棣趕到奉天殿，便急令宮人、親兵救火。朱棣見袁忠坐在地上哭泣，便走上前去，“袁公公，允炆去了哪裏？”袁忠起身給朱棣施禮，“好多時日不見四殿下，不知四殿下可好？”“還好，袁公公身體也還康健？”袁忠點了點頭，“托四殿下的福，老奴也還好。時光荏苒，昔日四殿下在禦花園玩耍之情景真是恍如昨日。”“是啊，記得二哥、三哥欺負本王與老五，都是袁公公偷偷找來大哥來護著我兄弟二人。”袁忠眼中泛著淚光，“老奴此生都周旋在殿下母子與太祖爺孫之間，既不能負了太祖，也不能負了碽妃。既要遵照太祖遺訓，又要保你兄弟無恙，老奴好生為難。今日四殿下帶兵入宮，老奴心中五味雜陳，不知是喜是憂。”朱棣此刻全然沒有一點心思聽袁忠說這些，隻是焦急地詢問著：“袁公公，允炆去了哪裏？”袁忠指著火還未滅的奉天殿，“陛下就在這火海之中。”朱棣看了看火還未滅的奉天殿，半信半疑地說道：“袁公公向來最為忠厚，從不說謊。”“火滅之後，四殿下親看。”
朱棣還是半信半疑，待奉天殿的火滅了，整座大殿幾乎燒成了灰燼，朱棣急忙率領親兵走到這廢墟中間來，親兵在廢墟中找到一具屍身，那屍身已燒得麵目全非，屍身腰間玉帶上的玉飾還清晰可辨。袁忠見馬皇後死得如此淒慘，不由得潸然淚下，可又不能說出這屍身是誰，隻得跪在屍身前哭喊著：“陛下......陛下......”朱棣一把拉過袁忠，“這是誰的屍身？”袁忠哭泣著，“四殿下不見那是陛下的玉帶？”朱棣冷冷說道：“允炆身長七尺，這屍身哪有七尺？”袁忠被朱棣的話驚住了，袁忠很是了解朱棣，他深知朱棣文韜武略，聰慧異常，朱棣既已從屍身的長短起了疑，便絕不會相信朱允炆已死。
正在此時，朱能走上前來，“殿下，這不是皇後的燕居冠？”朱棣從朱能手中拿過燕居冠，拂去冠上的灰燼，“可找到皇後的屍身？”朱能答道：“整座奉天殿就這一具屍身。”朱棣轉身問袁忠：“皇後的燕居冠應在坤寧宮，而不該在奉天殿，看這屍身的長短，莫不是馬皇後？”袁忠抬起頭來，凝視著朱棣，說道：“四殿下何必如此？四殿下既然還記得昔日懿文太子百般嗬護於你，如今又何必計較他的兒子身長幾尺？”“本王隻是想知道允炆的下落而已。”袁忠見朱棣還是不肯罷休，便問道：“四殿下起兵為何？若陛下還在，難不成四殿下清君側之後依照組訓，收兵於營，朝天子而還？陛下駕崩既是成就四殿下的最好結果，四殿下還何必追究允炆何處？”朱棣聽罷，沉默半晌，突然對著屍身哭泣道：“傻小子，你何故如此。皇四叔來替你鏟除奸佞，你卻被奸臣蠱惑，白白送了性命。”
過了幾日，寧王朱權率諸王及群臣勸諫朱棣：“國不可一日無君，建文帝受奸人蠱惑葬身火海，二位嫡出皇子又下落不明。諸王之中，隻有燕王殿下年齡最長，威望最高。請殿下為大明江山社稷著想，即位為帝。”朱棣故作推脫：“本王奉天靖難，隻為清除君側，待擒獲黃子澄、齊泰等奸臣，本王便收兵而還。”諸王及群臣又再勸諫：“請殿下為大明江山社稷著想，殿下為太祖高皇帝與孝慈高皇後嫡子，理應挽大明於危難。請殿下先即位再除奸臣。”寧王朱權及群臣苦苦勸進四天，朱棣終於答應登基為帝，隨即派人到北平接來了燕王府中的親眷。
這日，朱棣率軍從龍江入宮準備登基事宜。驚心動魄的靖難之役終於結束了，騎在戰馬上向皇宮奔去的朱棣感慨萬千，幼年喪母的悲痛，少年發奮的辛勞，中年起兵的艱辛一一在他腦中掠過，看著越來越近的皇宮，一絲欣慰驟然掠過朱棣的心頭。可突然一人冒死攔住朱棣，大喊一聲：“殿下且慢。”朱棣急忙勒馬停住，隻見馬前一文臣攔於道中，朱棣見此文臣儀表堂堂，更吃驚一文臣竟敢當街攔住自己，朱棣還在疑惑當中，那文臣已開口問道：“殿下是先謁陵還是先即位？”此文臣一句話點醒了朱棣，自己起兵乃是“奉天靖難”，討伐奸臣的，如今天位已虛，自己即將登基為帝，卻不曾去祖靈告祭一下自己的父皇，這成何體統？這文臣提醒得甚對，先去謁陵，否則，便是謀逆。朱棣讚許地向那文臣拱了拱手，“敢問先生姓名。”那文臣答道：“臣翰林院編修楊榮。”朱棣再對楊榮拱了拱手，便急忙調轉馬頭率大軍去了太祖孝陵。
朱棣行至孝陵，走進享殿，環視著享殿中的牌位，見這享殿裏依然沒有自己生母碽妃的牌位。朱棣走到朱元璋的牌位前，跪倒在地，眼淚直落：“父皇，老四來了。老四又跪在您的牌位前了，多少次，老四都以為此生再也沒有這樣的機會了。父皇，老四總算能與父皇好生暢談一番。父皇可知老四這久治不愈的咳疾與風濕之症便是當年北征之時所患？父皇你太過偏心，老四自小失去生母，又不得父皇垂愛。這四十年來老四受人欺侮，忍氣吞聲。秦、晉二王欺侮我兄弟，老四百般隱忍；建文削藩，老四佯裝癡顛；戰場之上，老四冒死拚殺，幾番險些丟了性命。可老四從未認輸，總有一天老四要讓父皇看到，若無皇四子燕王棣便無大明海清河晏之盛景，若無碽妃便無大明太平盛世之基業。如今，天位已虛，諸王群臣再三勸進，老四不能置父皇基業於不顧，不能置天下生民於不顧，老四就要登基為帝了，父皇放心，老四定學父皇為政勤勉，勵精圖治，把這大明江山治理好。還有，老四知道父皇是愛母妃的，這麽多年來，父皇與母妃生亦別離，死亦別離，苦了父皇、也苦了母妃。待老四登基為帝，老四便將母妃的牌位放在這享殿中，讓母妃陪伴父皇。”說畢，朱棣站起身來，走到享殿的門口，朱棣又迴轉過身來，“老四不會讓父皇失望的，父皇此生未完成的，老四替父皇完成，多年之後，老四會給父皇締造一個海清河晏的大明盛世。”朱棣說完，便離開了享殿，跨上戰馬，直奔皇宮。
既要即位稱帝，就需要一位能服眾的人來為朱棣草擬即位詔書。方孝孺為當今大儒，名震天下，當然是草擬即位詔書的首選人物，朱棣的即位詔書若是能由方孝孺來草擬，那朱棣便在很大程度上贏得了民心。於是朱棣請來了方孝孺草擬即位詔書，朱棣畢恭畢敬地在大殿當中等著方孝孺，不料方孝孺卻身著孝衣大哭著走上大殿。朱棣見狀趕忙走到方孝孺身前，笑著說道：“先生毋要自苦，本王隻是效仿周公輔佐成王。”方孝孺冷笑一聲，“如今成王何在？”“成王自焚而亡。”方孝孺又問：“怎不立成王之子？”“成王之子下落不明。”“嫡子不存，庶子還在。”“國賴長君。”“如何不立成王之弟？”朱棣有些不耐煩，“這是我皇家家事，不勞先生費心。”方孝孺狠狠盯著朱棣，泰然說道：“天下乃是太祖的天下，我身為大明臣子，就要遵從太祖遺訓。”朱棣厲聲吩咐侍從：“拿紙筆來，讓方先生草詔。”方孝孺接過筆來，看著朱棣又是冷笑一聲，便奮筆疾書，書畢，將紙張交予朱棣，朱棣接過一看，上書：“燕賊篡位。”朱棣大怒，把紙張撕得粉碎。方孝孺指著朱棣罵道：“你這狗彘不若的謀逆亂臣，就算你登上皇位又如何？你注定永世受人唾罵。”氣得渾身發抖的朱棣指著方孝孺，“你若不草詔，本王便誅你九族？”方孝孺仰天大笑：“燕賊篡帝位，不得善終，忠臣死國難，雖死猶榮。區區燕賊，誅我九族何所懼？便誅十族又奈何？”朱棣火冒三丈，大喊道：“好，本王成全你，誅方孝孺十族，聚寶門行刑。”方孝孺咬著牙齒罵道：“燕賊！燕賊！你永遠是謀逆的燕賊，世世代代受人唾罵的篡位燕賊。”朱棣大喊道：“方孝孺九族及門下學生不得一人生存。”
聽到被誅十族的消息，方孝孺的妻子鄭氏性情剛烈，不待燕軍來到府上，便與方孝孺的兩個兒子方中憲、方中愈自縊而亡，方孝孺的兩個女兒來到秦淮河邊，跳河自盡。方孝孺其餘親人及門下學生共八百七十三人被押赴聚寶門。
眼睜睜地看著自己的親人被砍下頭顱，方孝孺聲淚俱下。方孝孺的弟弟方孝友見兄長哭泣，開口勸道，“哥哥不必悲傷，父親在時便常對你我說，人活在世，要‘仰不愧於天，俯不怍於人。’我方家世代賢良，忠君報國。如今滿門忠烈，先祖足當含笑九泉。”方孝孺扭頭看著方孝友，眼淚卻是止不住，哽咽著說道：“殉身大明、盡忠陛下，我百死何憾？隻是苦了你們。”方孝友微微一笑，對著方孝孺吟了一首絕命詩：“阿兄何必淚潸潸，取義成仁在此間。華表柱頭千載後，旅魂依舊到家山。”方孝孺聽了方孝友的這首詩，閉上了雙目，也吟了一首絕命詩：“天降亂離兮孰知其由，奸臣得計兮謀國用猶。忠臣發憤兮血淚交流，以此殉君兮抑又何求？鳴唿哀哉兮庶不我尤！”如此，千古忠臣方孝孺為建文帝盡忠，時年四十六歲，其十族被朱棣誅殺。
朱棣打敗了徐輝祖，便帶兵匆匆奔向奉天殿，待朱棣趕到奉天殿，便急令宮人、親兵救火。朱棣見袁忠坐在地上哭泣，便走上前去，“袁公公，允炆去了哪裏？”袁忠起身給朱棣施禮，“好多時日不見四殿下，不知四殿下可好？”“還好，袁公公身體也還康健？”袁忠點了點頭，“托四殿下的福，老奴也還好。時光荏苒，昔日四殿下在禦花園玩耍之情景真是恍如昨日。”“是啊，記得二哥、三哥欺負本王與老五，都是袁公公偷偷找來大哥來護著我兄弟二人。”袁忠眼中泛著淚光，“老奴此生都周旋在殿下母子與太祖爺孫之間，既不能負了太祖，也不能負了碽妃。既要遵照太祖遺訓，又要保你兄弟無恙，老奴好生為難。今日四殿下帶兵入宮，老奴心中五味雜陳，不知是喜是憂。”朱棣此刻全然沒有一點心思聽袁忠說這些，隻是焦急地詢問著：“袁公公，允炆去了哪裏？”袁忠指著火還未滅的奉天殿，“陛下就在這火海之中。”朱棣看了看火還未滅的奉天殿，半信半疑地說道：“袁公公向來最為忠厚，從不說謊。”“火滅之後，四殿下親看。”
朱棣還是半信半疑，待奉天殿的火滅了，整座大殿幾乎燒成了灰燼，朱棣急忙率領親兵走到這廢墟中間來，親兵在廢墟中找到一具屍身，那屍身已燒得麵目全非，屍身腰間玉帶上的玉飾還清晰可辨。袁忠見馬皇後死得如此淒慘，不由得潸然淚下，可又不能說出這屍身是誰，隻得跪在屍身前哭喊著：“陛下......陛下......”朱棣一把拉過袁忠，“這是誰的屍身？”袁忠哭泣著，“四殿下不見那是陛下的玉帶？”朱棣冷冷說道：“允炆身長七尺，這屍身哪有七尺？”袁忠被朱棣的話驚住了，袁忠很是了解朱棣，他深知朱棣文韜武略，聰慧異常，朱棣既已從屍身的長短起了疑，便絕不會相信朱允炆已死。
正在此時，朱能走上前來，“殿下，這不是皇後的燕居冠？”朱棣從朱能手中拿過燕居冠，拂去冠上的灰燼，“可找到皇後的屍身？”朱能答道：“整座奉天殿就這一具屍身。”朱棣轉身問袁忠：“皇後的燕居冠應在坤寧宮，而不該在奉天殿，看這屍身的長短，莫不是馬皇後？”袁忠抬起頭來，凝視著朱棣，說道：“四殿下何必如此？四殿下既然還記得昔日懿文太子百般嗬護於你，如今又何必計較他的兒子身長幾尺？”“本王隻是想知道允炆的下落而已。”袁忠見朱棣還是不肯罷休，便問道：“四殿下起兵為何？若陛下還在，難不成四殿下清君側之後依照組訓，收兵於營，朝天子而還？陛下駕崩既是成就四殿下的最好結果，四殿下還何必追究允炆何處？”朱棣聽罷，沉默半晌，突然對著屍身哭泣道：“傻小子，你何故如此。皇四叔來替你鏟除奸佞，你卻被奸臣蠱惑，白白送了性命。”
過了幾日，寧王朱權率諸王及群臣勸諫朱棣：“國不可一日無君，建文帝受奸人蠱惑葬身火海，二位嫡出皇子又下落不明。諸王之中，隻有燕王殿下年齡最長，威望最高。請殿下為大明江山社稷著想，即位為帝。”朱棣故作推脫：“本王奉天靖難，隻為清除君側，待擒獲黃子澄、齊泰等奸臣，本王便收兵而還。”諸王及群臣又再勸諫：“請殿下為大明江山社稷著想，殿下為太祖高皇帝與孝慈高皇後嫡子，理應挽大明於危難。請殿下先即位再除奸臣。”寧王朱權及群臣苦苦勸進四天，朱棣終於答應登基為帝，隨即派人到北平接來了燕王府中的親眷。
這日，朱棣率軍從龍江入宮準備登基事宜。驚心動魄的靖難之役終於結束了，騎在戰馬上向皇宮奔去的朱棣感慨萬千，幼年喪母的悲痛，少年發奮的辛勞，中年起兵的艱辛一一在他腦中掠過，看著越來越近的皇宮，一絲欣慰驟然掠過朱棣的心頭。可突然一人冒死攔住朱棣，大喊一聲：“殿下且慢。”朱棣急忙勒馬停住，隻見馬前一文臣攔於道中，朱棣見此文臣儀表堂堂，更吃驚一文臣竟敢當街攔住自己，朱棣還在疑惑當中，那文臣已開口問道：“殿下是先謁陵還是先即位？”此文臣一句話點醒了朱棣，自己起兵乃是“奉天靖難”，討伐奸臣的，如今天位已虛，自己即將登基為帝，卻不曾去祖靈告祭一下自己的父皇，這成何體統？這文臣提醒得甚對，先去謁陵，否則，便是謀逆。朱棣讚許地向那文臣拱了拱手，“敢問先生姓名。”那文臣答道：“臣翰林院編修楊榮。”朱棣再對楊榮拱了拱手，便急忙調轉馬頭率大軍去了太祖孝陵。
朱棣行至孝陵，走進享殿，環視著享殿中的牌位，見這享殿裏依然沒有自己生母碽妃的牌位。朱棣走到朱元璋的牌位前，跪倒在地，眼淚直落：“父皇，老四來了。老四又跪在您的牌位前了，多少次，老四都以為此生再也沒有這樣的機會了。父皇，老四總算能與父皇好生暢談一番。父皇可知老四這久治不愈的咳疾與風濕之症便是當年北征之時所患？父皇你太過偏心，老四自小失去生母，又不得父皇垂愛。這四十年來老四受人欺侮，忍氣吞聲。秦、晉二王欺侮我兄弟，老四百般隱忍；建文削藩，老四佯裝癡顛；戰場之上，老四冒死拚殺，幾番險些丟了性命。可老四從未認輸，總有一天老四要讓父皇看到，若無皇四子燕王棣便無大明海清河晏之盛景，若無碽妃便無大明太平盛世之基業。如今，天位已虛，諸王群臣再三勸進，老四不能置父皇基業於不顧，不能置天下生民於不顧，老四就要登基為帝了，父皇放心，老四定學父皇為政勤勉，勵精圖治，把這大明江山治理好。還有，老四知道父皇是愛母妃的，這麽多年來，父皇與母妃生亦別離，死亦別離，苦了父皇、也苦了母妃。待老四登基為帝，老四便將母妃的牌位放在這享殿中，讓母妃陪伴父皇。”說畢，朱棣站起身來，走到享殿的門口，朱棣又迴轉過身來，“老四不會讓父皇失望的，父皇此生未完成的，老四替父皇完成，多年之後，老四會給父皇締造一個海清河晏的大明盛世。”朱棣說完，便離開了享殿，跨上戰馬，直奔皇宮。
既要即位稱帝，就需要一位能服眾的人來為朱棣草擬即位詔書。方孝孺為當今大儒，名震天下，當然是草擬即位詔書的首選人物，朱棣的即位詔書若是能由方孝孺來草擬，那朱棣便在很大程度上贏得了民心。於是朱棣請來了方孝孺草擬即位詔書，朱棣畢恭畢敬地在大殿當中等著方孝孺，不料方孝孺卻身著孝衣大哭著走上大殿。朱棣見狀趕忙走到方孝孺身前，笑著說道：“先生毋要自苦，本王隻是效仿周公輔佐成王。”方孝孺冷笑一聲，“如今成王何在？”“成王自焚而亡。”方孝孺又問：“怎不立成王之子？”“成王之子下落不明。”“嫡子不存，庶子還在。”“國賴長君。”“如何不立成王之弟？”朱棣有些不耐煩，“這是我皇家家事，不勞先生費心。”方孝孺狠狠盯著朱棣，泰然說道：“天下乃是太祖的天下，我身為大明臣子，就要遵從太祖遺訓。”朱棣厲聲吩咐侍從：“拿紙筆來，讓方先生草詔。”方孝孺接過筆來，看著朱棣又是冷笑一聲，便奮筆疾書，書畢，將紙張交予朱棣，朱棣接過一看，上書：“燕賊篡位。”朱棣大怒，把紙張撕得粉碎。方孝孺指著朱棣罵道：“你這狗彘不若的謀逆亂臣，就算你登上皇位又如何？你注定永世受人唾罵。”氣得渾身發抖的朱棣指著方孝孺，“你若不草詔，本王便誅你九族？”方孝孺仰天大笑：“燕賊篡帝位，不得善終，忠臣死國難，雖死猶榮。區區燕賊，誅我九族何所懼？便誅十族又奈何？”朱棣火冒三丈，大喊道：“好，本王成全你，誅方孝孺十族，聚寶門行刑。”方孝孺咬著牙齒罵道：“燕賊！燕賊！你永遠是謀逆的燕賊，世世代代受人唾罵的篡位燕賊。”朱棣大喊道：“方孝孺九族及門下學生不得一人生存。”
聽到被誅十族的消息，方孝孺的妻子鄭氏性情剛烈，不待燕軍來到府上，便與方孝孺的兩個兒子方中憲、方中愈自縊而亡，方孝孺的兩個女兒來到秦淮河邊，跳河自盡。方孝孺其餘親人及門下學生共八百七十三人被押赴聚寶門。
眼睜睜地看著自己的親人被砍下頭顱，方孝孺聲淚俱下。方孝孺的弟弟方孝友見兄長哭泣，開口勸道，“哥哥不必悲傷，父親在時便常對你我說，人活在世，要‘仰不愧於天，俯不怍於人。’我方家世代賢良，忠君報國。如今滿門忠烈，先祖足當含笑九泉。”方孝孺扭頭看著方孝友，眼淚卻是止不住，哽咽著說道：“殉身大明、盡忠陛下，我百死何憾？隻是苦了你們。”方孝友微微一笑，對著方孝孺吟了一首絕命詩：“阿兄何必淚潸潸，取義成仁在此間。華表柱頭千載後，旅魂依舊到家山。”方孝孺聽了方孝友的這首詩，閉上了雙目，也吟了一首絕命詩：“天降亂離兮孰知其由，奸臣得計兮謀國用猶。忠臣發憤兮血淚交流，以此殉君兮抑又何求？鳴唿哀哉兮庶不我尤！”如此，千古忠臣方孝孺為建文帝盡忠，時年四十六歲，其十族被朱棣誅殺。