楊康帶著穆念慈前來見丐幫的簡長老、彭長老和梁長老，穆念慈得知楊康已進丐幫，非常開心，楊康也表示自己一定會在丐幫實現自己的理想和抱負，更不會讓穆念慈失望。楊康想在丐幫大會這日迎娶穆念慈，在丐幫的幫忙籌備下，楊康和穆念慈準備當日結婚。
楊康將藏有武穆遺書線索的畫交給完顏洪烈，得知此書在鐵掌峰，完顏洪烈大為開心。一直以來丐幫都是金人南攻的阻力，楊康表示如果讓丐幫整體南遷，或許能他們省去很多麻煩。楊康表示待自己接任丐幫幫主之位後會安排此事。歐陽鋒前來尋楊康找歐陽克，他重返牛家村未能找到歐陽克身影，就連平日聯係的線索也消失，歐陽鋒氣怒下認為完顏洪烈沒有護好歐陽克，本想出手殺人，楊康出麵表示是郭靖殺了歐陽克。
楊康告訴歐陽鋒如今郭靖和黃蓉就在他手中，而他即將接任丐幫幫主之位，隻恨自己身無長處如履薄冰，希望能拜入歐陽鋒手下習得本事一統丐幫。楊康穆念慈在丐幫舉辦婚禮成為夫妻，穆念慈一身紅衣在新房等待楊康，他讓楊康先去參加丐幫大會，而她會在房內等著楊康。彭長老在丐幫大會上將洪七公身死的消息公布於眾，而楊康也現身丐幫眾人麵前，將洪七公之死誣陷給了黃藥師、黃蓉和郭靖。魯有腳不相信楊康所言，認為洪七公和黃藥師交好，不會對彼此痛下殺手。淨衣派長老希望讓手持打狗棒的楊康接任丐幫幫主之位，但是汙衣派之人認為洪七公此前有意讓魯有腳長老接任丐幫，兩方爭執不斷，但因為楊康有洪七公遺命，且手持打狗棒，汙衣幫也隻能承認楊康的幫主之位。
楊康登上軒轅台成功接任丐幫幫主之位，隨後他命人將郭靖和黃蓉帶到眾人麵前，指認兩人殺害洪七公，還表示今日要殺了兩人為洪七公報仇。魯有腳等人並不相信郭靖和黃蓉會殺害洪七公，希望楊康能明察此事。郭靖和黃蓉被點了啞穴，楊康以黃蓉性命威脅，逼迫郭靖承認他的問話。
眼見郭靖和黃蓉即將命喪丐幫之手，鐵掌幫前來拜見入山，魯有腳趁機勸說楊康暫時將郭靖和黃蓉關押，待接待完鐵掌幫後再行處理。裘千仞帶人前來丐幫，得知今日丐幫新任丐幫繼位，他帶來無數珍寶特來借花獻佛。裘千仞表示這些珍寶是金人六王爺所贈，勸說丐幫幫眾南遷，楊康也同意丐幫南遷，但是魯有腳認為丐幫的北方基業不能輕易割舍，而金人的禮物更是不能收取。淨衣派聽從楊康命令，但是魯有腳堅決不撤離北方，而丐幫部分人也誓死不做叛賊。
裘千仞眼見無法成事，出手殺了兩名丐幫之人示眾。郭靖觀星變化意外領悟北鬥七星奧義，借此融會貫通最終煉成了九陰真經，他以功力重開束縛，隨後救出黃蓉前往丐幫大會。裘千仞本要殺了誓死不願南遷的魯有腳，郭靖現身救下魯有腳，裘千仞對陣郭靖發現此人功夫了得，而他眼見就要華山論劍，不欲與郭靖多加比試。他沒有聽從楊康安排選擇帶人離開丐幫。原來在此之前真正的裘千仞讓弟弟裘千丈冒充自己去解決蒙古使團，而因為丐幫一行要動手，他才親身前往此地。
楊康讓彭長老帶人圍攻郭靖和黃蓉，勢必要殺了郭靖和黃蓉，郭靖助黃蓉逃出丐幫之人圍困，黃蓉以丐幫武學奪迴楊康手中的打狗棒，並告知丐幫之人洪七公並未歸天，而是楊康在此故意造謠。黃蓉手持打狗棒，告訴丐幫眾人她才是洪七公欽點的丐幫傳人。黃蓉告訴大家楊康其實姓完顏，是大金趙王爺的兒子，是來奪權滅宋之人。黃蓉所說楊康之事丐幫中的彭長老等人不信，黃蓉索性拿出鐵掌令，表示這是從楊康身上所拿，證明楊康就是金人的走狗。楊康眼見黃蓉壞自己謀劃，下手暗算黃蓉，幸虧黃蓉身著軟蝟甲才逃過一劫。
黃蓉為了證明自己才是洪七公親傳的丐幫弟子，她施展打狗棒法教訓楊康，雖然魯有腳認為這就是正宗的打狗棒法，但是彭長老依然不願承認。隨後彭長老等人提出如果黃蓉用打狗棒法勝過三人，他們就承認黃蓉的丐幫幫主身份。黃蓉以一敵三，成功用打狗棒法打敗彭長老三人，三人也最終承認了她的幫主身份。
彭長老假意臣服，卻想蠱惑黃蓉趁機害她，幸虧郭靖反應及時打傷彭長老，才讓黃蓉免於受傷。黃蓉安排簡長老、梁長老率弟子東下臨安迎接洪七公，讓魯長老安葬餘、黎兩位兄弟，還表示自己不在丐幫之時幫中一切事務由魯長老暫代。楊康趁亂逃走，為了不讓穆念慈得知真相，他偷偷將點昏穆念慈將其帶走。黃蓉和郭靖在街上看到裘千仞坑蒙拐騙，但此時兩人並不知此人其實是裘千丈而非裘千仞。裘千丈看到兩人本想逃走卻被抓個正著，黃蓉出手教訓了裘千丈一頓，裘千丈再次假裝腹中不適，眼見黃蓉不信自己，更是無恥的當眾脫褲子，郭靖氣怒出手教訓裘千丈，而裘千丈則故意與郭靖相約七日之後相約鐵掌山下較量。黃蓉和郭靖想到武穆遺書還藏在鐵掌山，欣然同意應約。
穆念慈醒來發現楊康前去丐幫的一切所作所為都是為了大金，她氣怒之下想要殺了完顏洪烈，楊康發現後及時阻攔。穆念慈失望楊康不僅騙了自己還利用了自己，更辜負了自己的信任。完顏洪烈本想讓楊康殺了穆念慈，但是楊康表示除了父母外穆念慈是世上最愛他之人，他無法殺了對方。
穆念慈徹底對楊康失望，她心灰意冷，割發斷情訣別楊康。完顏洪烈帶著楊康來到鐵掌幫，裘千仞聊起鐵掌幫起源，裘千仞本是江南人士，當年韓世忠將軍不肯依附當朝丞相秦檜，反對與金議和被朝廷削了兵權。韓世忠麾下猛將上官劍南是裘千仞的恩師，本就出身鐵掌幫的上官劍南後來重迴鐵掌幫繼任掌門。恩師效忠宋朝，卻不料奸臣當道，不辯忠良，才讓裘千仞認為這等朝廷何必再救。黃蓉和郭靖拿著鐵掌幫的令牌光明正大的來到鐵掌幫，兩人看到完顏洪烈等人已經來到鐵掌幫，決定先去鐵掌中峰取走武穆遺書。完顏洪烈擔心鐵掌幫並非真心歸順，讓楊康先行去探路，他們再去搜尋武穆遺書。楊康在山中尋找上山之路，但是中途卻因為闖入鐵掌幫禁地而被禁止入內。
黃蓉和郭靖來到鐵掌幫，他們見到裘千仞，黃蓉認錯裘千仞，不料身中鐵掌功口吐鮮血，眼見黃蓉受傷，郭靖連忙將其帶走。為了逃開追蹤之人，郭靖帶著黃蓉闖入鐵掌幫禁地為她療傷。卻不料在這裏碰到了裘千丈，黃蓉看透麵前之人才是與他們約定之日，而此前在山下碰到的才是真正的裘千仞。裘千丈隻好坦誠他們是孿生兄弟，而他真實姓名是裘千仗。幼時他與弟弟一起救了上官劍南的命，老幫主為了報答救命之恩決定教兩人武功，那時他體弱多病，功夫自然就傳給了裘千仞，而他也一事無成。黃蓉詢問裘千丈為何躲在此處，得知此地是曆任幫主的仙逝之地，藏有無數奇珍異寶，裘千丈才來此處尋找赴七日之約的防備武器。郭靖發現裘千丈藏有珍寶，也意外從他手中發現了武穆遺書。
完顏洪烈和楊康得知禁地有人闖入，他們猜測郭靖和黃蓉已經闖入禁地，本想讓裘千仞帶他們入內，但是裘千仞不願破幫中規矩，楊康為了避免內亂，提議放火攻山讓郭靖和黃蓉自行逃出。裘千仞放火燒山，黃蓉和郭靖等人被困山洞，幾人無奈隻能朝山頂走去，裘千丈也緊隨而來。麵臨懸崖邊，郭靖和黃蓉都以為即將命喪此地，郭靖的白雕唿喚而來，郭靖背著黃蓉借助白雕之力輕鬆躍下懸崖，裘千丈也學著郭靖跳下山崖，但因無法借力墜落懸崖。
鐵掌幫命人追來，郭靖隻能背著黃蓉前往瘴氣林，裘千仞等人無奈隻能止步瘴氣林外。黃蓉在瘴氣林中發現陣法，兩人走出陣法找到一木屋，兩人求助前往木屋暫時休息，在這裏碰到了神算子瑛姑。黃蓉看出瑛姑的算術之題答案，瑛姑也驚訝黃蓉的天資聰慧。裘千仞千裏傳音希望瑛姑幫忙尋找瘴氣林中的郭靖黃蓉，瑛姑質問郭靖黃蓉兩人身份，郭靖坦誠兩人是洪七公弟子，因為闖入鐵掌山被裘千仞所傷，瑛姑告訴裘千仞自己自會料理兩人。瑛姑為黃蓉把脈發現她被裘千仞的鐵掌功所傷，不出幾日就是大限。郭靖不滿瑛姑如此說法，本想帶黃蓉出去求醫，瑛姑不滿兩人隨便進出，兩人交手時瑛姑絕望發現自己十餘年苦練的武功還不如郭靖。
瑛姑道出黃蓉所受之傷如今世上隻有一人可以救，隻是那人肯不肯施救就不得而知了。在郭靖的懇求下，瑛姑給了兩人三個錦囊，臨別之際發現黃蓉是桃花島黃藥師之女，提醒她九花玉露丸雖是聖藥卻不可多服。郭靖帶著黃蓉離開瘴氣林，從錦囊中得知黃蓉所受之傷隻有段皇爺能救，兩人趕往桃源縣求見段皇爺。段皇爺得知黃蓉是黃藥師之女且也是洪七公之徒，看到她身受重傷同意幫她療傷，段皇爺耗盡畢生修為，施展絕學一陽指救治黃蓉，黃蓉感激對方救命之恩，拿出桃花島聖藥九花玉露丸贈送。不想段皇爺服用九花玉露丸後竟然中毒，段皇爺從郭靖黃蓉口中得知他們是因為瑛姑相告才找到自己，也猜出九花玉露丸是瑛姑暗中下毒，目的就是為了要毒害自己。段皇爺並未責怪兩人，隻當這是在了斷他和瑛姑之間的因果。
二十二年前，華山論劍之後，九陰真經歸於全真派王真人保管，王真人擔心無法防備西毒歐陽鋒搶奪九陰真經，來大理和他互傳一陽指，而陪同王真人前來大理的正是周伯通。周伯通閑來無事在皇宮遊蕩玩耍，在皇宮偶遇了劉貴妃，兩人來往之間突破禁忌。段皇爺看在王真人的麵上放過周伯通，警告周伯通再也不要再來大理。他也願意成全兩人放劉貴妃離開，但是周伯通不知對方貴妃身份，更後悔自己所作所為，道歉後匆忙離開大理。後來瑛姑在書房獨自生下一男孩，後來孩子被人所傷，瑛姑前來求段皇爺救人，但是段皇爺最終沒救孩子，後來因為愧對瑛姑將皇位傳給段家人之後出家為僧。雖然瑛姑的孩子不是段皇爺所殺，但也確實是因為他的嫉妒和冷漠而死，兩人的恩怨一直是困擾段皇爺的心結，如今也算可以解開。瑛姑午夜前來尋段皇爺尋仇，郭靖現身勸說瑛姑放過段皇爺，眼見瑛姑不聽勸說，郭靖隻能動手阻攔瑛姑動手殺人。卻不料段皇爺用一陽指困住郭靖，這些年他一直等著瑛姑前來，就怕等不到瑛姑來了解這段因果。段皇爺讓瑛姑親手了解自己，但是瑛姑想到這些年來段皇爺對自己的好，還是不忍親手殺了對方。
裘千仞追隨而來，瑛姑意外發現裘千仞的笑聲和當年殺了自己兒子的笑聲一致，才知道當年是裘千仞殺了自己兒子。當年裘千仞為了華山論劍少一個對手，才動手傷了孩子，希望段皇爺救孩子而耗盡修為。瑛姑想要殺了裘千仞但是卻不是對方對手，裘千仞不僅傷了瑛姑，更感謝對方讓黃蓉前來求醫，不僅讓段皇爺中了毒更耗盡了真氣。
郭靖黃蓉現身阻攔裘千仞殺害瑛姑，裘千仞更是動了心思想要殺了黃蓉亂了黃藥師的心智，到時候華山論劍他就能再少一個對手。黃蓉知道郭靖難以傷了郭靖，隻能和他聯手戲弄裘千仞，讓對方有所提防，而段皇爺現身讓裘千仞以為對方功力尚在，裘千仞隻能暫時離開。瑛姑已經放棄尋段皇爺尋仇，隻求對方能日夜為自己死去的孩子超度。瑛姑意外從黃蓉口中得知周伯通已經出島，勸說瑛姑留著性命去尋周伯通，和對方一起去殺裘千仞。九陰真經最後幾章是梵文，郭靖得知九陰真經或許可以幫助段皇爺療傷，主動默寫下九陰真經，助段皇爺療傷。段皇爺也答應幫忙翻譯梵文，待他研究好也會傳授郭靖黃蓉兩人。
金人節節敗退，完顏洪烈收到六道密旨密令催他迴朝，若是還不能拿到武穆遺書扭轉敗局，聖上大怒他和楊康父子也沒有好日子過。楊康表示江湖高手都會在八月十五前往嘉興醉仙樓比武，郭靖和江南七怪一定會前往，楊康表示這是他們奪迴武穆遺書最後的機會。
江南七怪知道全真教和黃藥師之間的誤會，為了江湖不起紛爭，幾人前往桃花島去尋黃藥師解釋此事。江南七怪來到桃花島，但因為黃藥師不想見幾人，他們隻能被困在桃花島大陣中無法找到黃藥師。段皇爺照著九陰真經的功法修煉，或許用一個月就能有五年之功，他將功法交給郭靖，讓郭靖轉交洪七公修煉，或許能讓洪七公打通奇經八脈恢複武功。郭靖和黃蓉辭別段皇爺前去尋師父洪七公，
洪七公讓郭靖和黃蓉迴桃花島問清事情真相，柯鎮惡這裏有他和周伯通看顧，郭靖臨別之前將段皇爺翻譯的九陰真經交給洪七公，讓洪七公修煉此功來修複奇經八脈恢複功夫。
郭靖和黃蓉來到桃花島，在黃蓉母親的墓地發現了江南五怪其他師父們的遺體，黃蓉遍尋島上沒有發現爹爹黃藥師的蹤跡，郭靖懷疑是黃藥師用九陰白骨爪殺了他的師父們，黃蓉認為黃藥師如今生死未知，郭靖憑什麽遷罪於自己爹爹。黃蓉希望郭靖能冷靜一些，待找到黃藥師之後再下定論。情緒崩潰的郭靖想要親手將師父們埋葬，恰在此時他聽到是四師父的聲音，瘋癲的四師父臨終前恢複神誌，本想告訴郭靖誰是害死他們的兇手，但最終未能給出完整信息，郭靖卻認定殺人兇手就是黃藥師。郭靖雖然知道黃蓉無辜，但是如今她是自己的仇人之女，郭靖無法再和黃蓉在一起。
黃蓉拿出島上的醉生夢死酒，讓郭靖喝過酒後忘記自己，去尋她爹爹報仇，甚至迴草原做金刀駙馬。郭靖表示如果有一天自己死於黃藥師之手，也希望黃蓉不要難過。郭靖埋葬好師父們，與黃蓉斷情打算就此離開桃花島。郭靖離島時碰上全真教等人，全真教等人得知江南五怪慘死桃花島，也準備去尋黃藥師報仇。
全真教廣發英雄帖約黃藥師一戰，黃藥師得信後來赴約，但是全真七子壓根不是黃藥師的對手，柯鎮惡也來為兄弟們報仇，洪七公攔住郭靖，表示黃藥師不是濫殺無辜之人，如今能不殺柯鎮惡和全真教之人，說明他並非是殺害江南五怪得兇手，如今郭靖氣怒之下不願相信，始終將黃藥師視為仇敵。郭靖補上天罡北鬥陣，聯手全真七子向黃藥師報仇，黃藥師不懼幾人，馬鈺質問黃藥師可曾殺害譚師弟和周伯通師叔，黃藥師不屑解釋，郭靖卻出麵告訴眾人譚道長死於歐陽鋒之手，而周伯通也沒有死。如今全真教與黃藥師的仇也算了了，郭靖打算單獨和黃藥師算師父們的仇，黃藥師並不承認殺了江南五怪，黃蓉來此為爹爹解釋，她知道黃藥師不會殺了江南五怪。洪七公出麵勸說眾人暫時休戰，莫要讓外人看中原武林的笑話。
洪七公不相信黃藥師殺了江南五怪，勸說郭靖將此事查清楚，而黃藥師也到此時才得知有人趁他不在桃花島將江南五怪盡數殺了誣陷自己。完顏洪烈、歐陽鋒帶著楊康等人來到醉仙樓，丘處機要殺了楊康這個認賊作父之人，全真七子和歐陽鋒相對，郭靖在黃蓉的有意激將之下，也下場同全真七子一同作戰。楊康和王府四大高手聯手對付柯鎮惡，眼見柯鎮惡受傷，黃蓉現身救下柯鎮惡。
郭靖與歐陽鋒對陣中途周伯通也趕來相助，周伯通看到歐陽鋒欺負全真教師侄和郭靖，卻不想歐陽鋒壓根不願和他對陣，直接退場離開。隨後完顏洪烈命令金兵圍攻眾人，大家隻好暫時躲進醉仙樓。楊康逼迫郭靖交出武穆遺書，郭靖不願連累大家，準備自己出去周旋，讓馬鈺道長帶著武穆遺書和大家離開此處。黃蓉不舍郭靖出去送死，全真教也願意留下相助，黃藥師索性提議和洪七公一同出去對陣，不想柯鎮惡提出新的辦法能救大家出去。
楊康將藏有武穆遺書線索的畫交給完顏洪烈，得知此書在鐵掌峰，完顏洪烈大為開心。一直以來丐幫都是金人南攻的阻力，楊康表示如果讓丐幫整體南遷，或許能他們省去很多麻煩。楊康表示待自己接任丐幫幫主之位後會安排此事。歐陽鋒前來尋楊康找歐陽克，他重返牛家村未能找到歐陽克身影，就連平日聯係的線索也消失，歐陽鋒氣怒下認為完顏洪烈沒有護好歐陽克，本想出手殺人，楊康出麵表示是郭靖殺了歐陽克。
楊康告訴歐陽鋒如今郭靖和黃蓉就在他手中，而他即將接任丐幫幫主之位，隻恨自己身無長處如履薄冰，希望能拜入歐陽鋒手下習得本事一統丐幫。楊康穆念慈在丐幫舉辦婚禮成為夫妻，穆念慈一身紅衣在新房等待楊康，他讓楊康先去參加丐幫大會，而她會在房內等著楊康。彭長老在丐幫大會上將洪七公身死的消息公布於眾，而楊康也現身丐幫眾人麵前，將洪七公之死誣陷給了黃藥師、黃蓉和郭靖。魯有腳不相信楊康所言，認為洪七公和黃藥師交好，不會對彼此痛下殺手。淨衣派長老希望讓手持打狗棒的楊康接任丐幫幫主之位，但是汙衣派之人認為洪七公此前有意讓魯有腳長老接任丐幫，兩方爭執不斷，但因為楊康有洪七公遺命，且手持打狗棒，汙衣幫也隻能承認楊康的幫主之位。
楊康登上軒轅台成功接任丐幫幫主之位，隨後他命人將郭靖和黃蓉帶到眾人麵前，指認兩人殺害洪七公，還表示今日要殺了兩人為洪七公報仇。魯有腳等人並不相信郭靖和黃蓉會殺害洪七公，希望楊康能明察此事。郭靖和黃蓉被點了啞穴，楊康以黃蓉性命威脅，逼迫郭靖承認他的問話。
眼見郭靖和黃蓉即將命喪丐幫之手，鐵掌幫前來拜見入山，魯有腳趁機勸說楊康暫時將郭靖和黃蓉關押，待接待完鐵掌幫後再行處理。裘千仞帶人前來丐幫，得知今日丐幫新任丐幫繼位，他帶來無數珍寶特來借花獻佛。裘千仞表示這些珍寶是金人六王爺所贈，勸說丐幫幫眾南遷，楊康也同意丐幫南遷，但是魯有腳認為丐幫的北方基業不能輕易割舍，而金人的禮物更是不能收取。淨衣派聽從楊康命令，但是魯有腳堅決不撤離北方，而丐幫部分人也誓死不做叛賊。
裘千仞眼見無法成事，出手殺了兩名丐幫之人示眾。郭靖觀星變化意外領悟北鬥七星奧義，借此融會貫通最終煉成了九陰真經，他以功力重開束縛，隨後救出黃蓉前往丐幫大會。裘千仞本要殺了誓死不願南遷的魯有腳，郭靖現身救下魯有腳，裘千仞對陣郭靖發現此人功夫了得，而他眼見就要華山論劍，不欲與郭靖多加比試。他沒有聽從楊康安排選擇帶人離開丐幫。原來在此之前真正的裘千仞讓弟弟裘千丈冒充自己去解決蒙古使團，而因為丐幫一行要動手，他才親身前往此地。
楊康讓彭長老帶人圍攻郭靖和黃蓉，勢必要殺了郭靖和黃蓉，郭靖助黃蓉逃出丐幫之人圍困，黃蓉以丐幫武學奪迴楊康手中的打狗棒，並告知丐幫之人洪七公並未歸天，而是楊康在此故意造謠。黃蓉手持打狗棒，告訴丐幫眾人她才是洪七公欽點的丐幫傳人。黃蓉告訴大家楊康其實姓完顏，是大金趙王爺的兒子，是來奪權滅宋之人。黃蓉所說楊康之事丐幫中的彭長老等人不信，黃蓉索性拿出鐵掌令，表示這是從楊康身上所拿，證明楊康就是金人的走狗。楊康眼見黃蓉壞自己謀劃，下手暗算黃蓉，幸虧黃蓉身著軟蝟甲才逃過一劫。
黃蓉為了證明自己才是洪七公親傳的丐幫弟子，她施展打狗棒法教訓楊康，雖然魯有腳認為這就是正宗的打狗棒法，但是彭長老依然不願承認。隨後彭長老等人提出如果黃蓉用打狗棒法勝過三人，他們就承認黃蓉的丐幫幫主身份。黃蓉以一敵三，成功用打狗棒法打敗彭長老三人，三人也最終承認了她的幫主身份。
彭長老假意臣服，卻想蠱惑黃蓉趁機害她，幸虧郭靖反應及時打傷彭長老，才讓黃蓉免於受傷。黃蓉安排簡長老、梁長老率弟子東下臨安迎接洪七公，讓魯長老安葬餘、黎兩位兄弟，還表示自己不在丐幫之時幫中一切事務由魯長老暫代。楊康趁亂逃走，為了不讓穆念慈得知真相，他偷偷將點昏穆念慈將其帶走。黃蓉和郭靖在街上看到裘千仞坑蒙拐騙，但此時兩人並不知此人其實是裘千丈而非裘千仞。裘千丈看到兩人本想逃走卻被抓個正著，黃蓉出手教訓了裘千丈一頓，裘千丈再次假裝腹中不適，眼見黃蓉不信自己，更是無恥的當眾脫褲子，郭靖氣怒出手教訓裘千丈，而裘千丈則故意與郭靖相約七日之後相約鐵掌山下較量。黃蓉和郭靖想到武穆遺書還藏在鐵掌山，欣然同意應約。
穆念慈醒來發現楊康前去丐幫的一切所作所為都是為了大金，她氣怒之下想要殺了完顏洪烈，楊康發現後及時阻攔。穆念慈失望楊康不僅騙了自己還利用了自己，更辜負了自己的信任。完顏洪烈本想讓楊康殺了穆念慈，但是楊康表示除了父母外穆念慈是世上最愛他之人，他無法殺了對方。
穆念慈徹底對楊康失望，她心灰意冷，割發斷情訣別楊康。完顏洪烈帶著楊康來到鐵掌幫，裘千仞聊起鐵掌幫起源，裘千仞本是江南人士，當年韓世忠將軍不肯依附當朝丞相秦檜，反對與金議和被朝廷削了兵權。韓世忠麾下猛將上官劍南是裘千仞的恩師，本就出身鐵掌幫的上官劍南後來重迴鐵掌幫繼任掌門。恩師效忠宋朝，卻不料奸臣當道，不辯忠良，才讓裘千仞認為這等朝廷何必再救。黃蓉和郭靖拿著鐵掌幫的令牌光明正大的來到鐵掌幫，兩人看到完顏洪烈等人已經來到鐵掌幫，決定先去鐵掌中峰取走武穆遺書。完顏洪烈擔心鐵掌幫並非真心歸順，讓楊康先行去探路，他們再去搜尋武穆遺書。楊康在山中尋找上山之路，但是中途卻因為闖入鐵掌幫禁地而被禁止入內。
黃蓉和郭靖來到鐵掌幫，他們見到裘千仞，黃蓉認錯裘千仞，不料身中鐵掌功口吐鮮血，眼見黃蓉受傷，郭靖連忙將其帶走。為了逃開追蹤之人，郭靖帶著黃蓉闖入鐵掌幫禁地為她療傷。卻不料在這裏碰到了裘千丈，黃蓉看透麵前之人才是與他們約定之日，而此前在山下碰到的才是真正的裘千仞。裘千丈隻好坦誠他們是孿生兄弟，而他真實姓名是裘千仗。幼時他與弟弟一起救了上官劍南的命，老幫主為了報答救命之恩決定教兩人武功，那時他體弱多病，功夫自然就傳給了裘千仞，而他也一事無成。黃蓉詢問裘千丈為何躲在此處，得知此地是曆任幫主的仙逝之地，藏有無數奇珍異寶，裘千丈才來此處尋找赴七日之約的防備武器。郭靖發現裘千丈藏有珍寶，也意外從他手中發現了武穆遺書。
完顏洪烈和楊康得知禁地有人闖入，他們猜測郭靖和黃蓉已經闖入禁地，本想讓裘千仞帶他們入內，但是裘千仞不願破幫中規矩，楊康為了避免內亂，提議放火攻山讓郭靖和黃蓉自行逃出。裘千仞放火燒山，黃蓉和郭靖等人被困山洞，幾人無奈隻能朝山頂走去，裘千丈也緊隨而來。麵臨懸崖邊，郭靖和黃蓉都以為即將命喪此地，郭靖的白雕唿喚而來，郭靖背著黃蓉借助白雕之力輕鬆躍下懸崖，裘千丈也學著郭靖跳下山崖，但因無法借力墜落懸崖。
鐵掌幫命人追來，郭靖隻能背著黃蓉前往瘴氣林，裘千仞等人無奈隻能止步瘴氣林外。黃蓉在瘴氣林中發現陣法，兩人走出陣法找到一木屋，兩人求助前往木屋暫時休息，在這裏碰到了神算子瑛姑。黃蓉看出瑛姑的算術之題答案，瑛姑也驚訝黃蓉的天資聰慧。裘千仞千裏傳音希望瑛姑幫忙尋找瘴氣林中的郭靖黃蓉，瑛姑質問郭靖黃蓉兩人身份，郭靖坦誠兩人是洪七公弟子，因為闖入鐵掌山被裘千仞所傷，瑛姑告訴裘千仞自己自會料理兩人。瑛姑為黃蓉把脈發現她被裘千仞的鐵掌功所傷，不出幾日就是大限。郭靖不滿瑛姑如此說法，本想帶黃蓉出去求醫，瑛姑不滿兩人隨便進出，兩人交手時瑛姑絕望發現自己十餘年苦練的武功還不如郭靖。
瑛姑道出黃蓉所受之傷如今世上隻有一人可以救，隻是那人肯不肯施救就不得而知了。在郭靖的懇求下，瑛姑給了兩人三個錦囊，臨別之際發現黃蓉是桃花島黃藥師之女，提醒她九花玉露丸雖是聖藥卻不可多服。郭靖帶著黃蓉離開瘴氣林，從錦囊中得知黃蓉所受之傷隻有段皇爺能救，兩人趕往桃源縣求見段皇爺。段皇爺得知黃蓉是黃藥師之女且也是洪七公之徒，看到她身受重傷同意幫她療傷，段皇爺耗盡畢生修為，施展絕學一陽指救治黃蓉，黃蓉感激對方救命之恩，拿出桃花島聖藥九花玉露丸贈送。不想段皇爺服用九花玉露丸後竟然中毒，段皇爺從郭靖黃蓉口中得知他們是因為瑛姑相告才找到自己，也猜出九花玉露丸是瑛姑暗中下毒，目的就是為了要毒害自己。段皇爺並未責怪兩人，隻當這是在了斷他和瑛姑之間的因果。
二十二年前，華山論劍之後，九陰真經歸於全真派王真人保管，王真人擔心無法防備西毒歐陽鋒搶奪九陰真經，來大理和他互傳一陽指，而陪同王真人前來大理的正是周伯通。周伯通閑來無事在皇宮遊蕩玩耍，在皇宮偶遇了劉貴妃，兩人來往之間突破禁忌。段皇爺看在王真人的麵上放過周伯通，警告周伯通再也不要再來大理。他也願意成全兩人放劉貴妃離開，但是周伯通不知對方貴妃身份，更後悔自己所作所為，道歉後匆忙離開大理。後來瑛姑在書房獨自生下一男孩，後來孩子被人所傷，瑛姑前來求段皇爺救人，但是段皇爺最終沒救孩子，後來因為愧對瑛姑將皇位傳給段家人之後出家為僧。雖然瑛姑的孩子不是段皇爺所殺，但也確實是因為他的嫉妒和冷漠而死，兩人的恩怨一直是困擾段皇爺的心結，如今也算可以解開。瑛姑午夜前來尋段皇爺尋仇，郭靖現身勸說瑛姑放過段皇爺，眼見瑛姑不聽勸說，郭靖隻能動手阻攔瑛姑動手殺人。卻不料段皇爺用一陽指困住郭靖，這些年他一直等著瑛姑前來，就怕等不到瑛姑來了解這段因果。段皇爺讓瑛姑親手了解自己，但是瑛姑想到這些年來段皇爺對自己的好，還是不忍親手殺了對方。
裘千仞追隨而來，瑛姑意外發現裘千仞的笑聲和當年殺了自己兒子的笑聲一致，才知道當年是裘千仞殺了自己兒子。當年裘千仞為了華山論劍少一個對手，才動手傷了孩子，希望段皇爺救孩子而耗盡修為。瑛姑想要殺了裘千仞但是卻不是對方對手，裘千仞不僅傷了瑛姑，更感謝對方讓黃蓉前來求醫，不僅讓段皇爺中了毒更耗盡了真氣。
郭靖黃蓉現身阻攔裘千仞殺害瑛姑，裘千仞更是動了心思想要殺了黃蓉亂了黃藥師的心智，到時候華山論劍他就能再少一個對手。黃蓉知道郭靖難以傷了郭靖，隻能和他聯手戲弄裘千仞，讓對方有所提防，而段皇爺現身讓裘千仞以為對方功力尚在，裘千仞隻能暫時離開。瑛姑已經放棄尋段皇爺尋仇，隻求對方能日夜為自己死去的孩子超度。瑛姑意外從黃蓉口中得知周伯通已經出島，勸說瑛姑留著性命去尋周伯通，和對方一起去殺裘千仞。九陰真經最後幾章是梵文，郭靖得知九陰真經或許可以幫助段皇爺療傷，主動默寫下九陰真經，助段皇爺療傷。段皇爺也答應幫忙翻譯梵文，待他研究好也會傳授郭靖黃蓉兩人。
金人節節敗退，完顏洪烈收到六道密旨密令催他迴朝，若是還不能拿到武穆遺書扭轉敗局，聖上大怒他和楊康父子也沒有好日子過。楊康表示江湖高手都會在八月十五前往嘉興醉仙樓比武，郭靖和江南七怪一定會前往，楊康表示這是他們奪迴武穆遺書最後的機會。
江南七怪知道全真教和黃藥師之間的誤會，為了江湖不起紛爭，幾人前往桃花島去尋黃藥師解釋此事。江南七怪來到桃花島，但因為黃藥師不想見幾人，他們隻能被困在桃花島大陣中無法找到黃藥師。段皇爺照著九陰真經的功法修煉，或許用一個月就能有五年之功，他將功法交給郭靖，讓郭靖轉交洪七公修煉，或許能讓洪七公打通奇經八脈恢複武功。郭靖和黃蓉辭別段皇爺前去尋師父洪七公，
洪七公讓郭靖和黃蓉迴桃花島問清事情真相，柯鎮惡這裏有他和周伯通看顧，郭靖臨別之前將段皇爺翻譯的九陰真經交給洪七公，讓洪七公修煉此功來修複奇經八脈恢複功夫。
郭靖和黃蓉來到桃花島，在黃蓉母親的墓地發現了江南五怪其他師父們的遺體，黃蓉遍尋島上沒有發現爹爹黃藥師的蹤跡，郭靖懷疑是黃藥師用九陰白骨爪殺了他的師父們，黃蓉認為黃藥師如今生死未知，郭靖憑什麽遷罪於自己爹爹。黃蓉希望郭靖能冷靜一些，待找到黃藥師之後再下定論。情緒崩潰的郭靖想要親手將師父們埋葬，恰在此時他聽到是四師父的聲音，瘋癲的四師父臨終前恢複神誌，本想告訴郭靖誰是害死他們的兇手，但最終未能給出完整信息，郭靖卻認定殺人兇手就是黃藥師。郭靖雖然知道黃蓉無辜，但是如今她是自己的仇人之女，郭靖無法再和黃蓉在一起。
黃蓉拿出島上的醉生夢死酒，讓郭靖喝過酒後忘記自己，去尋她爹爹報仇，甚至迴草原做金刀駙馬。郭靖表示如果有一天自己死於黃藥師之手，也希望黃蓉不要難過。郭靖埋葬好師父們，與黃蓉斷情打算就此離開桃花島。郭靖離島時碰上全真教等人，全真教等人得知江南五怪慘死桃花島，也準備去尋黃藥師報仇。
全真教廣發英雄帖約黃藥師一戰，黃藥師得信後來赴約，但是全真七子壓根不是黃藥師的對手，柯鎮惡也來為兄弟們報仇，洪七公攔住郭靖，表示黃藥師不是濫殺無辜之人，如今能不殺柯鎮惡和全真教之人，說明他並非是殺害江南五怪得兇手，如今郭靖氣怒之下不願相信，始終將黃藥師視為仇敵。郭靖補上天罡北鬥陣，聯手全真七子向黃藥師報仇，黃藥師不懼幾人，馬鈺質問黃藥師可曾殺害譚師弟和周伯通師叔，黃藥師不屑解釋，郭靖卻出麵告訴眾人譚道長死於歐陽鋒之手，而周伯通也沒有死。如今全真教與黃藥師的仇也算了了，郭靖打算單獨和黃藥師算師父們的仇，黃藥師並不承認殺了江南五怪，黃蓉來此為爹爹解釋，她知道黃藥師不會殺了江南五怪。洪七公出麵勸說眾人暫時休戰，莫要讓外人看中原武林的笑話。
洪七公不相信黃藥師殺了江南五怪，勸說郭靖將此事查清楚，而黃藥師也到此時才得知有人趁他不在桃花島將江南五怪盡數殺了誣陷自己。完顏洪烈、歐陽鋒帶著楊康等人來到醉仙樓，丘處機要殺了楊康這個認賊作父之人，全真七子和歐陽鋒相對，郭靖在黃蓉的有意激將之下，也下場同全真七子一同作戰。楊康和王府四大高手聯手對付柯鎮惡，眼見柯鎮惡受傷，黃蓉現身救下柯鎮惡。
郭靖與歐陽鋒對陣中途周伯通也趕來相助，周伯通看到歐陽鋒欺負全真教師侄和郭靖，卻不想歐陽鋒壓根不願和他對陣，直接退場離開。隨後完顏洪烈命令金兵圍攻眾人，大家隻好暫時躲進醉仙樓。楊康逼迫郭靖交出武穆遺書，郭靖不願連累大家，準備自己出去周旋，讓馬鈺道長帶著武穆遺書和大家離開此處。黃蓉不舍郭靖出去送死，全真教也願意留下相助，黃藥師索性提議和洪七公一同出去對陣，不想柯鎮惡提出新的辦法能救大家出去。