總部在濟州島的海軍陸戰軍也與陸軍野戰軍一樣，擴編為五萬三千人，也下轄的四個師和軍部直屬旅。其中，騎兵師與軍部直屬旅駐紮在濟州島，重型師駐紮在流求島，輕型師駐紮在瓊州島，機動師駐紮在小流求。由於作戰任務的特殊性，海軍陸戰軍的大型裝備數量甚至還要超過陸軍野戰軍，並配備了大量的運輸船，戰時還可以征調民商船幫助運輸。就訓練強度而言，海軍陸戰軍士兵的甚至更大，他們不僅要進行與陸戰訓練，還要進行搶灘登陸、武裝泅渡等專項訓練。
按照《海軍發展綱要》的造艦計劃，霹靂軍的每支艦隊應裝備五艘崇慶府級、二十艘邛州級和四十艘大邑級火炮戰艦，共計六十五艘主力戰艦。除火炮戰艦之外，還應配備大量的偵察船、護衛船、爆破船、火戰船等他戰船，以及工程船、醫療船、維修船、糧水補給船、彈藥補給船、兵馬運輸船等輔助船隻，數量總計四百艘左右。按照《綱要》，霹靂軍的每支艦隊船隻數量為五百艘左右，水兵配備二萬人，六支艦隊應有四百艘主力戰艦，其它各型船隻三千艘以上。
截止到霹靂十五年春，霹靂軍海軍共隻有二百二十艘主力戰艦，完成了《綱要》進度的百分之四十四，其它各型船隻二千餘艘，完成進度為三分之二。從各支艦隊的進度來看，南洋艦隊船隻數量最多，其中主力戰艦有五十五艘，輔助船隻三百餘艘，水兵達到了一萬五千人。次之的是西洋艦隊，有主力戰船四十八艘，其它船隻二百餘艘，有水兵一萬二千人。實際上，西洋艦隊的戰艦曾一度達到了《綱要》規定的九成，但在頻繁的征戰與風暴中損失不少，最終維持在了當前規模。西洋艦隊轄區麵積廣大，東至錫蘭，西至黑人大陸西海岸的財富群島，該片海域風高浪急，加上有不少敵對勢力和海盜，需要不斷出動戰船進行巡邏、清剿和威懾，出現損失實屬正常。
由於牢牢掌握了製海權，加之將精力投到了海情複雜，又能帶來大量利潤和戰略物資的南洋、西洋方向，霹靂軍一度對北海、東海、南海三支近海艦隊的建設投入不足。眼下這三支艦隊的規模則剛過《綱要》的五成，雖然輔助船隻則達到了八成以上，水兵數量也達到了七成，但主力戰艦都不超過三十艘，總戰艦滿編率也在四成上下，這還是霹靂十三年時，歐陽軒眼見苗頭不對，當即下達措詞嚴厲的命令，要求優先保障這三支艦隊建設的結果。在歐陽軒看來，霹靂軍高層內部存在一種錯誤思想，即偏愛能帶來財富的西洋、南洋艦隊，而忽視了近海艦隊建設，忘記了抗蒙才是霹靂軍最重要的任務。在歐陽軒的計劃中，這三支近海艦隊將發揮至關重要的作用。
至於霹靂軍在新大陸西岸、新大陸東岸的兩支遠洋艦隊，離《綱要》要求的差距離更大。西岸艦隊目前主要戰艦隻有十七艘，其它船隻一百餘艘。由於地峽所阻，東岸艦隊的建設屬於白手起家，實力更為孱弱，實力尚不及西洋艦隊的一支分艦隊，目前隻有一艘邛州級戰艦、一艘大邑級戰艦、三艘輕護船，這些船隻還是從新蜀州南下，不遠萬裏繞過羊駝大陸最南端的風暴海峽，到達地峽另一端的東岸艦隊海軍基地的。目前餘福主政的地峽省已修通了從新蜀州通往東岸的道路，並在東岸修建了造船廠，但囿於原材料和技術人員不足，目前隻造出了十餘艘輔助船隻。東、西兩岸海軍建設進度緩慢，歸根到底還是因為新大陸並無海上威脅，當下霹靂軍在當地的海上力量，已是無敵的存在，並無建設的緊迫性，故並沒有大規模投入資源。
相對於陸軍的擴軍備戰來說，海上力量的建設並不令歐陽軒滿意，隻不過他也無可奈何，心知這事急不得。大規模建設陸軍相對容易，隻要有兵員與資金，幾年便能迅速成軍。海軍不同於陸軍，是資金與技術密集性的兵種，不僅非常燒錢，也極度依賴有經驗的水手和航海人才，更依賴性能優良的船隻。建造船隻不僅需要技術人員，更重要的是要有造船的良木。霹靂軍治下不缺乏木材，流求、濟州、瓊州這三個造船基地也有大片的森林，還可以從鮮卑利亞和南洋諸國運迴諸多良木，理論上不缺造船的木材。可當下製約海軍建設的最大問題，卻正是木材。
造船所用的木材有著嚴格的質量要求，對樹種、長度、高度、生長年限都有要求，製造大型軍艦的要求更為嚴格。實際上，如果僅僅是以上要求，對霹靂軍並不是問題，畢竟霹靂軍治下並不缺乏優良的木材，也有充足的資金購買。真正的問題在於，砍伐下來的良木需要經過長時間的晾曬幹燥，才能用於造船，否則容易船體開裂，也極易生蟲腐爛，最終釀成海難事故。流求科學院當下已經研究出新方法，大大縮短了晾曬幹燥造船木材的新方法，但仍需二年以上。無奈之下，餘柱隻得下令各商貿公司，全力收購可以立即用於造船的良木，隻不過效果不佳。不管是蒙古人還是臨安方麵，也在大力發展水軍，已將造船的良木作為了管製物資。
製約艦隊建設的另一個因素是人才，包括造船工匠和經驗豐富的水手。霹靂軍海軍擴張過快，造成這兩類人員的嚴重短缺。為此霹靂軍同時推出了三個措施。第一是擴大流求航海學校的規模，並在濟州和瓊州島建立航海分校，加速這兩類人員的培養。第二是提升這兩類人員的待遇，以吸引人才流入，同時從臨安治下、北方漢地、高麗、倭國、南洋甚至西洋的天竺、大食、波斯招募造船技師。第三是從俘虜中挑選有一技之長的工匠和水手。霹靂軍艦隊在打擊敵對勢力和海盜過程中，抓獲了不少海盜。這些俘虜為了不服苦役或被流放，倒是十分踴躍為霹靂軍效力。
相比較於木材和水手，作為主戰武器的火炮對艦隊的影響便比較小了，如果全速生產，其產能跟得上戰艦建造的速度。得益於冶煉、火藥和車床技術的不斷改進，霹靂軍的艦用火炮不斷改進，不僅威力變大，後座力和重量也減輕不少，目前已形成了彈重5斤、10斤、20斤、40斤、80斤的火炮係列，彈種包括破甲彈、***、霰彈、鏈球彈、***等彈種。以發射40斤炮彈的重型艦炮為例，該型火炮配置在崇慶府、邛州和大邑這三級主力戰艦上，其最大射程能達十裏，能對敵人的大型戰船一發入魂。如果使用實心炮彈，能對敵人的城門、箭樓等重要設施造成嚴重的破壞。
按照《海軍發展綱要》的造艦計劃，霹靂軍的每支艦隊應裝備五艘崇慶府級、二十艘邛州級和四十艘大邑級火炮戰艦，共計六十五艘主力戰艦。除火炮戰艦之外，還應配備大量的偵察船、護衛船、爆破船、火戰船等他戰船，以及工程船、醫療船、維修船、糧水補給船、彈藥補給船、兵馬運輸船等輔助船隻，數量總計四百艘左右。按照《綱要》，霹靂軍的每支艦隊船隻數量為五百艘左右，水兵配備二萬人，六支艦隊應有四百艘主力戰艦，其它各型船隻三千艘以上。
截止到霹靂十五年春，霹靂軍海軍共隻有二百二十艘主力戰艦，完成了《綱要》進度的百分之四十四，其它各型船隻二千餘艘，完成進度為三分之二。從各支艦隊的進度來看，南洋艦隊船隻數量最多，其中主力戰艦有五十五艘，輔助船隻三百餘艘，水兵達到了一萬五千人。次之的是西洋艦隊，有主力戰船四十八艘，其它船隻二百餘艘，有水兵一萬二千人。實際上，西洋艦隊的戰艦曾一度達到了《綱要》規定的九成，但在頻繁的征戰與風暴中損失不少，最終維持在了當前規模。西洋艦隊轄區麵積廣大，東至錫蘭，西至黑人大陸西海岸的財富群島，該片海域風高浪急，加上有不少敵對勢力和海盜，需要不斷出動戰船進行巡邏、清剿和威懾，出現損失實屬正常。
由於牢牢掌握了製海權，加之將精力投到了海情複雜，又能帶來大量利潤和戰略物資的南洋、西洋方向，霹靂軍一度對北海、東海、南海三支近海艦隊的建設投入不足。眼下這三支艦隊的規模則剛過《綱要》的五成，雖然輔助船隻則達到了八成以上，水兵數量也達到了七成，但主力戰艦都不超過三十艘，總戰艦滿編率也在四成上下，這還是霹靂十三年時，歐陽軒眼見苗頭不對，當即下達措詞嚴厲的命令，要求優先保障這三支艦隊建設的結果。在歐陽軒看來，霹靂軍高層內部存在一種錯誤思想，即偏愛能帶來財富的西洋、南洋艦隊，而忽視了近海艦隊建設，忘記了抗蒙才是霹靂軍最重要的任務。在歐陽軒的計劃中，這三支近海艦隊將發揮至關重要的作用。
至於霹靂軍在新大陸西岸、新大陸東岸的兩支遠洋艦隊，離《綱要》要求的差距離更大。西岸艦隊目前主要戰艦隻有十七艘，其它船隻一百餘艘。由於地峽所阻，東岸艦隊的建設屬於白手起家，實力更為孱弱，實力尚不及西洋艦隊的一支分艦隊，目前隻有一艘邛州級戰艦、一艘大邑級戰艦、三艘輕護船，這些船隻還是從新蜀州南下，不遠萬裏繞過羊駝大陸最南端的風暴海峽，到達地峽另一端的東岸艦隊海軍基地的。目前餘福主政的地峽省已修通了從新蜀州通往東岸的道路，並在東岸修建了造船廠，但囿於原材料和技術人員不足，目前隻造出了十餘艘輔助船隻。東、西兩岸海軍建設進度緩慢，歸根到底還是因為新大陸並無海上威脅，當下霹靂軍在當地的海上力量，已是無敵的存在，並無建設的緊迫性，故並沒有大規模投入資源。
相對於陸軍的擴軍備戰來說，海上力量的建設並不令歐陽軒滿意，隻不過他也無可奈何，心知這事急不得。大規模建設陸軍相對容易，隻要有兵員與資金，幾年便能迅速成軍。海軍不同於陸軍，是資金與技術密集性的兵種，不僅非常燒錢，也極度依賴有經驗的水手和航海人才，更依賴性能優良的船隻。建造船隻不僅需要技術人員，更重要的是要有造船的良木。霹靂軍治下不缺乏木材，流求、濟州、瓊州這三個造船基地也有大片的森林，還可以從鮮卑利亞和南洋諸國運迴諸多良木，理論上不缺造船的木材。可當下製約海軍建設的最大問題，卻正是木材。
造船所用的木材有著嚴格的質量要求，對樹種、長度、高度、生長年限都有要求，製造大型軍艦的要求更為嚴格。實際上，如果僅僅是以上要求，對霹靂軍並不是問題，畢竟霹靂軍治下並不缺乏優良的木材，也有充足的資金購買。真正的問題在於，砍伐下來的良木需要經過長時間的晾曬幹燥，才能用於造船，否則容易船體開裂，也極易生蟲腐爛，最終釀成海難事故。流求科學院當下已經研究出新方法，大大縮短了晾曬幹燥造船木材的新方法，但仍需二年以上。無奈之下，餘柱隻得下令各商貿公司，全力收購可以立即用於造船的良木，隻不過效果不佳。不管是蒙古人還是臨安方麵，也在大力發展水軍，已將造船的良木作為了管製物資。
製約艦隊建設的另一個因素是人才，包括造船工匠和經驗豐富的水手。霹靂軍海軍擴張過快，造成這兩類人員的嚴重短缺。為此霹靂軍同時推出了三個措施。第一是擴大流求航海學校的規模，並在濟州和瓊州島建立航海分校，加速這兩類人員的培養。第二是提升這兩類人員的待遇，以吸引人才流入，同時從臨安治下、北方漢地、高麗、倭國、南洋甚至西洋的天竺、大食、波斯招募造船技師。第三是從俘虜中挑選有一技之長的工匠和水手。霹靂軍艦隊在打擊敵對勢力和海盜過程中，抓獲了不少海盜。這些俘虜為了不服苦役或被流放，倒是十分踴躍為霹靂軍效力。
相比較於木材和水手，作為主戰武器的火炮對艦隊的影響便比較小了，如果全速生產，其產能跟得上戰艦建造的速度。得益於冶煉、火藥和車床技術的不斷改進，霹靂軍的艦用火炮不斷改進，不僅威力變大，後座力和重量也減輕不少，目前已形成了彈重5斤、10斤、20斤、40斤、80斤的火炮係列，彈種包括破甲彈、***、霰彈、鏈球彈、***等彈種。以發射40斤炮彈的重型艦炮為例，該型火炮配置在崇慶府、邛州和大邑這三級主力戰艦上，其最大射程能達十裏，能對敵人的大型戰船一發入魂。如果使用實心炮彈，能對敵人的城門、箭樓等重要設施造成嚴重的破壞。