夏、蜀既平，藩鎮惕息，多求入朝。鎮海節度使李錡亦不自安，求入朝，上許之。遣中使至京口慰撫，且勞其將士。錡雖署判官王澹為留後，實無行意，屢遷行期，澹與敕使數勸諭之。錡不悅，上表稱疾，請至歲暮入朝。上以問宰相，武元衡曰：“陛下初即政，錡求朝得朝，求止得止，可否在錡，將何以令四海！”上以為然，下詔征之。錡詐窮，遂謀反。王澹既掌留務，於軍府頗有製置，錡益不平，密諭親兵使殺之。會頒冬服，錡嚴兵坐幄中，澹與敕使入謁，有軍士數百噪於庭曰：“王澹何人，擅主軍務！”曳下，臠食之；大將趙琦出慰止，又臠食之；注刃於敕使之頸，詬詈，將殺之。錡陽驚，起救之。
冬，十月，己未，詔征錡為左仆射，以禦史大夫李元素為鎮海節度使。庚申，錡表言軍變，殺留後、大將。先是，錡選腹心五人為所部五州鎮將，姚誌安處蘇州，李深處常州，趙惟忠處湖州，丘自昌處杭州，高肅處睦州，各有兵數千，伺察刺史動靜。至是，錡各使殺其刺史，遣牙將庚伯良將兵三千治石頭城。常州刺史顏防用客李雲計，矯製稱招討副使，斬李深，傳檄蘇、杭、湖、睦。請同進討。湖州刺史辛秘潛募鄉閭子弟數百，夜襲趙惟忠營，斬之。蘇州刺史李素為姚誌安所敗，生致於錡，具桎梏釘於船舷，未及京口，會錡敗，得免。乙醜，製削李錡官爵及屬籍。以淮南節度使王鍔統諸道兵為招討處置使，征宣武、義寧、武昌兵並淮南、宣歙兵俱出宣州，江西兵出信州，浙東兵出杭州，以討之。
高崇文在蜀期年，一旦謂監軍曰：“崇文，河朔一卒，幸有功。致位至此。西川乃宰相迴翔之地，崇文叨居日久，豈敢自安！”屢上表稱“蜀中安逸，無所陳力，願效死邊陲。”上擇可以代崇文者而難其人。丁卯，以門下侍郎、同平章事武元衡同平章事，充西川節度使。
李錡以宣州富饒，欲先取之，遣兵馬使張子良、李奉仙、田少卿將兵三千襲之。三人知錡必敗，與牙將裴行立同謀討之。行立，錡之甥也，故悉知錡之密謀。三將營於城外，將發，召士卒諭之曰：“仆射反逆，官軍四集，常、湖二將繼死，其勢已蹙。今乃欲使吾輩遠取宣城，吾輩何為隨之族滅！豈若去逆效順，轉禍為福乎！”眾悅，許諾，即夜，還趨城。行立舉火鼓噪，應之於內，引兵趨牙門。錡聞子良等舉兵，怒，聞行立應之，撫膺曰：“吾何望矣！”跣走，匿樓下。親將李鈞引挽強三百趨山亭，欲戰，行立伏兵邀斬之。錡舉家皆哭，左右執錡，裹之以幕，縋於城下，械送京師。挽強、蕃落爭自殺，屍相枕藉。癸酉，本軍以聞。乙亥，群臣賀於紫宸殿。上愀然曰：“朕之不德，致宇內數有幹紀者，朕之愧也，何賀之為！”
宰相議誅錡大功以上親，兵部郎中蔣乿曰：錡大功親，皆淮安靖王之後也。淮安有佐命之功，陪陵、享廟，豈可以末孫為惡而累之乎！“又欲誅其兄弟，乿曰：錡兄弟，故都統國貞之子也，國貞死王事，豈可使之不祀乎！宰相以為然。辛巳，錡從父弟宋州刺史銛等皆貶官流放。”
十一月，甲申朔，錡至長安，上禦興安門，麵詰之。對曰：“臣初不反，張子良等教臣耳。”上曰：“卿為元帥，子良等謀反，何不斬之，然後入朝！”錡無以對。乃並其子師迴腰斬之。
有司請毀錡祖考塚廟，中丞盧坦上言：“李錡父子受誅，罪已塞矣。昔漢誅霍禹，不罪霍光；先朝誅房遺愛不及房玄齡。《康誥》曰：‘父子兄弟，罪不相及。’以錡為不善而罪及五代祖乎？”乃不毀。
有司籍錡家財輸京師。翰林學士裴垍、李絳上言，以為：“李錡僣侈，割剝六州之人以富其家，或枉殺其身而取其財。陛下閔百姓無告，故討而誅之，今輦金帛以輸上京，恐遠近失望。願以逆人資財賜浙西百姓，代今年租賦。”上嘉歎久之，即從其言。
昭義節度使盧從史，內與王士真、劉濟潛通，而外獻策請圖山東，擅引兵東出。上召令還上黨，從史托言就食邢、洺，不時奉詔。久之，乃還。
他日，上召李絳對於浴堂，語之曰：“事有極異者，朕比不欲言之。朕與鄭糸因議敕從史歸上黨，續征入朝。糸因乃泄之於從史，使稱上黨乏糧，就食山東。為人臣負朕乃爾，將何以處之？”對曰：“審如此，滅族有餘矣！然糸因、從史必不自言，陛下誰從得之？”上曰：“吉甫密奏。”絳曰：“臣竊聞搢紳之論，稱糸因為佳士，恐必不然。或者同列欲專朝政，疾寵忌前，願陛下更熟察之，勿使人謂陛下信讒也！”上良久曰：“誠然，糸因必不至此。非卿言，朕幾誤處分。”上又嚐從容問絳曰：“諫官多謗訕朝政，皆無事實，朕欲謫其尤者一二人以儆其餘，何如？”對曰：“此殆非陛下之意，必有邪臣欲壅蔽陛下之聰明者。人臣死生，係人主喜怒，敢發口諫者有幾！就有諫者皆晝度夜思，朝刪暮減，比得上達，什無二三。故人主孜孜求諫，猶懼不至，況罪之乎！如此，杜天下之口，非社稷之福也。”上善其言而止。
群臣請上尊號曰睿聖文武皇帝，丙申，許之。
眛厔尉、集賢校理白居易作樂府及詩百餘篇，規諷時事，流聞禁中。上風而悅之，召入翰林為學士。
十二月，丙辰，上謂宰相曰：太宗以神聖之資，群臣進諫者猶往複數四，況朕寡昧，自今事有違，卿當十論，無但一二而已。
丙寅，以高崇文同平章事，充邠寧節度、京西諸軍都統。
山南東道節度使於頴憚上英威，為子季友求尚主。上以皇女普寧公主妻之。翰林學士李諫曰：“頴，虜族，季友，庶孽，不足以辱帝女，宜更擇高門美才。”上曰：“此非卿所知。”己卯，公主適季友，恩禮甚盛。頴出望外，大喜。頃之，上使人諷之入朝謝恩，頴遂奉詔。
是歲，李吉甫撰《元和國計簿》上之，總計天下方鎮四十八，州府二百九十五，縣千四百五十三。其鳳翔、鄜坊、邠寧、振武、涇原、銀夏、靈鹽、河東、易定、魏博、鎮冀、範陽、滄景、淮西、淄青等十五道七十一州不申戶口外，每歲賦稅倚辦止於浙江東、西、宣歙、淮南、江西、鄂嶽、福建、湖南八道四十九州，一百四十四萬戶，比天寶稅戶四分減三。天下兵仰給縣官者八十三萬餘人，比天寶三分增一，大率二戶資一兵。其水旱所傷，非時調發，不在此數。
元和三年戊子，公元八零八年春，正月，癸巳，群臣上尊號曰睿聖文武皇帝；赦天下。“自今長吏詣闕，無得進奉。”知樞密劉光琦奏分遣中使齎赦詣諸道，意欲分其饋遺，翰林學士裴垍、李絳奏“敕使所至煩擾，不若但附急遞。”上從之。光琦稱舊例，上曰：“例是則從之，苟為非是，奈何不改！”
臨涇鎮將郝泚以臨涇地險要，水草美，吐蕃將入寇，必屯其地，言於涇原節度使段祐，奏而城之，自是涇原獲安。
二月，戊寅，鹹安大長公主薨於迴鶻。三月，迴鶻騰裏可汗卒。
癸巳，郇王總薨。
辛亥，禦史中丞盧坦奏彈前山南西道節度使柳晟，前浙東觀察使閻濟美違赦進奉。上召坦褒慰之，曰：“朕已釋其罪，不可失信。”坦曰：“赦令宣布海內，陛下之大信也。晟等不畏陛下法，奈何存小信棄大信乎！”上乃命歸所進於有司。
夏，四月，上策試賢良方正直言極諫舉人，伊闕尉牛僧孺、陸渾尉皇甫湜、前進士李宗閔皆指陳時政之失，無所避；戶部侍郎楊於陵、吏部員外郎韋貫之為考策官，貫之署為上第。上亦嘉之。乙醜，詔中書優與處分。李吉甫惡其言直，泣訴於上，且言“翰林學士裴垍、王涯覆策。湜，涯之甥也，涯不先言；垍無所異同。”上不得已，罷垍、涯學士，垍為戶部侍郎，涯為都官員外郎，貫之為果州刺史。後數日，費之再貶巴州刺史，涯貶虢州司馬。乙亥，以楊於陵為嶺南節度使，亦坐考策無異同也。僧孺等久之不調，各從辟於藩府。僧孺，弘之七世孫；宗閔，元懿之玄孫；貫之，福嗣之六世孫；湜，睦州新安人也。
丁醜，罷五月朔宣政殿朝賀。
以荊南節度使裴均為右仆射。均素附宦官得貴顯，為仆射，自矜大。嚐入朝，逾位而立；中丞盧坦揖而退之，均不從。坦曰：“昔姚南仲為仆射，位在此。”均曰：“南仲何人？”坦曰：“是守正不交權幸者。”坦尋改右庶子。
冬，十月，己未，詔征錡為左仆射，以禦史大夫李元素為鎮海節度使。庚申，錡表言軍變，殺留後、大將。先是，錡選腹心五人為所部五州鎮將，姚誌安處蘇州，李深處常州，趙惟忠處湖州，丘自昌處杭州，高肅處睦州，各有兵數千，伺察刺史動靜。至是，錡各使殺其刺史，遣牙將庚伯良將兵三千治石頭城。常州刺史顏防用客李雲計，矯製稱招討副使，斬李深，傳檄蘇、杭、湖、睦。請同進討。湖州刺史辛秘潛募鄉閭子弟數百，夜襲趙惟忠營，斬之。蘇州刺史李素為姚誌安所敗，生致於錡，具桎梏釘於船舷，未及京口，會錡敗，得免。乙醜，製削李錡官爵及屬籍。以淮南節度使王鍔統諸道兵為招討處置使，征宣武、義寧、武昌兵並淮南、宣歙兵俱出宣州，江西兵出信州，浙東兵出杭州，以討之。
高崇文在蜀期年，一旦謂監軍曰：“崇文，河朔一卒，幸有功。致位至此。西川乃宰相迴翔之地，崇文叨居日久，豈敢自安！”屢上表稱“蜀中安逸，無所陳力，願效死邊陲。”上擇可以代崇文者而難其人。丁卯，以門下侍郎、同平章事武元衡同平章事，充西川節度使。
李錡以宣州富饒，欲先取之，遣兵馬使張子良、李奉仙、田少卿將兵三千襲之。三人知錡必敗，與牙將裴行立同謀討之。行立，錡之甥也，故悉知錡之密謀。三將營於城外，將發，召士卒諭之曰：“仆射反逆，官軍四集，常、湖二將繼死，其勢已蹙。今乃欲使吾輩遠取宣城，吾輩何為隨之族滅！豈若去逆效順，轉禍為福乎！”眾悅，許諾，即夜，還趨城。行立舉火鼓噪，應之於內，引兵趨牙門。錡聞子良等舉兵，怒，聞行立應之，撫膺曰：“吾何望矣！”跣走，匿樓下。親將李鈞引挽強三百趨山亭，欲戰，行立伏兵邀斬之。錡舉家皆哭，左右執錡，裹之以幕，縋於城下，械送京師。挽強、蕃落爭自殺，屍相枕藉。癸酉，本軍以聞。乙亥，群臣賀於紫宸殿。上愀然曰：“朕之不德，致宇內數有幹紀者，朕之愧也，何賀之為！”
宰相議誅錡大功以上親，兵部郎中蔣乿曰：錡大功親，皆淮安靖王之後也。淮安有佐命之功，陪陵、享廟，豈可以末孫為惡而累之乎！“又欲誅其兄弟，乿曰：錡兄弟，故都統國貞之子也，國貞死王事，豈可使之不祀乎！宰相以為然。辛巳，錡從父弟宋州刺史銛等皆貶官流放。”
十一月，甲申朔，錡至長安，上禦興安門，麵詰之。對曰：“臣初不反，張子良等教臣耳。”上曰：“卿為元帥，子良等謀反，何不斬之，然後入朝！”錡無以對。乃並其子師迴腰斬之。
有司請毀錡祖考塚廟，中丞盧坦上言：“李錡父子受誅，罪已塞矣。昔漢誅霍禹，不罪霍光；先朝誅房遺愛不及房玄齡。《康誥》曰：‘父子兄弟，罪不相及。’以錡為不善而罪及五代祖乎？”乃不毀。
有司籍錡家財輸京師。翰林學士裴垍、李絳上言，以為：“李錡僣侈，割剝六州之人以富其家，或枉殺其身而取其財。陛下閔百姓無告，故討而誅之，今輦金帛以輸上京，恐遠近失望。願以逆人資財賜浙西百姓，代今年租賦。”上嘉歎久之，即從其言。
昭義節度使盧從史，內與王士真、劉濟潛通，而外獻策請圖山東，擅引兵東出。上召令還上黨，從史托言就食邢、洺，不時奉詔。久之，乃還。
他日，上召李絳對於浴堂，語之曰：“事有極異者，朕比不欲言之。朕與鄭糸因議敕從史歸上黨，續征入朝。糸因乃泄之於從史，使稱上黨乏糧，就食山東。為人臣負朕乃爾，將何以處之？”對曰：“審如此，滅族有餘矣！然糸因、從史必不自言，陛下誰從得之？”上曰：“吉甫密奏。”絳曰：“臣竊聞搢紳之論，稱糸因為佳士，恐必不然。或者同列欲專朝政，疾寵忌前，願陛下更熟察之，勿使人謂陛下信讒也！”上良久曰：“誠然，糸因必不至此。非卿言，朕幾誤處分。”上又嚐從容問絳曰：“諫官多謗訕朝政，皆無事實，朕欲謫其尤者一二人以儆其餘，何如？”對曰：“此殆非陛下之意，必有邪臣欲壅蔽陛下之聰明者。人臣死生，係人主喜怒，敢發口諫者有幾！就有諫者皆晝度夜思，朝刪暮減，比得上達，什無二三。故人主孜孜求諫，猶懼不至，況罪之乎！如此，杜天下之口，非社稷之福也。”上善其言而止。
群臣請上尊號曰睿聖文武皇帝，丙申，許之。
眛厔尉、集賢校理白居易作樂府及詩百餘篇，規諷時事，流聞禁中。上風而悅之，召入翰林為學士。
十二月，丙辰，上謂宰相曰：太宗以神聖之資，群臣進諫者猶往複數四，況朕寡昧，自今事有違，卿當十論，無但一二而已。
丙寅，以高崇文同平章事，充邠寧節度、京西諸軍都統。
山南東道節度使於頴憚上英威，為子季友求尚主。上以皇女普寧公主妻之。翰林學士李諫曰：“頴，虜族，季友，庶孽，不足以辱帝女，宜更擇高門美才。”上曰：“此非卿所知。”己卯，公主適季友，恩禮甚盛。頴出望外，大喜。頃之，上使人諷之入朝謝恩，頴遂奉詔。
是歲，李吉甫撰《元和國計簿》上之，總計天下方鎮四十八，州府二百九十五，縣千四百五十三。其鳳翔、鄜坊、邠寧、振武、涇原、銀夏、靈鹽、河東、易定、魏博、鎮冀、範陽、滄景、淮西、淄青等十五道七十一州不申戶口外，每歲賦稅倚辦止於浙江東、西、宣歙、淮南、江西、鄂嶽、福建、湖南八道四十九州，一百四十四萬戶，比天寶稅戶四分減三。天下兵仰給縣官者八十三萬餘人，比天寶三分增一，大率二戶資一兵。其水旱所傷，非時調發，不在此數。
元和三年戊子，公元八零八年春，正月，癸巳，群臣上尊號曰睿聖文武皇帝；赦天下。“自今長吏詣闕，無得進奉。”知樞密劉光琦奏分遣中使齎赦詣諸道，意欲分其饋遺，翰林學士裴垍、李絳奏“敕使所至煩擾，不若但附急遞。”上從之。光琦稱舊例，上曰：“例是則從之，苟為非是，奈何不改！”
臨涇鎮將郝泚以臨涇地險要，水草美，吐蕃將入寇，必屯其地，言於涇原節度使段祐，奏而城之，自是涇原獲安。
二月，戊寅，鹹安大長公主薨於迴鶻。三月，迴鶻騰裏可汗卒。
癸巳，郇王總薨。
辛亥，禦史中丞盧坦奏彈前山南西道節度使柳晟，前浙東觀察使閻濟美違赦進奉。上召坦褒慰之，曰：“朕已釋其罪，不可失信。”坦曰：“赦令宣布海內，陛下之大信也。晟等不畏陛下法，奈何存小信棄大信乎！”上乃命歸所進於有司。
夏，四月，上策試賢良方正直言極諫舉人，伊闕尉牛僧孺、陸渾尉皇甫湜、前進士李宗閔皆指陳時政之失，無所避；戶部侍郎楊於陵、吏部員外郎韋貫之為考策官，貫之署為上第。上亦嘉之。乙醜，詔中書優與處分。李吉甫惡其言直，泣訴於上，且言“翰林學士裴垍、王涯覆策。湜，涯之甥也，涯不先言；垍無所異同。”上不得已，罷垍、涯學士，垍為戶部侍郎，涯為都官員外郎，貫之為果州刺史。後數日，費之再貶巴州刺史，涯貶虢州司馬。乙亥，以楊於陵為嶺南節度使，亦坐考策無異同也。僧孺等久之不調，各從辟於藩府。僧孺，弘之七世孫；宗閔，元懿之玄孫；貫之，福嗣之六世孫；湜，睦州新安人也。
丁醜，罷五月朔宣政殿朝賀。
以荊南節度使裴均為右仆射。均素附宦官得貴顯，為仆射，自矜大。嚐入朝，逾位而立；中丞盧坦揖而退之，均不從。坦曰：“昔姚南仲為仆射，位在此。”均曰：“南仲何人？”坦曰：“是守正不交權幸者。”坦尋改右庶子。