西遼時期
西遼（1124年-1218年）是契丹人耶律大石建立的國家，後擴張到中亞，首都虎思斡魯朵（今吉爾吉斯斯坦托克瑪克附近的布拉納城），一時成為中亞強國。1218年被成吉思汗的蒙古軍隊滅亡。西遼舊地在1222年被成吉思汗分給次子察合台，察合台汗國後來形成中亞廣泛使用的察合台語（後發展為維吾爾語和烏茲別克語）。
察合台汗國時期
察合台汗國原為鐵木真次子察合台的封地。初領有西遼舊地，包括天山南、北路與裕勒都斯河和瑪納斯河流域及今日阿姆河、錫爾河之間的中亞河中地區（最強時由阿爾泰山至鹹海）。初時建都於阿力麻裏附近的虎牙思（固爾劄），即今日中華人民共和國新疆霍城縣水定鎮西北。察合台汗國君主都哇與窩闊台汗國君主海都聯合，屢與元朝軍隊爭戰，終忽必烈一朝未斷，並一度攻占漠北哈拉和林。至公元1304年始與海都子察八兒與元成宗講和。
清朝時期
清高宗乾隆二十二年（1757年）平定準噶爾蒙古後，吉爾吉斯斯坦人被清朝統治。向清朝納貢的吉爾吉斯斯坦人被稱為“布魯特”分為東西兩部，西布魯特遊牧於喀什噶爾北部河西部、葉爾羌西南部；共有四大部落；東布魯特遊牧於烏什、阿克蘇西北，伊犁西南，共有五部落。後來清朝衰落，在1864年的《中俄勘分西北界約記》將外西北割讓給俄羅斯帝國，因為人隨地歸，吉爾吉斯斯坦人從此被俄國統治（一部分因為被準噶爾汗國裹脅叛亂被乾隆帝送交黑龍江富裕縣）。
18世紀，今日的吉爾吉斯斯坦地區分別是準噶爾蒙古（北部）及浩罕汗國（南部）的勢力範圍。19世紀20年代，浩罕勢力擴張，整個吉爾吉斯斯坦地區都成為了浩罕汗國的一部分。
俄羅斯帝國時期
1854年，俄國著手入侵浩罕汗國，並透過各種外交手段逼使清廷承認中亞地區各藩屬的獨立地位。1876年，浩罕亡國，整個吉爾吉斯斯坦地區都落入了俄國的手裏。俄國的統治，引發不少反抗，亦有不少人決定離開現居地，遷入帕米爾高原及阿富汗；但另一方麵，同治年間清朝陝甘地區迴民暴亂，失敗後的迴民北遷至今日楚河沿岸，成為今日東幹人的祖先。
1916年，俄國對反抗運動的鎮壓，使不少吉爾吉斯斯坦人從中亞遷徙至新疆。
蘇聯時期
1922年，蘇聯成立時歸屬突厥斯坦蘇維埃社會主義自治共和國。1924年，中亞地區實行民族劃界，今日的吉爾吉斯斯坦建立起卡拉吉爾吉斯斯坦自治州，成為俄羅斯聯邦的一分子。1925年正名為吉爾吉斯斯坦自治州，到1926年又再升格為吉爾吉斯斯坦蘇維埃社會主義自治共和國。1936年12月5日，吉爾吉斯斯坦蘇維埃社會主義共和國正式成立，成為蘇聯的聯邦成員。
獨立之後
1990年代初期，由共產黨中改革派組成的吉爾吉斯斯坦minzhuyundong（democratic movement kyrgyzstan, dmk）與奧什爆發的族群衝突，造成吉爾吉斯斯坦共產黨第一書記阿布薩馬特·馬薩利耶夫失去人民與議會的信任，各方勢力妥協後，吉爾吉斯斯坦科學院的院長阿卡耶夫，在1990年10月直選中以95%高得票率當選獨立後的第一任總統。
1991年8月19日，該共和國緊急狀態委員會（scse）借助莫斯科方麵的力量，嚐試罷免總統阿卡耶夫。計劃失敗後一個星期，阿卡耶夫和副總統庫茲涅托夫宣布退出蘇聯共產黨，辭去書記一職，並將整個政府機構解散。受其影響，緊接著在8月31日的最高蘇維埃議會投票中宣布脫離蘇聯獨立，改國名為吉爾吉斯斯坦共和國。1993年5月5日，又改名為吉爾吉斯共和國。
阿卡耶夫獨裁
1993年憲法定義政府體製為一民主共和製的共和國。行政部門包括總統和總理，國會為兩院製，司法部門包括最高法院、憲法法庭、地方法院和檢察總長。
隨著經濟惡化，從1994年中期開始，阿卡耶夫逐漸轉向威權統治。接著數年，在與議會的衝突中，阿卡耶夫透過公民投票直接尋求民意支持，分別在1996年2月與1998年10月修憲，以擴大總統權力、修改選舉規則。
2002年3月發生在南部阿赫昔區六名抗議任意拘捕反對黨政治人物的民眾遭警察射殺的事件，引發了全國性抗議。在民間社團和反對黨代表的參與之下，阿卡耶夫總統啟動了憲法改革進程。此進程最初有政府、民間、和社會代表的廣大參與和開放對話，產生了2003年2月投票過程有缺失的公民投票。公民投票通過的憲法修正案導致了總統擴權和國會與憲法法庭弱化。根據新憲法，在2005年的國會選舉之後，原先的兩院製國會將成為75席的單院國會。
過渡政府領導人正在發展新的治理結構並著手解決重要的憲法爭議。國家團結委員會宣布，六月將舉行總統選舉，而在其三個月之後將舉行國會選舉。
鬱金香革命
2005年吉爾吉斯斯坦政局動蕩，針對議會第二輪選舉中的舞弊行為，陸續有示威活動，其訴求演變為要求政府辭職。3月24日，上萬反對者聚及在比什凱克要求總統以及他的政府辭職，亦即是“鬱金香革命”。總統阿卡耶夫先逃到哈薩克斯坦，最後到達莫斯科。3月28日，吉爾吉斯斯坦新一屆議會選舉出反對派領導人、前總理巴基耶夫為政府總理，並代行總統的職責。當時在莫斯科的總統阿卡耶夫於4月4日辭職。
在2005年7月10日的總統大選中，巴基耶夫以壓倒性的89.4%票數成功當選總統，並於8月14日宣誓就任。
西遼（1124年-1218年）是契丹人耶律大石建立的國家，後擴張到中亞，首都虎思斡魯朵（今吉爾吉斯斯坦托克瑪克附近的布拉納城），一時成為中亞強國。1218年被成吉思汗的蒙古軍隊滅亡。西遼舊地在1222年被成吉思汗分給次子察合台，察合台汗國後來形成中亞廣泛使用的察合台語（後發展為維吾爾語和烏茲別克語）。
察合台汗國時期
察合台汗國原為鐵木真次子察合台的封地。初領有西遼舊地，包括天山南、北路與裕勒都斯河和瑪納斯河流域及今日阿姆河、錫爾河之間的中亞河中地區（最強時由阿爾泰山至鹹海）。初時建都於阿力麻裏附近的虎牙思（固爾劄），即今日中華人民共和國新疆霍城縣水定鎮西北。察合台汗國君主都哇與窩闊台汗國君主海都聯合，屢與元朝軍隊爭戰，終忽必烈一朝未斷，並一度攻占漠北哈拉和林。至公元1304年始與海都子察八兒與元成宗講和。
清朝時期
清高宗乾隆二十二年（1757年）平定準噶爾蒙古後，吉爾吉斯斯坦人被清朝統治。向清朝納貢的吉爾吉斯斯坦人被稱為“布魯特”分為東西兩部，西布魯特遊牧於喀什噶爾北部河西部、葉爾羌西南部；共有四大部落；東布魯特遊牧於烏什、阿克蘇西北，伊犁西南，共有五部落。後來清朝衰落，在1864年的《中俄勘分西北界約記》將外西北割讓給俄羅斯帝國，因為人隨地歸，吉爾吉斯斯坦人從此被俄國統治（一部分因為被準噶爾汗國裹脅叛亂被乾隆帝送交黑龍江富裕縣）。
18世紀，今日的吉爾吉斯斯坦地區分別是準噶爾蒙古（北部）及浩罕汗國（南部）的勢力範圍。19世紀20年代，浩罕勢力擴張，整個吉爾吉斯斯坦地區都成為了浩罕汗國的一部分。
俄羅斯帝國時期
1854年，俄國著手入侵浩罕汗國，並透過各種外交手段逼使清廷承認中亞地區各藩屬的獨立地位。1876年，浩罕亡國，整個吉爾吉斯斯坦地區都落入了俄國的手裏。俄國的統治，引發不少反抗，亦有不少人決定離開現居地，遷入帕米爾高原及阿富汗；但另一方麵，同治年間清朝陝甘地區迴民暴亂，失敗後的迴民北遷至今日楚河沿岸，成為今日東幹人的祖先。
1916年，俄國對反抗運動的鎮壓，使不少吉爾吉斯斯坦人從中亞遷徙至新疆。
蘇聯時期
1922年，蘇聯成立時歸屬突厥斯坦蘇維埃社會主義自治共和國。1924年，中亞地區實行民族劃界，今日的吉爾吉斯斯坦建立起卡拉吉爾吉斯斯坦自治州，成為俄羅斯聯邦的一分子。1925年正名為吉爾吉斯斯坦自治州，到1926年又再升格為吉爾吉斯斯坦蘇維埃社會主義自治共和國。1936年12月5日，吉爾吉斯斯坦蘇維埃社會主義共和國正式成立，成為蘇聯的聯邦成員。
獨立之後
1990年代初期，由共產黨中改革派組成的吉爾吉斯斯坦minzhuyundong（democratic movement kyrgyzstan, dmk）與奧什爆發的族群衝突，造成吉爾吉斯斯坦共產黨第一書記阿布薩馬特·馬薩利耶夫失去人民與議會的信任，各方勢力妥協後，吉爾吉斯斯坦科學院的院長阿卡耶夫，在1990年10月直選中以95%高得票率當選獨立後的第一任總統。
1991年8月19日，該共和國緊急狀態委員會（scse）借助莫斯科方麵的力量，嚐試罷免總統阿卡耶夫。計劃失敗後一個星期，阿卡耶夫和副總統庫茲涅托夫宣布退出蘇聯共產黨，辭去書記一職，並將整個政府機構解散。受其影響，緊接著在8月31日的最高蘇維埃議會投票中宣布脫離蘇聯獨立，改國名為吉爾吉斯斯坦共和國。1993年5月5日，又改名為吉爾吉斯共和國。
阿卡耶夫獨裁
1993年憲法定義政府體製為一民主共和製的共和國。行政部門包括總統和總理，國會為兩院製，司法部門包括最高法院、憲法法庭、地方法院和檢察總長。
隨著經濟惡化，從1994年中期開始，阿卡耶夫逐漸轉向威權統治。接著數年，在與議會的衝突中，阿卡耶夫透過公民投票直接尋求民意支持，分別在1996年2月與1998年10月修憲，以擴大總統權力、修改選舉規則。
2002年3月發生在南部阿赫昔區六名抗議任意拘捕反對黨政治人物的民眾遭警察射殺的事件，引發了全國性抗議。在民間社團和反對黨代表的參與之下，阿卡耶夫總統啟動了憲法改革進程。此進程最初有政府、民間、和社會代表的廣大參與和開放對話，產生了2003年2月投票過程有缺失的公民投票。公民投票通過的憲法修正案導致了總統擴權和國會與憲法法庭弱化。根據新憲法，在2005年的國會選舉之後，原先的兩院製國會將成為75席的單院國會。
過渡政府領導人正在發展新的治理結構並著手解決重要的憲法爭議。國家團結委員會宣布，六月將舉行總統選舉，而在其三個月之後將舉行國會選舉。
鬱金香革命
2005年吉爾吉斯斯坦政局動蕩，針對議會第二輪選舉中的舞弊行為，陸續有示威活動，其訴求演變為要求政府辭職。3月24日，上萬反對者聚及在比什凱克要求總統以及他的政府辭職，亦即是“鬱金香革命”。總統阿卡耶夫先逃到哈薩克斯坦，最後到達莫斯科。3月28日，吉爾吉斯斯坦新一屆議會選舉出反對派領導人、前總理巴基耶夫為政府總理，並代行總統的職責。當時在莫斯科的總統阿卡耶夫於4月4日辭職。
在2005年7月10日的總統大選中，巴基耶夫以壓倒性的89.4%票數成功當選總統，並於8月14日宣誓就任。