卻說韓全誨知道朱全忠進京之後，劉季述的下場就是自己的下場，於是急命宿衛京師的鳳翔、邠寧精兵，挾持昭宗，出奔鳳翔。在韓全誨的逼迫下，昭宗罷免了崔胤的相位，同時飛詔朱溫還鎮。朱全忠哪裏肯迴？他命兄子朱友寧駐守大梁，然後以誅殺閹黨之名，令大將張歸霸為先鋒興兵五萬進逼鳳翔。韓全誨逼迫昭宗擬旨，加封江淮楊行密為吳王，兩川節度使王建為蜀王，企盼二王出兵抵抗朱全忠。敕命傳至揚行密與王建處，二人陽奉陰違，散發檄文聲討朱全忠，其實卻按兵不動。
朱全忠五萬兵馬兵臨鳳鳴關，這鳳鳴關守將名叫符道昭，蔡州人氏。符道昭望見朱全忠排兵列陣，不禁怒道：“中原賊子犯我西歧，傳令點兵出戰。”鳳鳴關上號炮三聲，門欄大開。隻見關中馬步軍分列左右，符道昭身著亮銀白虎盔，手中虎頭槊，跨下一匹金雞閃電白龍駒。符道昭揮槊嗬道：“吾乃鳳鳴關都將符道昭，爾等犯我西歧，還不早早退去。”
梁王麾下大將胡真道：“無名之士，休要狂言！”說完策馬直取符道昭，二將交陣二十迴合未分勝負。朱全忠見二人難決高下，下令鳴金收兵。
朱全忠與眾將迴到中軍大帳，胡真問道：“今日大戰，千歲因何收兵？”
朱全忠道：“今日觀這白甲之將，本王甚是心愛，欲收羅帳下，所以不忍傷其性命，意欲生擒。”
謝瞳道：“千歲莫慮，若想生擒符道昭，可施反間計。”
胡真問道：“這鳳鳴關堵塞道路，如何能使反間。”
謝瞳言道：“我觀此地有一山澗，名曰折虎澗，可令張歸霸將軍伏兵山澗之內。明日胡將軍再戰符道昭。隻可詐敗，誘其追擊。我自有計策。”
朱全忠喜道：“子明既已成竹在胸，就依此計。”眾人遂安謝瞳之策，各自準備。
次日天明，梁將胡真帶一千人馬來到關前叫戰，符道昭率三千兵馬出城應戰。胡真策馬來戰，符道昭持槊相迎。二人隻戰四五迴合，胡真便詐敗而逃。符道昭見梁兵列陣不過千人，便令左右三軍一齊追殺。胡真率一千餘人逃入折虎澗中，符道昭率兵追來。忽見山澗兩側山坡之上，梁軍大旗滿山而展，四麵伏兵殺出，梁將張歸霸山坡之上大喊：“符道昭，汝今中伏何不早降？”符道昭自知中計，便令所部兵馬撤退。張歸霸令弓弩手放箭。謝瞳則令五百士卒在山坡之上高唿：“隻射西歧人！勿傷符將軍！隻射西歧人！勿傷符將軍！”鳳鳴關將士多是西歧人氏，聞聽此言軍心渙散，且箭弩如雨，卻不見一支射向符道昭。歧軍損兵千人逃迴鳳鳴關。
歧軍將士迴到鳳鳴關中，對梁軍隻射西歧兵，不傷符道昭之事，心存疑慮。鳳鳴關有一西歧校尉名叫侯瑾，以為符道昭暗通梁軍，便逃往鳳翔報信。李茂貞一聽大怒，令大將王行瑜點將排兵討伐符道昭。
謝瞳反間計得手，等待鳳鳴關自亂。大將胡真來報：“符道昭來我營歸降。”朱全忠一聽大喜，令眾人同往轅門外迎接。隻見符道昭率領五千餘人前來歸降。朱全忠將符道昭請入中軍大帳盛宴款待。符道昭懊悔地說：“李茂貞聽信讒言起兵伐我，我隻好投至千歲麾下，萬望容留。”
朱全忠道：“符將軍能征善戰，孤王與將軍相見恨晚。將軍能順應天意傾心歸附，待迎得天子，符將軍功勞必在眾人之上。”符道昭連聲稱謝。
朱全忠過鳳鳴關，正遇西歧大將王行瑜。張歸霸大敗王行瑜，梁軍直逼鳳翔城下。
隻見鳳翔城門大開，步兵在前，騎兵在後，兵馬展開兩翼，軍中一員上將，此人紫麵膛，銅鈴眼，紅眉赤須，頭戴分水盔，身披熟圖甲，腰挎七星劍，跨下追風馬，正是鳳翔節度使李茂貞。梁軍先鋒官張歸霸出陣，鳳翔軍牙將姚旺手持三挺門扇刀迎戰。二人大戰四五個迴合，姚旺被張歸霸砍落馬下。又有戰將倪子太，手持一對束手銅人槊直取張歸霸。二人大戰六個迴合，倪子太又被砍殺。李茂貞之子李繼徽親自上陣，與張歸霸大戰十個迴合，被張歸霸打落手中槍。李繼徽慌亂之際，隻聽有人大喊“敵將休狂，大將秦陽在此！”鳳翔軍勇將秦陽手持點剛槍來戰，李繼徽趁機逃迴。張歸霸三個迴合又殺秦陽，李茂貞見張歸霸連殺三將，隻得鳴金收兵。
李茂貞直接找到昭宗，逼迫昭宗下詔命令朱溫退軍，隨後又矯詔傳檄諸道，要求各路藩鎮舉兵勤王！
麵對李茂貞的小花招，朱溫怡然不懼，他當然知道昭宗的詔書都是受李茂貞和韓全誨的逼迫，根本不打算理會。但是朱溫考慮到鳳翔鎮所岐州城防堅固，短時間怕是難以攻克，於是決定堅壁清野，揮師北上。
不多日拿下武功、邠州等地，在清掃完岐州外圍後，再度揮師將其團團圍困。
李茂貞大吃一驚，誰能想到自己也算是關中第一巨頭，在朱溫手下就跟小雞子似的，轄內堅城全被輕鬆搞定，李茂貞和韓全誨很是著急，於是躲在城中堅守不出。
時年八月，李茂貞堂弟保大節度使李茂勳率兵進駐三原，意欲解除鳳翔之圍，但不敵汴軍。
二十二日，李茂貞再一次集結全城兵力，決意出城與朱溫決戰；結果再一次大敗，汴軍趁機攻城，幾乎攻破岐州西門。
此戰之後，李茂貞閉門死守再也不敢輕易接戰。
李茂貞雖然不是朱溫的對手，但這並不妨礙他在鳳翔大耍權臣威風，肆意淩虐昭宗和他的宮廷。
一次宴會上李茂貞酒至酣時，竟然以巨杯勸帝酒；昭宗不想喝，李茂貞舉杯叩帝頤頷！如此跋扈，董卓、曹操也不遑多讓！
戰爭如火如荼地進行著，時間也到了雨季，連日陰雨連綿，汴軍士兵大多發病，而鳳翔軍堅守城池，始終不肯出城作戰。朱溫看短時間內難以攻破城池便有意退兵，但是遭到部將高季昌、劉知俊的強烈反對，二人表示：“咱們困難，鳳翔也困難，此時撤軍前功盡棄，依我之見大帥應該派間諜混入城中，用計誘騙李茂貞出城！”
朱溫同意了二人的請求，這時候有個叫馬景的士兵主動提出要去當間諜，他對朱溫說：“我去必死無疑，但求大王能夠善待我的妻子兒女。”
馬景甘為炮灰的精神讓朱溫深受感動，朱溫表示你放心去死吧，其他事情無需多慮。
馬景便騎著大馬直奔鳳翔，入城後他對李茂貞說道：“汴軍已經撤兵了，大營中隻有一萬多老弱病殘，今夜也將離去。”
李茂貞白天也看見大隊人馬出了汴軍營盤，便對馬景的話信以為真，當即決定趁夜劫營。
是夜鳳翔軍傾巢而出，偷襲汴軍大營，朱溫見李茂貞中計，立即敲響營中戰鼓，伏兵盡出猛攻鳳翔軍，此外又派遣數百精兵死守岐州城門。鳳翔軍進退兩難，自相踐踏死傷無算，李茂貞拚盡全力才僥幸逃迴城中，此後再也不敢應戰。
大勝過後朱溫再次命令汴軍大舉攻城晝夜不停，攻城者嘴裏叫罵城中是“劫天子賊”，守城者則反懟城外是“奪天子賊”，雙方連打帶罵熱火朝天.
朱溫將鳳翔重重包圍了一年多，可怕的災難降臨到城裏所有人的頭上。隨著原有的存糧耗盡，城中出現了粒米粒金的行情。饑餓的官兵開始瘋狂洗劫城市，掘地三尺也要搜出口糧。不少人也拷掠百姓勒索財物，將除了王府邸外的其他建築摧毀。部分貪婪官吏明知道城中糧貴，還以5兩10石的價格向城中殷實家庭征糧。如果交不出這麽多糧食，就要以每石300兩的代價償付。最後弄得城中所有富戶破產，普通中產也陷入赤貧。
守城官兵和富戶尚且如此，一般百姓更是闔家等死。因為城中缺糧不是奸商囤積所致，所以掏出畢生積蓄也無法買到食物。他們隻得將樹皮與樹根夾雜著爛棉花食用。
李茂貞覺得再也難以與朱全忠相爭，其子李繼徽道：“厭惡朱全忠之人並非當今萬歲，而是韓全誨一幫閹黨。與朱全忠長此以往，對我西歧不利。”
李茂貞道：“繼徽之言，莫非要誅殺閹黨，以退朱全忠大兵。”
李繼徽道：“父帥與朱全忠動兵，上無天子決心，下無諸侯響應。若剿滅閹官送萬歲還京。萬歲必然不會怪罪父親，朱全忠自然也會退兵。”李茂貞便遣密使往朱全忠大營求和，並願緝拿挾持皇帝的大太監。朱全忠之心全在劫持皇帝，並無心奪取西歧，便說隻要李茂貞緝拿閹黨，送迴禦駕後自己便班師迴朝。
天複三年（903年）正月初六，李茂貞在得到昭宗首肯後，抓捕了韓全誨、張彥弘、袁易簡、周敬容等四名宦首，隨後又抓捕了參與劫持昭宗的李繼筠、李繼誨等十六人，全部推出斬首。
次日，昭宗派近臣韓偓和趙國夫人將二十顆大好頭顱送到朱溫帥賬，並給朱溫傳詔道：“過去脅留車駕、離間君臣的就是這些人；現在這些人已經被朕和李茂貞殺了，你可以宣諭諸軍以解眾憤。”
朱溫拜詔奉旨，但遲遲沒有撤去圍困鳳翔的大軍，李茂貞此時已經心亂如麻，朱溫遲遲不走莫非想吞並鳳翔？得馬上和崔胤搞好關係了！
李茂貞奏請昭宗盡快將崔胤召到鳳翔接他迴宮，昭宗自己也急著要迴去，於是三番四次給崔胤傳詔，言辭懇切稱已經恢複了他的全部官職，命他盡快前來鳳翔接駕。
但是崔胤卻稱病不來，昭宗沒辦法，隻能叫朱溫給他去信。朱溫寫信半開玩笑地說：“我沒見過天子，你來幫我認認？”接到朱溫的書信崔胤的病馬上就好了，一路風馳電掣地趕到鳳翔。
二十二日雙方談妥一切事務，李茂貞大開城門放昭宗出城，朱溫則一身素服站在城外請罪。昭宗趕快派使臣宣讀赦免朱溫一切罪過的詔書，並撤去身邊親、勳、翊三衛儀仗，獨留金吾將軍前去報平安。
這是朱溫第一次見到昭宗，見麵之後朱溫立即跪倒在地，雙眼含淚像極了一個忠臣，昭宗也不免感動，君臣二人哭成一片。
昭宗將朱溫扶起來後對他說道：“大唐江山多虧愛卿才能再次平安，就連朕的性命也多虧愛卿才得以保全。”說著還把腰上的玉帶解下來賜給朱溫。
二人休息片刻後開始上路，朱溫為了表示他對昭宗的忠誠，單槍匹馬在隊伍前方引導了十多裏路，隨後又讓朱友倫領兵護衛，自己則留下處理善後工作。當天晚上昭宗夜宿岐山，第二天崔胤率文武百官於興平接駕，昭宗正式恢複其官職。
昭宗在朱溫的“保護”下迴到長安。
朱溫迴師中原後，鳳翔節度使李茂貞和邠州節度使楊崇本又開始偷偷摸摸地算計起來，甚至屢次出兵靠近京畿附近。
楊崇本其人來曆不明，自幼便被李茂貞收為養子，後來被李茂貞表為邠州節度使，他也算是李茂貞手下的紅人。
朱溫討伐李茂貞時，期間率部攻打邠州，楊崇本表示願意投降，朱溫欣然同意，並仍然讓他作為邠州節度使。
事兒到這兒也就過去了，楊崇本換了個一等一的大腿抱，官帽子也沒丟，其實並沒有什麽損失。
可是有句話怎麽說來著？不怪兄弟不是人，隻怪弟妹太迷人，不知道怎麽著朱溫看上了楊崇本的老婆，當場就把楊崇本的老婆給霍霍了。
楊崇本衝冠一怒，立即聯係李茂貞，誓要報辱妻之仇。
倆人約定一同舉兵進軍京畿，朱溫一聽立即從中原返迴關中，李茂貞楊崇本馬上又嚇得帶兵退走。
卻說朱溫將昭宗控製住之後，滿心想的都是怎麽篡位登基，誰敢攔路就弄死誰；而崔胤雖然和朱溫勾結緊密，但他想的卻是能獨攬朝中大權，做一個名噪一時的權臣.
當時崔胤可判六軍十二衛事，但是真正的掌權人還是朱溫，崔胤手中沒有一兵一卒可為自己所用，崔胤於是想到了一個絕好的主意。
朱溫前腳剛到汴州，後腳就收到崔胤的一封信，信中稱西邊的李茂貞近在眼前，不得不防，但我手中並無兵權，無法防範，所以崔胤請朱溫批準自己新建一支軍隊，在原有的朝廷禁軍左右龍武、羽林、神策六軍中設置四個步兵統領，每個統領統兵250人，加設騎兵統領掌兵100，再加上機關要衝大約需要6000多人。
朱溫一下子就看穿了崔胤的花花腸子，但此時前方鑼鼓喧天，朱溫並不想朝中出什麽亂子，也就假意同意了崔胤的建軍請求。
朱溫派出大量的心腹前往投奔，崔胤根本想不到朱溫會跟自己來陰的，對此並無防範，朱溫派出的將士幾乎都被崔胤選中，還給安排了重要崗位。
如此一來，崔胤組建的這支新軍就被朱溫架空了，崔胤對此毫不知情，反而興衝衝地加緊操練，還任命京兆尹鄭元規為六軍諸衛副使，心腹陳班為威遠軍使。
不過這一切都在朱溫的掌控之中，朱溫並沒有對他采取措施，而是靜觀其變。
到了當年十月，突然發生了一起意外事件，朱溫留在京城的侄子朱友倫在打馬球時莫名其妙墜馬身亡，消息傳來朱溫悲痛萬分。
朱友倫是朱溫二哥朱存的兒子，朱存和朱溫一同投軍，後來在跟隨黃巢轉戰嶺南時戰死，留下的兩個孩子朱友寧和朱友倫都被朱溫當做親生兒子看待，不久前朱友寧與王師範作戰身亡，現在朱友倫又這樣不清不楚地死亡，二哥朱存算是絕後了，這讓朱溫難以接受。
盛怒之下朱溫懷疑是崔胤為了控製京城宿衛，所以暗中派人害死朱友倫，此時真相已經不重要了，隻要朱溫有這種想法，崔胤的命運也就注定了。
朱溫見昭宗的兒子德王李裕年齡已大，要是德王繼承了皇位，一定會成為自己篡位的障礙。他有次偷偷對宰相崔胤說，李裕曾被宦官擁立為帝，這種人怎麽還能留著？你應該勸天子將他殺掉！崔胤將此話轉告昭宗，昭宗又詢問朱溫，朱溫道：“這是你們的家事，為臣豈敢議論？崔胤沒安好心，想把臣賣了！”
昭宗表麵上不動聲色，不過心裏很清楚，想殺德王的就是朱溫！他有次隨口對蔣玄暉說：“德王是我的愛子，朱溫為什麽要殺他呢？”蔣玄暉立即將這些情況匯報給了朱溫。
朱全忠帳下文武之中，惟養子朱友恭心眼最多，且心胸陰險。有次朱全忠對朱友恭說：“當今聖上對孤王已經心生怨恨，我兒可有良策？”
朱友恭言道：“父王何不來個敲山震虎，殺雞儆猴。”
朱全忠問道：“此話怎講？”
朱友恭言道：“長安宮廷之中，多有萬歲身邊耳目，父王可奏請遷都洛陽，使萬歲再無依賴之人。若有不願遷都者，必是異心之人，父王將其處死。此乃一舉兩得。”
朱全忠點頭道：“吾兒妙計，明日我便奏請皇上遷都。”
次日朱全忠入朝奏道：“臣啟陛下，長安貴為大唐之都，曆經黃巢賊寇作亂，百姓不耕種，商賈不往來，實乃頹廢之兆也，臣請陛下遷都洛陽。”昭宗現在想躲朱全忠都躲不開，一聽遷都更是不情願。宰相崔胤看了朱全忠一眼，對昭宗道：“臣以為陛下不可遷都，想我高祖皇帝在長安開基，傳帝十九世，祖先開基寶地豈可變更。”
京兆尹鄭元規也隨聲奏道：“崔丞相所言極是，長安自漢代便是龍脈祥瑞之地，萬不可違背祖製。”朱全忠見崔、鄭二人反駁遷都之事，從此懷恨在心。
退朝之後，朱全忠命養子朱友恭率一千人馬分別查抄崔胤、鄭元規二人府第。等到次日早朝，昭宗見崔胤、鄭元規未曾上朝，便問朱全忠道：“梁王，今日崔胤與鄭元規二位愛卿為何不來早朝？”
朱全忠答道：“崔、鄭二人犯下謀逆之罪，臣已將二人緝拿。”遂命朱友恭將崔胤與鄭元規押上朝堂。崔胤一看朱全忠就罵道：“朱全忠你這個亂臣賊子，顛倒黑白指鹿為馬，一定不得好死。”鄭元規也隨聲大罵。
朱全忠怒道：“汝二人安敢在朝堂之上亂咬亂罵，實乃目無君主。金瓜武士安在？”隻見朝門外湧入官軍數人，個個手持金瓜錘。朱全忠怒道：“將這二人給我金瓜擊頂！”隻見崔胤、鄭元規被按在朝堂門外，“啪！啪！”兩錘，二人被砸得腦漿迸裂，慘不忍睹。朱全忠在朝堂之上肆意胡為，嚇得群臣無人敢言。朱全忠道：“臣請陛下三月之後遷都洛陽。”昭宗嚇得哆哆嗦嗦，低聲言道：“朕準奏。”正是：
指鹿為馬臣欺君，
濫殺無辜豺獸心。
空歎社稷無明主，
卻教潑痞耍威淫。
朱全忠五萬兵馬兵臨鳳鳴關，這鳳鳴關守將名叫符道昭，蔡州人氏。符道昭望見朱全忠排兵列陣，不禁怒道：“中原賊子犯我西歧，傳令點兵出戰。”鳳鳴關上號炮三聲，門欄大開。隻見關中馬步軍分列左右，符道昭身著亮銀白虎盔，手中虎頭槊，跨下一匹金雞閃電白龍駒。符道昭揮槊嗬道：“吾乃鳳鳴關都將符道昭，爾等犯我西歧，還不早早退去。”
梁王麾下大將胡真道：“無名之士，休要狂言！”說完策馬直取符道昭，二將交陣二十迴合未分勝負。朱全忠見二人難決高下，下令鳴金收兵。
朱全忠與眾將迴到中軍大帳，胡真問道：“今日大戰，千歲因何收兵？”
朱全忠道：“今日觀這白甲之將，本王甚是心愛，欲收羅帳下，所以不忍傷其性命，意欲生擒。”
謝瞳道：“千歲莫慮，若想生擒符道昭，可施反間計。”
胡真問道：“這鳳鳴關堵塞道路，如何能使反間。”
謝瞳言道：“我觀此地有一山澗，名曰折虎澗，可令張歸霸將軍伏兵山澗之內。明日胡將軍再戰符道昭。隻可詐敗，誘其追擊。我自有計策。”
朱全忠喜道：“子明既已成竹在胸，就依此計。”眾人遂安謝瞳之策，各自準備。
次日天明，梁將胡真帶一千人馬來到關前叫戰，符道昭率三千兵馬出城應戰。胡真策馬來戰，符道昭持槊相迎。二人隻戰四五迴合，胡真便詐敗而逃。符道昭見梁兵列陣不過千人，便令左右三軍一齊追殺。胡真率一千餘人逃入折虎澗中，符道昭率兵追來。忽見山澗兩側山坡之上，梁軍大旗滿山而展，四麵伏兵殺出，梁將張歸霸山坡之上大喊：“符道昭，汝今中伏何不早降？”符道昭自知中計，便令所部兵馬撤退。張歸霸令弓弩手放箭。謝瞳則令五百士卒在山坡之上高唿：“隻射西歧人！勿傷符將軍！隻射西歧人！勿傷符將軍！”鳳鳴關將士多是西歧人氏，聞聽此言軍心渙散，且箭弩如雨，卻不見一支射向符道昭。歧軍損兵千人逃迴鳳鳴關。
歧軍將士迴到鳳鳴關中，對梁軍隻射西歧兵，不傷符道昭之事，心存疑慮。鳳鳴關有一西歧校尉名叫侯瑾，以為符道昭暗通梁軍，便逃往鳳翔報信。李茂貞一聽大怒，令大將王行瑜點將排兵討伐符道昭。
謝瞳反間計得手，等待鳳鳴關自亂。大將胡真來報：“符道昭來我營歸降。”朱全忠一聽大喜，令眾人同往轅門外迎接。隻見符道昭率領五千餘人前來歸降。朱全忠將符道昭請入中軍大帳盛宴款待。符道昭懊悔地說：“李茂貞聽信讒言起兵伐我，我隻好投至千歲麾下，萬望容留。”
朱全忠道：“符將軍能征善戰，孤王與將軍相見恨晚。將軍能順應天意傾心歸附，待迎得天子，符將軍功勞必在眾人之上。”符道昭連聲稱謝。
朱全忠過鳳鳴關，正遇西歧大將王行瑜。張歸霸大敗王行瑜，梁軍直逼鳳翔城下。
隻見鳳翔城門大開，步兵在前，騎兵在後，兵馬展開兩翼，軍中一員上將，此人紫麵膛，銅鈴眼，紅眉赤須，頭戴分水盔，身披熟圖甲，腰挎七星劍，跨下追風馬，正是鳳翔節度使李茂貞。梁軍先鋒官張歸霸出陣，鳳翔軍牙將姚旺手持三挺門扇刀迎戰。二人大戰四五個迴合，姚旺被張歸霸砍落馬下。又有戰將倪子太，手持一對束手銅人槊直取張歸霸。二人大戰六個迴合，倪子太又被砍殺。李茂貞之子李繼徽親自上陣，與張歸霸大戰十個迴合，被張歸霸打落手中槍。李繼徽慌亂之際，隻聽有人大喊“敵將休狂，大將秦陽在此！”鳳翔軍勇將秦陽手持點剛槍來戰，李繼徽趁機逃迴。張歸霸三個迴合又殺秦陽，李茂貞見張歸霸連殺三將，隻得鳴金收兵。
李茂貞直接找到昭宗，逼迫昭宗下詔命令朱溫退軍，隨後又矯詔傳檄諸道，要求各路藩鎮舉兵勤王！
麵對李茂貞的小花招，朱溫怡然不懼，他當然知道昭宗的詔書都是受李茂貞和韓全誨的逼迫，根本不打算理會。但是朱溫考慮到鳳翔鎮所岐州城防堅固，短時間怕是難以攻克，於是決定堅壁清野，揮師北上。
不多日拿下武功、邠州等地，在清掃完岐州外圍後，再度揮師將其團團圍困。
李茂貞大吃一驚，誰能想到自己也算是關中第一巨頭，在朱溫手下就跟小雞子似的，轄內堅城全被輕鬆搞定，李茂貞和韓全誨很是著急，於是躲在城中堅守不出。
時年八月，李茂貞堂弟保大節度使李茂勳率兵進駐三原，意欲解除鳳翔之圍，但不敵汴軍。
二十二日，李茂貞再一次集結全城兵力，決意出城與朱溫決戰；結果再一次大敗，汴軍趁機攻城，幾乎攻破岐州西門。
此戰之後，李茂貞閉門死守再也不敢輕易接戰。
李茂貞雖然不是朱溫的對手，但這並不妨礙他在鳳翔大耍權臣威風，肆意淩虐昭宗和他的宮廷。
一次宴會上李茂貞酒至酣時，竟然以巨杯勸帝酒；昭宗不想喝，李茂貞舉杯叩帝頤頷！如此跋扈，董卓、曹操也不遑多讓！
戰爭如火如荼地進行著，時間也到了雨季，連日陰雨連綿，汴軍士兵大多發病，而鳳翔軍堅守城池，始終不肯出城作戰。朱溫看短時間內難以攻破城池便有意退兵，但是遭到部將高季昌、劉知俊的強烈反對，二人表示：“咱們困難，鳳翔也困難，此時撤軍前功盡棄，依我之見大帥應該派間諜混入城中，用計誘騙李茂貞出城！”
朱溫同意了二人的請求，這時候有個叫馬景的士兵主動提出要去當間諜，他對朱溫說：“我去必死無疑，但求大王能夠善待我的妻子兒女。”
馬景甘為炮灰的精神讓朱溫深受感動，朱溫表示你放心去死吧，其他事情無需多慮。
馬景便騎著大馬直奔鳳翔，入城後他對李茂貞說道：“汴軍已經撤兵了，大營中隻有一萬多老弱病殘，今夜也將離去。”
李茂貞白天也看見大隊人馬出了汴軍營盤，便對馬景的話信以為真，當即決定趁夜劫營。
是夜鳳翔軍傾巢而出，偷襲汴軍大營，朱溫見李茂貞中計，立即敲響營中戰鼓，伏兵盡出猛攻鳳翔軍，此外又派遣數百精兵死守岐州城門。鳳翔軍進退兩難，自相踐踏死傷無算，李茂貞拚盡全力才僥幸逃迴城中，此後再也不敢應戰。
大勝過後朱溫再次命令汴軍大舉攻城晝夜不停，攻城者嘴裏叫罵城中是“劫天子賊”，守城者則反懟城外是“奪天子賊”，雙方連打帶罵熱火朝天.
朱溫將鳳翔重重包圍了一年多，可怕的災難降臨到城裏所有人的頭上。隨著原有的存糧耗盡，城中出現了粒米粒金的行情。饑餓的官兵開始瘋狂洗劫城市，掘地三尺也要搜出口糧。不少人也拷掠百姓勒索財物，將除了王府邸外的其他建築摧毀。部分貪婪官吏明知道城中糧貴，還以5兩10石的價格向城中殷實家庭征糧。如果交不出這麽多糧食，就要以每石300兩的代價償付。最後弄得城中所有富戶破產，普通中產也陷入赤貧。
守城官兵和富戶尚且如此，一般百姓更是闔家等死。因為城中缺糧不是奸商囤積所致，所以掏出畢生積蓄也無法買到食物。他們隻得將樹皮與樹根夾雜著爛棉花食用。
李茂貞覺得再也難以與朱全忠相爭，其子李繼徽道：“厭惡朱全忠之人並非當今萬歲，而是韓全誨一幫閹黨。與朱全忠長此以往，對我西歧不利。”
李茂貞道：“繼徽之言，莫非要誅殺閹黨，以退朱全忠大兵。”
李繼徽道：“父帥與朱全忠動兵，上無天子決心，下無諸侯響應。若剿滅閹官送萬歲還京。萬歲必然不會怪罪父親，朱全忠自然也會退兵。”李茂貞便遣密使往朱全忠大營求和，並願緝拿挾持皇帝的大太監。朱全忠之心全在劫持皇帝，並無心奪取西歧，便說隻要李茂貞緝拿閹黨，送迴禦駕後自己便班師迴朝。
天複三年（903年）正月初六，李茂貞在得到昭宗首肯後，抓捕了韓全誨、張彥弘、袁易簡、周敬容等四名宦首，隨後又抓捕了參與劫持昭宗的李繼筠、李繼誨等十六人，全部推出斬首。
次日，昭宗派近臣韓偓和趙國夫人將二十顆大好頭顱送到朱溫帥賬，並給朱溫傳詔道：“過去脅留車駕、離間君臣的就是這些人；現在這些人已經被朕和李茂貞殺了，你可以宣諭諸軍以解眾憤。”
朱溫拜詔奉旨，但遲遲沒有撤去圍困鳳翔的大軍，李茂貞此時已經心亂如麻，朱溫遲遲不走莫非想吞並鳳翔？得馬上和崔胤搞好關係了！
李茂貞奏請昭宗盡快將崔胤召到鳳翔接他迴宮，昭宗自己也急著要迴去，於是三番四次給崔胤傳詔，言辭懇切稱已經恢複了他的全部官職，命他盡快前來鳳翔接駕。
但是崔胤卻稱病不來，昭宗沒辦法，隻能叫朱溫給他去信。朱溫寫信半開玩笑地說：“我沒見過天子，你來幫我認認？”接到朱溫的書信崔胤的病馬上就好了，一路風馳電掣地趕到鳳翔。
二十二日雙方談妥一切事務，李茂貞大開城門放昭宗出城，朱溫則一身素服站在城外請罪。昭宗趕快派使臣宣讀赦免朱溫一切罪過的詔書，並撤去身邊親、勳、翊三衛儀仗，獨留金吾將軍前去報平安。
這是朱溫第一次見到昭宗，見麵之後朱溫立即跪倒在地，雙眼含淚像極了一個忠臣，昭宗也不免感動，君臣二人哭成一片。
昭宗將朱溫扶起來後對他說道：“大唐江山多虧愛卿才能再次平安，就連朕的性命也多虧愛卿才得以保全。”說著還把腰上的玉帶解下來賜給朱溫。
二人休息片刻後開始上路，朱溫為了表示他對昭宗的忠誠，單槍匹馬在隊伍前方引導了十多裏路，隨後又讓朱友倫領兵護衛，自己則留下處理善後工作。當天晚上昭宗夜宿岐山，第二天崔胤率文武百官於興平接駕，昭宗正式恢複其官職。
昭宗在朱溫的“保護”下迴到長安。
朱溫迴師中原後，鳳翔節度使李茂貞和邠州節度使楊崇本又開始偷偷摸摸地算計起來，甚至屢次出兵靠近京畿附近。
楊崇本其人來曆不明，自幼便被李茂貞收為養子，後來被李茂貞表為邠州節度使，他也算是李茂貞手下的紅人。
朱溫討伐李茂貞時，期間率部攻打邠州，楊崇本表示願意投降，朱溫欣然同意，並仍然讓他作為邠州節度使。
事兒到這兒也就過去了，楊崇本換了個一等一的大腿抱，官帽子也沒丟，其實並沒有什麽損失。
可是有句話怎麽說來著？不怪兄弟不是人，隻怪弟妹太迷人，不知道怎麽著朱溫看上了楊崇本的老婆，當場就把楊崇本的老婆給霍霍了。
楊崇本衝冠一怒，立即聯係李茂貞，誓要報辱妻之仇。
倆人約定一同舉兵進軍京畿，朱溫一聽立即從中原返迴關中，李茂貞楊崇本馬上又嚇得帶兵退走。
卻說朱溫將昭宗控製住之後，滿心想的都是怎麽篡位登基，誰敢攔路就弄死誰；而崔胤雖然和朱溫勾結緊密，但他想的卻是能獨攬朝中大權，做一個名噪一時的權臣.
當時崔胤可判六軍十二衛事，但是真正的掌權人還是朱溫，崔胤手中沒有一兵一卒可為自己所用，崔胤於是想到了一個絕好的主意。
朱溫前腳剛到汴州，後腳就收到崔胤的一封信，信中稱西邊的李茂貞近在眼前，不得不防，但我手中並無兵權，無法防範，所以崔胤請朱溫批準自己新建一支軍隊，在原有的朝廷禁軍左右龍武、羽林、神策六軍中設置四個步兵統領，每個統領統兵250人，加設騎兵統領掌兵100，再加上機關要衝大約需要6000多人。
朱溫一下子就看穿了崔胤的花花腸子，但此時前方鑼鼓喧天，朱溫並不想朝中出什麽亂子，也就假意同意了崔胤的建軍請求。
朱溫派出大量的心腹前往投奔，崔胤根本想不到朱溫會跟自己來陰的，對此並無防範，朱溫派出的將士幾乎都被崔胤選中，還給安排了重要崗位。
如此一來，崔胤組建的這支新軍就被朱溫架空了，崔胤對此毫不知情，反而興衝衝地加緊操練，還任命京兆尹鄭元規為六軍諸衛副使，心腹陳班為威遠軍使。
不過這一切都在朱溫的掌控之中，朱溫並沒有對他采取措施，而是靜觀其變。
到了當年十月，突然發生了一起意外事件，朱溫留在京城的侄子朱友倫在打馬球時莫名其妙墜馬身亡，消息傳來朱溫悲痛萬分。
朱友倫是朱溫二哥朱存的兒子，朱存和朱溫一同投軍，後來在跟隨黃巢轉戰嶺南時戰死，留下的兩個孩子朱友寧和朱友倫都被朱溫當做親生兒子看待，不久前朱友寧與王師範作戰身亡，現在朱友倫又這樣不清不楚地死亡，二哥朱存算是絕後了，這讓朱溫難以接受。
盛怒之下朱溫懷疑是崔胤為了控製京城宿衛，所以暗中派人害死朱友倫，此時真相已經不重要了，隻要朱溫有這種想法，崔胤的命運也就注定了。
朱溫見昭宗的兒子德王李裕年齡已大，要是德王繼承了皇位，一定會成為自己篡位的障礙。他有次偷偷對宰相崔胤說，李裕曾被宦官擁立為帝，這種人怎麽還能留著？你應該勸天子將他殺掉！崔胤將此話轉告昭宗，昭宗又詢問朱溫，朱溫道：“這是你們的家事，為臣豈敢議論？崔胤沒安好心，想把臣賣了！”
昭宗表麵上不動聲色，不過心裏很清楚，想殺德王的就是朱溫！他有次隨口對蔣玄暉說：“德王是我的愛子，朱溫為什麽要殺他呢？”蔣玄暉立即將這些情況匯報給了朱溫。
朱全忠帳下文武之中，惟養子朱友恭心眼最多，且心胸陰險。有次朱全忠對朱友恭說：“當今聖上對孤王已經心生怨恨，我兒可有良策？”
朱友恭言道：“父王何不來個敲山震虎，殺雞儆猴。”
朱全忠問道：“此話怎講？”
朱友恭言道：“長安宮廷之中，多有萬歲身邊耳目，父王可奏請遷都洛陽，使萬歲再無依賴之人。若有不願遷都者，必是異心之人，父王將其處死。此乃一舉兩得。”
朱全忠點頭道：“吾兒妙計，明日我便奏請皇上遷都。”
次日朱全忠入朝奏道：“臣啟陛下，長安貴為大唐之都，曆經黃巢賊寇作亂，百姓不耕種，商賈不往來，實乃頹廢之兆也，臣請陛下遷都洛陽。”昭宗現在想躲朱全忠都躲不開，一聽遷都更是不情願。宰相崔胤看了朱全忠一眼，對昭宗道：“臣以為陛下不可遷都，想我高祖皇帝在長安開基，傳帝十九世，祖先開基寶地豈可變更。”
京兆尹鄭元規也隨聲奏道：“崔丞相所言極是，長安自漢代便是龍脈祥瑞之地，萬不可違背祖製。”朱全忠見崔、鄭二人反駁遷都之事，從此懷恨在心。
退朝之後，朱全忠命養子朱友恭率一千人馬分別查抄崔胤、鄭元規二人府第。等到次日早朝，昭宗見崔胤、鄭元規未曾上朝，便問朱全忠道：“梁王，今日崔胤與鄭元規二位愛卿為何不來早朝？”
朱全忠答道：“崔、鄭二人犯下謀逆之罪，臣已將二人緝拿。”遂命朱友恭將崔胤與鄭元規押上朝堂。崔胤一看朱全忠就罵道：“朱全忠你這個亂臣賊子，顛倒黑白指鹿為馬，一定不得好死。”鄭元規也隨聲大罵。
朱全忠怒道：“汝二人安敢在朝堂之上亂咬亂罵，實乃目無君主。金瓜武士安在？”隻見朝門外湧入官軍數人，個個手持金瓜錘。朱全忠怒道：“將這二人給我金瓜擊頂！”隻見崔胤、鄭元規被按在朝堂門外，“啪！啪！”兩錘，二人被砸得腦漿迸裂，慘不忍睹。朱全忠在朝堂之上肆意胡為，嚇得群臣無人敢言。朱全忠道：“臣請陛下三月之後遷都洛陽。”昭宗嚇得哆哆嗦嗦，低聲言道：“朕準奏。”正是：
指鹿為馬臣欺君，
濫殺無辜豺獸心。
空歎社稷無明主，
卻教潑痞耍威淫。