進城後，朱棣出榜安民，祭高皇帝陵，準備登基，準備工作主要就是處理建文舊臣。前麵已講，隋唐五代就已進入職業公務員時代，朱家兩叔侄搶天下，大家隻不過拿了工資各為其主。現在叔叔搶贏了，那麽兩撥人的工資就都該你一個人開了。盛庸、平安這些人幾天前還拚著命想把燕逆弄死，但下個月太宗還得往他們帳上打錢。尤其是李景隆，堪稱靖難第一功臣，後來確實混成了首相。地方官更絕少反對新皇帝，反正他們隻聽朝廷的命令，至於朝廷是誰在操控，那就不該他們操心了。
當然，也有極小一撮建文帝的心腹。朱棣宣布了齊泰、黃子澄、方孝孺等五十餘“奸黨”，這些人大多已自殺殉君，其餘也多被誅族。例外的是讓朱棣吃盡苦頭的徐輝祖，他沒有喜迎姐夫進城，而是跑到徐達的祠堂。姐夫很生氣，派人把他抓起來，他寫了一份供詞，說明其父的功勳以及明太祖所賜免死鐵券。朱棣氣得哇哇大叫，但也不能違背免死鐵券，最後削除他魏國公爵位，軟禁至死。當然，也有一些陰謀論者認為徐家兩兄弟是在兩邊下注。後來徐輝祖、徐增壽兩支後裔均世襲公爵，成為明朝最顯赫的一個世家。
進城前，僧道衍曾向朱棣提出，建文帝的心腹都得殺，但不能殺方孝孺，否則“天下讀書種子絕矣”。方孝孺是當時最負盛名的儒士，朝廷討燕的詔檄均出自他的手筆。僧道衍不殺他，既是為了保留讀書種子，更重要的是想讓他草擬即位詔書，帶頭示範，讓原本反對朱棣的士人歸心。
朱棣召來方孝孺，據說人還沒到，悲慟之聲已充塞殿陛。朱棣等他哭夠了，親自下階說：“先生不要自苦，我隻不過是想效法周公輔成王罷了。”這人也不知是文化太低還是臉皮太厚，居然把鐵鉉教訓他的材料拿來當說辭。
方孝孺說：“那成王何在？”
朱棣說：“他自焚死了。”
方孝孺又說：“那為何不立成王之子？”
朱棣連忙擺手：“國賴長君，他才幾歲，怎麽行！”
方孝孺又說：“那為何不立成王的弟弟？”
方孝孺雖學富五車，但辯論水平也不怎麽高，說到這裏其實已經說錯了——既然可以立建文帝的弟弟，那又為何不能立朱標的弟弟？如果朱棣這樣接過來，方孝孺就吃癟了。可惜朱棣的辯論水平更差，氣急敗壞地說：“這是我家事，不要你管！”朱棣把紙筆塞給方孝孺：“詔天下，非先生不可！”方孝孺投筆於地，哭罵道：“死即死耳，詔不可草！”朱棣終於忍不住了，下令磔殺方孝孺。方孝孺慷慨就義，留《絕命賦》一首：
天降亂離兮，孰知其由；三綱易位兮，四維不修；骨肉相殘兮，至親為仇；奸臣得計兮，謀國用猶；忠臣發憤兮，血淚交流；以此殉君兮，抑又何求？嗚唿哀哉兮，庶不我尤！
方孝孺一介書生，不畏強權，堅持忠誠與正義，廣受後世讚揚。明太宗恨死了他，甚至死後還禁傳他的文章，但明太宗駕崩當年，明仁宗（朱高熾，年號洪熙）繼位，尚未改元，便立即做了一件忤逆先皇的大事：為方孝孺昭雪，不但允許他的文集出版，還釋放了許多被流放的方孝孺親屬。百餘年後，明神宗（朱翊鈞，年號萬曆）在南京為建文忠臣立表忠祠，以徐輝祖居首，方孝孺次之。
明太宗登基後又把鐵鉉抓來，鐵鉉不願北麵見他（以臣見君），於是背對著他，坐在廷中謾罵燕逆。燕逆很生氣，要他轉過身來，但鐵鉉就是不給他這點基本的尊重。最後，明太宗將其磔殺，年僅三十六歲。明代中葉濟南府便在濟南立七忠祠，紀念鐵鉉等七位反抗朱棣的忠臣。故鄉鄧州（今屬河南）更為鐵鉉和唐朝在安史之亂中英勇獻身的另一位鄧州忠臣張巡（也可能是河東人）合立雙忠祠。清代更在大明湖畔建立著名的鐵公祠，成為濟南一景。
盡管職業公務員不幹涉皇室私事，但皇室無私事，篡位甚至打仗早已上升到公共利益層麵。公務員有義務維持正當的公共秩序，忠孝觀念便是維繫社會正常運轉的基礎。盡管盛庸、平安在力戰後降燕無可厚非，但徐輝祖、方孝孺、鐵鉉為現任皇帝盡忠更值得讚頌。不要說什麽愚忠於封建君主之類的話，他們跟年輕的建文帝並無私交，也不是他的私有附庸，隻是因為建文帝已經當上皇帝，那麽作為大臣就有義務維護這種既有的體係而不是任由野心家挑起戰爭。皇帝是公共秩序的總代表，忠孝觀念要求國家公務員竭忠盡死，維護在位皇帝，絕非維護他個人，而是維護關係天下蒼生的公共秩序。徐輝祖、方孝孺雖是敗者，但毫無疑問他們並不成寇，而是連明太宗嫡傳子孫也承認的王道，勝者明太宗反而扮演了不甚光彩的角色。
以上幾段采自《明史》，塑造了方孝孺、鐵鉉這樣光輝正義的儒士形象，但按某些資料以及現代主流說法，這幾段都還光輝得不夠。
先說鐵鉉，更著名的說法是明太宗將他鼻子、耳朵割下來塞進他嘴裏，還問他好不好吃。鐵鉉怒目道：“忠臣孝子之肉，怎麽不好吃！”明太宗又說你活著不拜我，我把你用油鍋炸了你也得拜我。但燕軍炸死鐵鉉後發現其骨架仍然背對著太宗，他們想把骨架翻過來，油鍋竟然爆炸了！明太宗仍不得鐵鉉的骨架一拜！
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當然，也有極小一撮建文帝的心腹。朱棣宣布了齊泰、黃子澄、方孝孺等五十餘“奸黨”，這些人大多已自殺殉君，其餘也多被誅族。例外的是讓朱棣吃盡苦頭的徐輝祖，他沒有喜迎姐夫進城，而是跑到徐達的祠堂。姐夫很生氣，派人把他抓起來，他寫了一份供詞，說明其父的功勳以及明太祖所賜免死鐵券。朱棣氣得哇哇大叫，但也不能違背免死鐵券，最後削除他魏國公爵位，軟禁至死。當然，也有一些陰謀論者認為徐家兩兄弟是在兩邊下注。後來徐輝祖、徐增壽兩支後裔均世襲公爵，成為明朝最顯赫的一個世家。
進城前，僧道衍曾向朱棣提出，建文帝的心腹都得殺，但不能殺方孝孺，否則“天下讀書種子絕矣”。方孝孺是當時最負盛名的儒士，朝廷討燕的詔檄均出自他的手筆。僧道衍不殺他，既是為了保留讀書種子，更重要的是想讓他草擬即位詔書，帶頭示範，讓原本反對朱棣的士人歸心。
朱棣召來方孝孺，據說人還沒到，悲慟之聲已充塞殿陛。朱棣等他哭夠了，親自下階說：“先生不要自苦，我隻不過是想效法周公輔成王罷了。”這人也不知是文化太低還是臉皮太厚，居然把鐵鉉教訓他的材料拿來當說辭。
方孝孺說：“那成王何在？”
朱棣說：“他自焚死了。”
方孝孺又說：“那為何不立成王之子？”
朱棣連忙擺手：“國賴長君，他才幾歲，怎麽行！”
方孝孺又說：“那為何不立成王的弟弟？”
方孝孺雖學富五車，但辯論水平也不怎麽高，說到這裏其實已經說錯了——既然可以立建文帝的弟弟，那又為何不能立朱標的弟弟？如果朱棣這樣接過來，方孝孺就吃癟了。可惜朱棣的辯論水平更差，氣急敗壞地說：“這是我家事，不要你管！”朱棣把紙筆塞給方孝孺：“詔天下，非先生不可！”方孝孺投筆於地，哭罵道：“死即死耳，詔不可草！”朱棣終於忍不住了，下令磔殺方孝孺。方孝孺慷慨就義，留《絕命賦》一首：
天降亂離兮，孰知其由；三綱易位兮，四維不修；骨肉相殘兮，至親為仇；奸臣得計兮，謀國用猶；忠臣發憤兮，血淚交流；以此殉君兮，抑又何求？嗚唿哀哉兮，庶不我尤！
方孝孺一介書生，不畏強權，堅持忠誠與正義，廣受後世讚揚。明太宗恨死了他，甚至死後還禁傳他的文章，但明太宗駕崩當年，明仁宗（朱高熾，年號洪熙）繼位，尚未改元，便立即做了一件忤逆先皇的大事：為方孝孺昭雪，不但允許他的文集出版，還釋放了許多被流放的方孝孺親屬。百餘年後，明神宗（朱翊鈞，年號萬曆）在南京為建文忠臣立表忠祠，以徐輝祖居首，方孝孺次之。
明太宗登基後又把鐵鉉抓來，鐵鉉不願北麵見他（以臣見君），於是背對著他，坐在廷中謾罵燕逆。燕逆很生氣，要他轉過身來，但鐵鉉就是不給他這點基本的尊重。最後，明太宗將其磔殺，年僅三十六歲。明代中葉濟南府便在濟南立七忠祠，紀念鐵鉉等七位反抗朱棣的忠臣。故鄉鄧州（今屬河南）更為鐵鉉和唐朝在安史之亂中英勇獻身的另一位鄧州忠臣張巡（也可能是河東人）合立雙忠祠。清代更在大明湖畔建立著名的鐵公祠，成為濟南一景。
盡管職業公務員不幹涉皇室私事，但皇室無私事，篡位甚至打仗早已上升到公共利益層麵。公務員有義務維持正當的公共秩序，忠孝觀念便是維繫社會正常運轉的基礎。盡管盛庸、平安在力戰後降燕無可厚非，但徐輝祖、方孝孺、鐵鉉為現任皇帝盡忠更值得讚頌。不要說什麽愚忠於封建君主之類的話，他們跟年輕的建文帝並無私交，也不是他的私有附庸，隻是因為建文帝已經當上皇帝，那麽作為大臣就有義務維護這種既有的體係而不是任由野心家挑起戰爭。皇帝是公共秩序的總代表，忠孝觀念要求國家公務員竭忠盡死，維護在位皇帝，絕非維護他個人，而是維護關係天下蒼生的公共秩序。徐輝祖、方孝孺雖是敗者，但毫無疑問他們並不成寇，而是連明太宗嫡傳子孫也承認的王道，勝者明太宗反而扮演了不甚光彩的角色。
以上幾段采自《明史》，塑造了方孝孺、鐵鉉這樣光輝正義的儒士形象，但按某些資料以及現代主流說法，這幾段都還光輝得不夠。
先說鐵鉉，更著名的說法是明太宗將他鼻子、耳朵割下來塞進他嘴裏，還問他好不好吃。鐵鉉怒目道：“忠臣孝子之肉，怎麽不好吃！”明太宗又說你活著不拜我，我把你用油鍋炸了你也得拜我。但燕軍炸死鐵鉉後發現其骨架仍然背對著太宗，他們想把骨架翻過來，油鍋竟然爆炸了！明太宗仍不得鐵鉉的骨架一拜！
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