建文四年，這一年的五月，朱棣已經準備進軍泗州了，泗州是現在江蘇淮安盱眙和江蘇宿遷泗洪一帶，了解地理的朋友應該知道，這裏距離南京已經不遠了，在泗州不遠處有一條著名的河流---淮河，我們知道地理學家把長江與黃河之間的秦嶺、淮河看作是中國東部地區的一條南北方分界線。也就是說，隻要打過淮河，基本上就可以說是打入了南京，徹底擊潰朱允炆了。
此時的建文帝已經沒有心思再去和徐妙錦卿卿我我了，在這生死存亡之際，必須要有所作為了，既然已經想清楚不能議和，那就得打。隨即命令大將盛庸前去應敵，盛庸在此之前已經多次擊敗燕王，甚至朱允炆還賜予他平燕將軍的官職，而現在盛庸和朱棣又一次要相遇了，盛庸的做法就是屯軍在泗州城邊上的淮河南岸，騎兵和步兵加起來上萬人，還有戰船數千隻，就在淮河南岸守株待兔，靜靜地等待著朱棣的到來，想著一網打盡。
朱棣來到了淮河北岸，看到南岸的這個架勢立馬意識到了根本打不過，就算勉強打過了也是慘勝，而且還知道了有盛庸這等名將在，硬攻根本不可能，迴到營地好好地想了想，想到了一個好辦法。明處朱棣找了一些小船和竹筏，揚旗呐喊，鼓噪雷鳴，裝作強渡淮河的樣子，暗處朱棣派手下心腹朱能和丘福率領輕騎向西而行，在盛庸所率領軍隊看不到的地方悄悄地度過淮河，然後進行偷襲。
就在盛庸專心致誌的對付那些小船和竹筏之時，身後突然來了一把劍，一把鋒利無比的劍，那就是朱能丘福所率領的燕軍精銳輕騎，狠狠地插在了盛庸軍隊的心髒上，絲毫沒有反抗的機會，盛庸軍隊的官兵們頓時丟盔棄甲四處逃竄。而此時的盛庸也懵了，怎麽也想不到這一群人是怎麽過來的，時間不會給他太多，也不可能讓他想通，《明史紀事本末》中是這樣說的，庸股栗不能上馬，其下掖之登舟，單舸脫去。這句話什麽意思呢，就是說盛庸的大腿發抖，已經不能再騎馬了，他的部下扶著他上了一艘船，然後逃了出去。經過盛庸逃跑之後，軍隊大亂，無心再作戰了，雖然盛庸逃了一命，但是他的所有船隻都被朱棣沒收了，朱棣就用這幾千艘的戰船將自己的燕軍都送到了淮河的南岸，當天下午，燕軍就已經攻下了泗州。
攻下泗州之後，乘著軍心大振，朱棣立馬召集自己身邊的謀臣武將，討論如何攻入南京，有人提出從鳳陽走，有人提出從淮安走，都是都被朱棣否決了，雖然從整體的局勢來看，建文帝好像是一直處於弱勢，但是這兩個城池的守軍還是很厲害的，一個是鎮守鳳陽的都督同知孫嶽，另一個是固守淮安的駙馬都尉梅殷。孫嶽從朱棣開始靖難的時候，他就開始防禦工作了，為了抵禦朱棣的到來做了充足的準備，另一位梅殷，他娶朱元璋次女寧國公主，任駙馬都尉，加封榮國公。受到了朱元璋的遺詔，奉命保護朱允炆，某種程度來說，梅殷才是真正的顧命大臣，但是朱允炆卻不願意重用梅殷，直到建文三年，朱棣將北方弄的是天翻地覆，朱允炆才想起來自己還有一個姑父梅殷可以重用，隨即命梅殷鎮守淮安。
建文四年的時候，朱棣已經不停地向南進軍了，但是朝中大部分人根本不是燕王的對手，都是牆頭草，處於觀望的狀態，根本不敢主動上書說我可以打敗朱棣如何如何，這就逼得朱允炆招民兵，雖說號稱有四十萬但是應該沒有這麽多。朱允炆的計策是很聰明的，因為從北平到南京最快捷的方法就是取道山東的德州、濟南和江蘇的淮安一線，所以朱允炆在德州安排了盛庸，在濟南安排了鐵鉉，在淮安又安排了梅殷，現在隻有梅殷還沒有和朱棣交手了，機會來了，梅殷帶著四十萬大軍和朱棣要開始決戰了。
其實在靈壁之戰之後，朱棣就想過從淮安去南京，所以派遣使者送信給梅殷，說是想著去給朱元璋上香，但是被梅殷迴絕了，理由是朱元璋自己說過，誰要是來南京上香就是不孝。梅殷用高皇帝的遺詔揭穿了朱棣的謊言，朱棣接到信之後很是生氣，隨即說了實話。“今興兵除君側惡，天命有歸，非人所能阻。”意思就是我今天清君側，是天命，不是認為可以阻止的。梅殷看到了之後把使者的鼻子耳朵都割了，並且對信使說，我留了你一條命，為的是殿下的君臣大義。朱棣聽聞了很是生氣，卻又無可奈何。
迴到故事的主線來，該從哪條路去南京都不合適，鳳陽和淮安的軍事態勢根本不能如朱棣所想，隻能選擇另外一條道路了，從泗州出發，渡過淮河直趨揚州；同時派手下的吳玉給揚州衛指揮王禮送去招降手諭。揚州的王禮、王宗本不是什麽好東西，他們聽說燕軍要來揚州，就謀害了堅決主戰的禦史王彬和指揮崇剛，打開揚州城門，迎接燕軍入城。
建文四年六月初一，燕軍進攻南京北大門——浦子口，浦子口就是今天的浦口區，這個地方和下關隔江相對，隻要攻入了浦口，南京的大門就打開了，此時的建文帝身邊都是嘴上說說的文臣，根本沒有武將可以鎮守，無奈之下，他又重新啟用了從淮河逃迴來的盛庸。這一次，朱棣沒有使用任何計謀，直接進攻，雖說盛庸久經沙場，英勇無比，但是也無法抵擋燕軍瘋子一樣的打法，最終南京城完全的暴露在燕軍的眼下。
浦口之戰失敗後，建文帝決定讓掌管長江水師的都督僉事陳瑄趕緊去援助盛庸，建文帝認為長江天塹與燕軍對抗，燕軍不會贏得太輕鬆，可是沒想到的是陳瑄並未執行建文帝命令，而是跑到了燕軍那裏，投降了朱棣。這個時候，朱允炆已經孤立無援了，建文四年六月十三日，朱棣發起了總攻，鎮守金川門的穀王朱橞和李景隆利用職務之便，打開城門，放燕軍進了南京。。
自此南京已經可以說是不在朱允炆的手中了。
京師遂破，燕軍進了南京城，朱允炆的部下奮力抵抗，在一場場混戰中，南京城突然起火了，在火勢撲滅之後發現了幾具燒焦了的殘骸，無法辨認，同時也找不到朱允炆的蹤影，朱棣在這幾具屍體前看了很久很久，不曾說一句話，據太監說它們是皇帝、皇後和他的長子朱文奎的屍體，即使朱棣不相信卻也沒有辦法，而現在的問題不是這幾具無法辨認的殘骸裏有沒有朱允炆了，而是最重要的皇位問題該如何處理。
此時的建文帝已經沒有心思再去和徐妙錦卿卿我我了，在這生死存亡之際，必須要有所作為了，既然已經想清楚不能議和，那就得打。隨即命令大將盛庸前去應敵，盛庸在此之前已經多次擊敗燕王，甚至朱允炆還賜予他平燕將軍的官職，而現在盛庸和朱棣又一次要相遇了，盛庸的做法就是屯軍在泗州城邊上的淮河南岸，騎兵和步兵加起來上萬人，還有戰船數千隻，就在淮河南岸守株待兔，靜靜地等待著朱棣的到來，想著一網打盡。
朱棣來到了淮河北岸，看到南岸的這個架勢立馬意識到了根本打不過，就算勉強打過了也是慘勝，而且還知道了有盛庸這等名將在，硬攻根本不可能，迴到營地好好地想了想，想到了一個好辦法。明處朱棣找了一些小船和竹筏，揚旗呐喊，鼓噪雷鳴，裝作強渡淮河的樣子，暗處朱棣派手下心腹朱能和丘福率領輕騎向西而行，在盛庸所率領軍隊看不到的地方悄悄地度過淮河，然後進行偷襲。
就在盛庸專心致誌的對付那些小船和竹筏之時，身後突然來了一把劍，一把鋒利無比的劍，那就是朱能丘福所率領的燕軍精銳輕騎，狠狠地插在了盛庸軍隊的心髒上，絲毫沒有反抗的機會，盛庸軍隊的官兵們頓時丟盔棄甲四處逃竄。而此時的盛庸也懵了，怎麽也想不到這一群人是怎麽過來的，時間不會給他太多，也不可能讓他想通，《明史紀事本末》中是這樣說的，庸股栗不能上馬，其下掖之登舟，單舸脫去。這句話什麽意思呢，就是說盛庸的大腿發抖，已經不能再騎馬了，他的部下扶著他上了一艘船，然後逃了出去。經過盛庸逃跑之後，軍隊大亂，無心再作戰了，雖然盛庸逃了一命，但是他的所有船隻都被朱棣沒收了，朱棣就用這幾千艘的戰船將自己的燕軍都送到了淮河的南岸，當天下午，燕軍就已經攻下了泗州。
攻下泗州之後，乘著軍心大振，朱棣立馬召集自己身邊的謀臣武將，討論如何攻入南京，有人提出從鳳陽走，有人提出從淮安走，都是都被朱棣否決了，雖然從整體的局勢來看，建文帝好像是一直處於弱勢，但是這兩個城池的守軍還是很厲害的，一個是鎮守鳳陽的都督同知孫嶽，另一個是固守淮安的駙馬都尉梅殷。孫嶽從朱棣開始靖難的時候，他就開始防禦工作了，為了抵禦朱棣的到來做了充足的準備，另一位梅殷，他娶朱元璋次女寧國公主，任駙馬都尉，加封榮國公。受到了朱元璋的遺詔，奉命保護朱允炆，某種程度來說，梅殷才是真正的顧命大臣，但是朱允炆卻不願意重用梅殷，直到建文三年，朱棣將北方弄的是天翻地覆，朱允炆才想起來自己還有一個姑父梅殷可以重用，隨即命梅殷鎮守淮安。
建文四年的時候，朱棣已經不停地向南進軍了，但是朝中大部分人根本不是燕王的對手，都是牆頭草，處於觀望的狀態，根本不敢主動上書說我可以打敗朱棣如何如何，這就逼得朱允炆招民兵，雖說號稱有四十萬但是應該沒有這麽多。朱允炆的計策是很聰明的，因為從北平到南京最快捷的方法就是取道山東的德州、濟南和江蘇的淮安一線，所以朱允炆在德州安排了盛庸，在濟南安排了鐵鉉，在淮安又安排了梅殷，現在隻有梅殷還沒有和朱棣交手了，機會來了，梅殷帶著四十萬大軍和朱棣要開始決戰了。
其實在靈壁之戰之後，朱棣就想過從淮安去南京，所以派遣使者送信給梅殷，說是想著去給朱元璋上香，但是被梅殷迴絕了，理由是朱元璋自己說過，誰要是來南京上香就是不孝。梅殷用高皇帝的遺詔揭穿了朱棣的謊言，朱棣接到信之後很是生氣，隨即說了實話。“今興兵除君側惡，天命有歸，非人所能阻。”意思就是我今天清君側，是天命，不是認為可以阻止的。梅殷看到了之後把使者的鼻子耳朵都割了，並且對信使說，我留了你一條命，為的是殿下的君臣大義。朱棣聽聞了很是生氣，卻又無可奈何。
迴到故事的主線來，該從哪條路去南京都不合適，鳳陽和淮安的軍事態勢根本不能如朱棣所想，隻能選擇另外一條道路了，從泗州出發，渡過淮河直趨揚州；同時派手下的吳玉給揚州衛指揮王禮送去招降手諭。揚州的王禮、王宗本不是什麽好東西，他們聽說燕軍要來揚州，就謀害了堅決主戰的禦史王彬和指揮崇剛，打開揚州城門，迎接燕軍入城。
建文四年六月初一，燕軍進攻南京北大門——浦子口，浦子口就是今天的浦口區，這個地方和下關隔江相對，隻要攻入了浦口，南京的大門就打開了，此時的建文帝身邊都是嘴上說說的文臣，根本沒有武將可以鎮守，無奈之下，他又重新啟用了從淮河逃迴來的盛庸。這一次，朱棣沒有使用任何計謀，直接進攻，雖說盛庸久經沙場，英勇無比，但是也無法抵擋燕軍瘋子一樣的打法，最終南京城完全的暴露在燕軍的眼下。
浦口之戰失敗後，建文帝決定讓掌管長江水師的都督僉事陳瑄趕緊去援助盛庸，建文帝認為長江天塹與燕軍對抗，燕軍不會贏得太輕鬆，可是沒想到的是陳瑄並未執行建文帝命令，而是跑到了燕軍那裏，投降了朱棣。這個時候，朱允炆已經孤立無援了，建文四年六月十三日，朱棣發起了總攻，鎮守金川門的穀王朱橞和李景隆利用職務之便，打開城門，放燕軍進了南京。。
自此南京已經可以說是不在朱允炆的手中了。
京師遂破，燕軍進了南京城，朱允炆的部下奮力抵抗，在一場場混戰中，南京城突然起火了，在火勢撲滅之後發現了幾具燒焦了的殘骸，無法辨認，同時也找不到朱允炆的蹤影，朱棣在這幾具屍體前看了很久很久，不曾說一句話，據太監說它們是皇帝、皇後和他的長子朱文奎的屍體，即使朱棣不相信卻也沒有辦法，而現在的問題不是這幾具無法辨認的殘骸裏有沒有朱允炆了，而是最重要的皇位問題該如何處理。