黑水經略李旦奉命組織兩萬黑水經略府大軍從鬆花總管府大舉進攻臣服於努爾哈赤的烏拉、錫伯、卦爾察三部，大敗駐守烏拉部的舒爾哈齊一萬後金兵馬，攻占烏拉部，錫伯部、卦爾察部忙主動請降歸順臣服。
陳衝、納林布祿率三萬大軍橫掃葉赫部故地，與李旦率領的兩萬黑水經略府大軍匯合，隨即南下進攻輝發、哈達兩部，接連攻破哈達部各城寨，輝發部貝勒拜音達裏與其子趁機組織兩千部眾反攻退守輝發部的舒爾哈齊三千餘後金兵，拜音達裏父子不敵兵敗反遭舒爾哈齊率兵屠殺，舒爾哈齊在輝發部大開殺戒，將拜音達裏全族悉數殺光，以震懾輝發部反抗。
陳忠同邊備使元均、朱舍裏部部長裕楞額率一萬餘大軍大舉進攻駐守茂山、訥殷部的費英東，費英東兵敗佛多山率兩千餘殘兵敗將逃迴建州，陳忠、元均、裕楞額率一萬餘大軍配合李旦南北夾攻駐守輝發部的舒爾哈齊，舒爾哈齊血洗輝發部後遭到輝發部部眾深惡痛恨，舒爾哈齊麵對漢軍南北夾攻，輝發部眾群起攻擊，慌忙率兩千殘兵敗將逃迴建州。
曾大牛、藤信康、高從後率一萬餘大軍從寬甸堡向建州發起進攻，攻至棟鄂部兀拉山城，何和禮原配率部眾向漢軍開城迎降，率部眾隨漢軍直奔後金都城赫圖阿拉城殺來。
陳衝、納林布祿、李旦、曾大牛、陳忠、元均、裕楞額率四路六萬大軍直奔後金建州老巢赫圖阿拉城殺來，一路勢如破竹，直搗黃龍，四路大軍遙相唿應，接連攻破建州外圍各部城寨，逐漸困死退守建州的舒爾哈齊、費英東等後金留守文武。
陳仁傑、查大受率一萬餘大軍攻打撫順城，費英東之父索爾果率兩千餘後金軍駐守撫順。陳仁傑在渾河南岸指揮炮軍發炮猛轟撫順城，守城後金軍被轟炸得死傷慘重。
查大受率一萬遼東兵在炮火掩護下扛著攻城梯衝過渾河直抵撫順城下，紛紛架起攻城梯奮勇攻城，一舉攻上撫順城，殺得守城後金軍潰敗而逃，後金守將索爾果被遼東將士斬殺。
陳衝、納林布祿率三萬漢軍攻入遼東邊牆，接連攻下遼海衛、鐵嶺衛，與隨後渡河趕來的董一元、布塔施裏兩萬大軍匯合，隨即出兵南下。
王安海攜杜桐、陳大虎、何崇奇、王保等統率六萬大軍北上趕來沈陽城外，加上沈有容統率的五萬大軍，以及董一元、布塔施裏兩萬大軍共計十三萬人馬對沈陽城展開合圍進攻。
陳瀚率天子三軍虎賁軍、禦林軍、禁衛軍出山海關抵達遼陽城，一路捷報頻傳，努爾哈赤已被漢軍主力圍困在沈陽城中，陳瀚下旨不得放走後金一兵一卒，同時下旨命陳衝統率四路兵馬對後金建州老巢進行犁庭掃穴，徹底摧毀一切。
困守沈陽城的努爾哈赤及後金將領麵對漢軍重兵圍困，紛紛做困獸猶鬥，將沈陽城中漢人、女真人盡數組織起來，守城兵力達到七八萬，殘酷激烈的沈陽決戰爆發。
王安海統率各路漢軍在沈陽城四門外備戰攻城，陳大虎、佟養正率三萬大軍進攻城南保安門、杜桐、楊紹勳率三萬大軍進攻城西永昌門，董一元、何崇奇率三萬大軍進攻城北鎮邊門，沈有容、王保率三萬大軍進攻城東永寧門，王安海率一萬大軍督戰進攻。
鄭彥武調集炮軍三百餘門艦炮、大將軍炮在沈陽城四門部署炮陣，翟忠義率飛天營第一營第三團也忙著準備升空參戰，鄭彥武親自在城南保安門外指揮炮軍下令道：“發炮進攻”
炮軍將領高唿下令道：“放”
‘轟轟……’城南炮軍近百門艦炮、大將軍炮率先發炮猛轟，唿嘯拋射的炮彈直奔沈陽城南保安門城門、城牆襲來。城東、城西、城北三門也接連不斷響起驚雷炮聲，唿嘯拋射的炮彈紛紛朝著沈陽城城牆、城門襲來，硝煙濃罩著整個沈陽城。
鎮守沈陽城南保安門的扈爾漢見漢軍發炮進攻，忙高唿下令道：“快發炮進攻”
投降後金的漢奸李永芳忙朝著炮兵下令道：“放”
‘轟轟……’城牆上不下六十門後金軍艦載加農炮、大將軍炮、佛朗機炮紛紛發炮反擊，隨即遭到漢軍一通炮彈襲來，漢軍炮彈在城牆上炸響，城牆上的火炮被炸得東倒西歪，指揮後金炮兵的李永芳也被炮彈炸得殘肢斷臂橫飛。
城牆上的後金將士被炸得殘肢斷臂血雨紛飛，鬼哭狼嚎慘唿聲不斷響起：“啊啊……”
“快跑”守城後金軍民被漢軍兇猛的炮火轟炸驚嚇得惶恐不安，不少漢人百姓被後金軍強征帶來守城，紛紛趁機逃下城去，甚至還有不少女真人也跟著趁機逃下城去。
梁雄同翟忠義、令占率飛天營、飛天團兩百餘個飛球借著城南炮軍炮火硝煙彌漫掩護飛抵城南城牆上空，飛天營將士朝著下方城牆上狂扔炮彈、火藥包、手雷轟炸，城牆上被炸得一片飛沙走石，後金將士被炸死炸傷或砸死砸傷，一片屍橫遍地，哀鴻遍野。
漢軍工兵營將士在炮火掩護下抬著小船，抱著木樁、木板衝到三丈寬的沈陽城外護城河邊，忙在三尺深的護城河上架起浮橋、木橋。
一身戎裝的陳大虎在馬上揮手下令道：“進攻，拿下沈陽城。”
“衝啊”老將佟養打馬帶頭率遼東兵衝鋒在前扛著攻城梯發起衝鋒進攻，火槍營、弓弩營將士紛紛在護城河外朝著城牆上開槍放箭壓製守城後金軍，迫擊炮營將士扛著迫擊炮衝到城外迅速部署炮陣發炮猛轟城牆上後金軍，掩護攻城大軍。
扈爾漢也被漢軍炮彈轟炸受傷不輕，本想率守軍拚死抵抗，奈何漢軍炮彈不斷轟炸得後金守軍將士不敢輕易冒頭，一聽城外槍聲炮聲停止，扈爾漢忙揮刀疾唿下令道：“別讓漢軍攻上城牆，殺……。”
“殺……”守城後金軍與衝殺上來的漢軍將士拚殺起來，死傷慘重的後金軍兵力捉襟見肘，顧此失彼，迅速被漢軍衝殺上城牆來，漢軍將士占領一段城牆後忙組織火槍營、弓弩營列陣開槍放箭射殺後金將士，迫擊炮營也在城下發炮猛轟集結的後金軍，炸得後金軍根本難以組織起大規模反擊，漢軍將士迅速攻占各處城牆，殺得後金軍節節敗退。
努爾哈赤親自鎮守的城東永寧門一帶城牆也隨即被漢軍攻陷，努爾哈赤也被炮彈轟炸受傷，加上在遼陽一戰負傷未愈，新傷加舊傷更加嚴重，但依舊堅守城牆拚死抵抗，做困獸猶鬥。
‘轟轟……’沈有容見努爾哈赤一直堅持在永寧門城樓上指揮後金軍迎戰，下令炮軍艦炮瞄準永寧門城樓發炮猛轟，永寧門城樓被數十門艦炮一通猛轟，城樓轟然坍塌下來，下方的後金軍將士連同努爾哈赤一同被掩埋。
杜桐、楊紹勳率三萬大軍在炮軍、飛天營轟炸掩護下也迅速攻上城西永昌門，董一元、何崇奇率三萬大軍在炮軍、飛天營轟炸掩護下也攻上城北鎮邊門。
四門漢軍接連不斷攻入城中，打開城門，漢軍蜂擁攻入城中，殺得後金文武及女真人屍橫遍野，血流成河，城中漢人也紛紛跟著痛打落水狗，遷徙到沈陽城中的五六萬女真人盡數被屠殺殆盡。
沈有容下令漢軍將士忙在永寧門城樓廢墟中尋找努爾哈赤屍體，各路將領聞訊紛紛帶兵趕來爭搶努爾哈赤屍體，漢軍將士七手八腳從廢墟中找到努爾哈赤屍體，隨即遭到爭搶戰功的各路漢軍將士揮著刀劍一通砍殺，各自分得幾段屍首抱著趕去登記報功。
陳衝統率四路大軍圍攻後金建州老巢赫圖阿拉城，進行犁庭掃穴，將所遇建州城寨夷為平地，將所有建州男子盡數殺光，隻留下年輕婦人女子，漢軍攻陷佛阿拉城後，一把火燒毀佛阿拉城。
後金都城赫圖阿拉城數萬部眾被各路漢軍圍攻俘獲，舒爾哈齊、費英東接連被漢軍炸死殺死，陳衝下令一把火將赫圖阿拉燒個精光，徹底摧毀建州，將被俘建州年輕婦人女子押解到遼陽城獻俘闕下。
陳瀚在遼陽城北鎮遠門接受東征各路大軍將士獻俘闕下，下令將近萬建州戰俘男子斬首，築成京觀，震懾不臣之心部落，將俘獲年輕婦人女子賞賜給將士為妾為仆。
陳瀚下令設遼東省、遼西省，遼東省省城遼陽府，下轄遼東都司遼河以東及烏拉河（鬆花江上遊）以西海西、建州各部，平壤府、元山府以北皆劃歸遼東省管轄。烏拉河以東由黑水道管轄，遼西省省城設在大寧城，管轄遼西走廊、蒙古左翼各部及原索倫汗國南部唿倫貝爾草原廣大地區。
陳衝、納林布祿率三萬大軍橫掃葉赫部故地，與李旦率領的兩萬黑水經略府大軍匯合，隨即南下進攻輝發、哈達兩部，接連攻破哈達部各城寨，輝發部貝勒拜音達裏與其子趁機組織兩千部眾反攻退守輝發部的舒爾哈齊三千餘後金兵，拜音達裏父子不敵兵敗反遭舒爾哈齊率兵屠殺，舒爾哈齊在輝發部大開殺戒，將拜音達裏全族悉數殺光，以震懾輝發部反抗。
陳忠同邊備使元均、朱舍裏部部長裕楞額率一萬餘大軍大舉進攻駐守茂山、訥殷部的費英東，費英東兵敗佛多山率兩千餘殘兵敗將逃迴建州，陳忠、元均、裕楞額率一萬餘大軍配合李旦南北夾攻駐守輝發部的舒爾哈齊，舒爾哈齊血洗輝發部後遭到輝發部部眾深惡痛恨，舒爾哈齊麵對漢軍南北夾攻，輝發部眾群起攻擊，慌忙率兩千殘兵敗將逃迴建州。
曾大牛、藤信康、高從後率一萬餘大軍從寬甸堡向建州發起進攻，攻至棟鄂部兀拉山城，何和禮原配率部眾向漢軍開城迎降，率部眾隨漢軍直奔後金都城赫圖阿拉城殺來。
陳衝、納林布祿、李旦、曾大牛、陳忠、元均、裕楞額率四路六萬大軍直奔後金建州老巢赫圖阿拉城殺來，一路勢如破竹，直搗黃龍，四路大軍遙相唿應，接連攻破建州外圍各部城寨，逐漸困死退守建州的舒爾哈齊、費英東等後金留守文武。
陳仁傑、查大受率一萬餘大軍攻打撫順城，費英東之父索爾果率兩千餘後金軍駐守撫順。陳仁傑在渾河南岸指揮炮軍發炮猛轟撫順城，守城後金軍被轟炸得死傷慘重。
查大受率一萬遼東兵在炮火掩護下扛著攻城梯衝過渾河直抵撫順城下，紛紛架起攻城梯奮勇攻城，一舉攻上撫順城，殺得守城後金軍潰敗而逃，後金守將索爾果被遼東將士斬殺。
陳衝、納林布祿率三萬漢軍攻入遼東邊牆，接連攻下遼海衛、鐵嶺衛，與隨後渡河趕來的董一元、布塔施裏兩萬大軍匯合，隨即出兵南下。
王安海攜杜桐、陳大虎、何崇奇、王保等統率六萬大軍北上趕來沈陽城外，加上沈有容統率的五萬大軍，以及董一元、布塔施裏兩萬大軍共計十三萬人馬對沈陽城展開合圍進攻。
陳瀚率天子三軍虎賁軍、禦林軍、禁衛軍出山海關抵達遼陽城，一路捷報頻傳，努爾哈赤已被漢軍主力圍困在沈陽城中，陳瀚下旨不得放走後金一兵一卒，同時下旨命陳衝統率四路兵馬對後金建州老巢進行犁庭掃穴，徹底摧毀一切。
困守沈陽城的努爾哈赤及後金將領麵對漢軍重兵圍困，紛紛做困獸猶鬥，將沈陽城中漢人、女真人盡數組織起來，守城兵力達到七八萬，殘酷激烈的沈陽決戰爆發。
王安海統率各路漢軍在沈陽城四門外備戰攻城，陳大虎、佟養正率三萬大軍進攻城南保安門、杜桐、楊紹勳率三萬大軍進攻城西永昌門，董一元、何崇奇率三萬大軍進攻城北鎮邊門，沈有容、王保率三萬大軍進攻城東永寧門，王安海率一萬大軍督戰進攻。
鄭彥武調集炮軍三百餘門艦炮、大將軍炮在沈陽城四門部署炮陣，翟忠義率飛天營第一營第三團也忙著準備升空參戰，鄭彥武親自在城南保安門外指揮炮軍下令道：“發炮進攻”
炮軍將領高唿下令道：“放”
‘轟轟……’城南炮軍近百門艦炮、大將軍炮率先發炮猛轟，唿嘯拋射的炮彈直奔沈陽城南保安門城門、城牆襲來。城東、城西、城北三門也接連不斷響起驚雷炮聲，唿嘯拋射的炮彈紛紛朝著沈陽城城牆、城門襲來，硝煙濃罩著整個沈陽城。
鎮守沈陽城南保安門的扈爾漢見漢軍發炮進攻，忙高唿下令道：“快發炮進攻”
投降後金的漢奸李永芳忙朝著炮兵下令道：“放”
‘轟轟……’城牆上不下六十門後金軍艦載加農炮、大將軍炮、佛朗機炮紛紛發炮反擊，隨即遭到漢軍一通炮彈襲來，漢軍炮彈在城牆上炸響，城牆上的火炮被炸得東倒西歪，指揮後金炮兵的李永芳也被炮彈炸得殘肢斷臂橫飛。
城牆上的後金將士被炸得殘肢斷臂血雨紛飛，鬼哭狼嚎慘唿聲不斷響起：“啊啊……”
“快跑”守城後金軍民被漢軍兇猛的炮火轟炸驚嚇得惶恐不安，不少漢人百姓被後金軍強征帶來守城，紛紛趁機逃下城去，甚至還有不少女真人也跟著趁機逃下城去。
梁雄同翟忠義、令占率飛天營、飛天團兩百餘個飛球借著城南炮軍炮火硝煙彌漫掩護飛抵城南城牆上空，飛天營將士朝著下方城牆上狂扔炮彈、火藥包、手雷轟炸，城牆上被炸得一片飛沙走石，後金將士被炸死炸傷或砸死砸傷，一片屍橫遍地，哀鴻遍野。
漢軍工兵營將士在炮火掩護下抬著小船，抱著木樁、木板衝到三丈寬的沈陽城外護城河邊，忙在三尺深的護城河上架起浮橋、木橋。
一身戎裝的陳大虎在馬上揮手下令道：“進攻，拿下沈陽城。”
“衝啊”老將佟養打馬帶頭率遼東兵衝鋒在前扛著攻城梯發起衝鋒進攻，火槍營、弓弩營將士紛紛在護城河外朝著城牆上開槍放箭壓製守城後金軍，迫擊炮營將士扛著迫擊炮衝到城外迅速部署炮陣發炮猛轟城牆上後金軍，掩護攻城大軍。
扈爾漢也被漢軍炮彈轟炸受傷不輕，本想率守軍拚死抵抗，奈何漢軍炮彈不斷轟炸得後金守軍將士不敢輕易冒頭，一聽城外槍聲炮聲停止，扈爾漢忙揮刀疾唿下令道：“別讓漢軍攻上城牆，殺……。”
“殺……”守城後金軍與衝殺上來的漢軍將士拚殺起來，死傷慘重的後金軍兵力捉襟見肘，顧此失彼，迅速被漢軍衝殺上城牆來，漢軍將士占領一段城牆後忙組織火槍營、弓弩營列陣開槍放箭射殺後金將士，迫擊炮營也在城下發炮猛轟集結的後金軍，炸得後金軍根本難以組織起大規模反擊，漢軍將士迅速攻占各處城牆，殺得後金軍節節敗退。
努爾哈赤親自鎮守的城東永寧門一帶城牆也隨即被漢軍攻陷，努爾哈赤也被炮彈轟炸受傷，加上在遼陽一戰負傷未愈，新傷加舊傷更加嚴重，但依舊堅守城牆拚死抵抗，做困獸猶鬥。
‘轟轟……’沈有容見努爾哈赤一直堅持在永寧門城樓上指揮後金軍迎戰，下令炮軍艦炮瞄準永寧門城樓發炮猛轟，永寧門城樓被數十門艦炮一通猛轟，城樓轟然坍塌下來，下方的後金軍將士連同努爾哈赤一同被掩埋。
杜桐、楊紹勳率三萬大軍在炮軍、飛天營轟炸掩護下也迅速攻上城西永昌門，董一元、何崇奇率三萬大軍在炮軍、飛天營轟炸掩護下也攻上城北鎮邊門。
四門漢軍接連不斷攻入城中，打開城門，漢軍蜂擁攻入城中，殺得後金文武及女真人屍橫遍野，血流成河，城中漢人也紛紛跟著痛打落水狗，遷徙到沈陽城中的五六萬女真人盡數被屠殺殆盡。
沈有容下令漢軍將士忙在永寧門城樓廢墟中尋找努爾哈赤屍體，各路將領聞訊紛紛帶兵趕來爭搶努爾哈赤屍體，漢軍將士七手八腳從廢墟中找到努爾哈赤屍體，隨即遭到爭搶戰功的各路漢軍將士揮著刀劍一通砍殺，各自分得幾段屍首抱著趕去登記報功。
陳衝統率四路大軍圍攻後金建州老巢赫圖阿拉城，進行犁庭掃穴，將所遇建州城寨夷為平地，將所有建州男子盡數殺光，隻留下年輕婦人女子，漢軍攻陷佛阿拉城後，一把火燒毀佛阿拉城。
後金都城赫圖阿拉城數萬部眾被各路漢軍圍攻俘獲，舒爾哈齊、費英東接連被漢軍炸死殺死，陳衝下令一把火將赫圖阿拉燒個精光，徹底摧毀建州，將被俘建州年輕婦人女子押解到遼陽城獻俘闕下。
陳瀚在遼陽城北鎮遠門接受東征各路大軍將士獻俘闕下，下令將近萬建州戰俘男子斬首，築成京觀，震懾不臣之心部落，將俘獲年輕婦人女子賞賜給將士為妾為仆。
陳瀚下令設遼東省、遼西省，遼東省省城遼陽府，下轄遼東都司遼河以東及烏拉河（鬆花江上遊）以西海西、建州各部，平壤府、元山府以北皆劃歸遼東省管轄。烏拉河以東由黑水道管轄，遼西省省城設在大寧城，管轄遼西走廊、蒙古左翼各部及原索倫汗國南部唿倫貝爾草原廣大地區。