大明京師失陷的消息傳到成都，緊接著陳瀚在長安稱帝建立天漢的消息也隨之傳來。張位、邢玠、譚希思一眾明朝官員認為國不可一日無君，當速擁立蜀王為帝。
蜀王府以應天府南京城皇宮為藍本，縮小規製而建。北起東西禦河，南到紅照壁，東至東華門，西達西華門，周長2500多米，麵積38公頃多。蜀王府坐北朝南，王宮內處處殿閣樓台、金碧輝煌。中軸線上的建築主要有承運門、承運殿、端禮殿、昭明殿等。
承運殿內，一身冕服的蜀王朱宣圻端坐皇位上，在張位、邢玠、譚希思、牛秉忠、劉承嗣、朱文達等文武擁立下稱帝，一眾明朝殘餘文武紛紛三唿道：“吾皇萬歲，萬歲，萬萬歲。”
蜀王朱宣圻揮手示意道：“眾卿平身”
“謝皇上”
蜀王府宦官拿出登基詔書宣讀道：“奉天承運皇帝，詔曰：
…………，勉循眾請，於萬曆二十二年六月十八日告祭天地於南京（成都）城南，即皇帝位於南京（成都）。…………，恭詣太廟，追尊四代考妣為皇帝皇後。立社稷於京師。立世子奉銓為皇太子。布告天下，鹹使聞知。”
朱宣圻在蜀王府稱帝，建立南明王朝，改元弘武，以張位為首輔，川貴總督邢玠為次輔，四川巡撫譚希思為吏部尚書，陝西總兵牛秉忠為兵部尚書，其餘文武皆有加封，同時還加封雲南巡撫陳用賓為兵部尚書兼雲貴總督，加封黔國公沐昌祚為沐王。
南明小朝廷迅速成立後，張位、邢玠收攏接連戰敗逃來成都的殘兵敗將三萬餘人，加上張位、牛秉忠率領的三萬救援成都明軍共計六萬餘大軍，南明朝廷決定分兵抵禦三路大舉進攻的十餘萬漢軍。
林江統率東路十萬漢軍接連攻破重慶府西部各縣，攻入成都府境內，接連攻下內江、資縣、資陽，在簡州攻破劉承嗣統率兩萬明軍駐守的陽安關，俘獲萬餘明軍，劉承嗣敗逃迴成都。
陸啟航率東海海軍第二編隊三萬水陸大軍沿涪江（嘉陵江）逆流而上，與薛長風統率的三萬餘南下漢軍攻陷順慶府後出兵西進接連攻破潼川州各縣，攻下成都府綿州，從成都府東北平原衝殺下來。
李毅、胡彪統率五萬水陸大軍接連攻下瀘州、敘州府各縣衛所，兩萬東海海軍第二編隊水陸大軍也隨後趕來，李毅胡彪統率六萬水陸大軍沿岷江逆流而上，接連攻破朱文達率兩萬明軍駐守的嘉定州、眉州各縣，直抵成都城南。
陸啟航、薛長風統率五萬漢軍接連攻破成都府北部德陽、漢州，直奔成都府城殺來。南明小朝廷麵對三路二十萬漢軍即將圍攻成都府，張位、邢玠商議後決定放棄成都南逃雅州，借助雅州一帶的險要地形及土司兵馬阻止漢軍大舉進攻。
南明小朝廷三萬兵馬護送著朱宣圻及蜀王藩宗室打開城西清遠門出逃，剛逃到岷江東岸準備渡江趕往崇慶州，遭到李毅、胡彪率領的三萬水陸大軍發炮阻止，陸啟航、林江隨後統率八萬步騎趕來，將南明小朝廷圍困在岷江東岸。
邢玠在馬上疾唿下令道：“快向北突圍”
“快向北突圍……”明軍將領紛紛高唿下令道：“快衝出去……”
‘轟轟……’岷江上的漢軍戰船上的迫擊炮營在胡彪指揮下再次發炮猛轟，轟炸得明軍將士死傷慘重，鬼哭狼嚎慘唿聲不斷響起：“啊啊……”
“朕不逃了”一身龍袍格外醒目的朱宣圻麵對漢軍重重圍困，朝著文武官員明軍將士下令道：“快向漢軍迎降，快迎降。”
‘轟轟……’陶翔統率飛天營順風趕來朝著南明小朝廷殘兵敗將一通炮彈、火藥包、手雷轟炸，炸得數萬南明文武、蜀王藩宗室、明軍將士死傷慘重，淒涼慘唿聲不絕於耳：“啊啊……”
“護駕，皇上，皇上被座駕壓住了，快救駕。”朱宣圻所乘戰馬被炮彈擊中倒下，將朱宣圻壓住，一眾南明文武慌忙去救朱宣圻，卻見朱宣圻已經沒了氣息，一眾南明文武紛紛嚎啕大哭道：“天要亡我大明啊”
一身魚鱗明光板甲頭戴紅纓鋼盔的林江在馬上高唿下令道：“傳令下去，降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。”
傳令兵紛紛打馬高唿傳令道：“主帥有令，降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。……。”
漢軍將士紛紛高唿道：“降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。……”
“我們願降，我們願降……。”陣前的明軍將士接連不斷棄械跪地請降，身後的明軍將士也紛紛跟著棄械跪地迎降。
漢軍火槍營將領見還有較少明軍及南明文武不願投降，當即下令道：“放銃”
‘砰砰……’千餘名明軍將士及南明文武沒有投降之意，隨即遭到漢軍開槍射殺，盡數倒在血泊之中。
邢玠、張位、牛秉忠、劉承嗣等文武被炮彈炸死或被射殺，朱文達、劉綎、吳廣等被俘獲或投降漢軍。南明小朝廷從建立到滅亡不到半月結束，已至天漢朝廷修《明書》時不將其當做政權看待。
漢軍攻破大明京城的消息也迅速傳到甘肅鎮各衛所，駐守涼州的三邊總督李汶打算擁立肅王朱紳堯稱帝，遭到甘肅巡撫田樂、總兵王允中、副總兵王鳴鶴等文武一致反對，雙方關係一度緊張起來。
大明滅亡已成既定事實，甘肅巡撫田樂派人與甘肅總兵王允中聯係阻止李汶擁立肅王朱紳堯，同時派使者趕往蘭州向天漢西征軍主將李承勳表明願主動歸順，請李承勳派兵阻止李汶擁立肅王朱紳堯為帝。
李承勳正與尤繼先統率五萬漢軍從蘭州城渡河大舉進攻占據大小鬆山地區的蒙古右翼多羅土蠻部，迅速收複黃河北岸一帶，李承勳與尤繼先兵分兩路出擊，接連擊破突襲進攻的多羅土蠻部首領著力兔率領的部眾。
著力兔忙向大小鬆山之中的鬆山堡撤退，李承勳、尤繼先率四萬漢軍東西夾攻鬆山堡，圍攻著力兔及其部眾，憑借著百餘門各類火炮一舉攻破鬆山堡，俘獲多羅土蠻部婦孺部眾萬餘人，斬殺著力兔在內的貴族數百人，留下五千漢軍將士駐守鬆山堡，將俘獲的多羅土蠻部婦人女子分給駐軍將士為妻妾，施行軍民完全融合發展。
李承勳得知三邊總督李汶在涼州欲擁立肅王朱紳堯為帝，留下尤繼先率五千漢軍接管莊浪衛，李承勳親率三萬大軍進攻涼州衛，直抵涼州衛城下，甘肅總兵王允中也率一萬餘大軍趕來涼州城西。
李承勳派人在城外要求涼州明軍主動開城迎降，惶恐不安的涼州城中明軍將士紛紛打開城門向城外漢軍迎降，李承勳率漢軍攻入城中，寧夏總兵蕭如薰率一萬餘寧夏精兵迎降，肅王朱紳堯也率肅王府宗室迎降。固執的李汶不願迎降，在總督府自盡殉國。
甘肅總兵王允中率甘肅各衛所將士主動歸順漢軍，李承勳率漢軍接管甘肅河西走廊防務，在歸順的明軍邊軍中抽調精銳收編入大軍，提拔驍勇善戰下級將領，加大整頓力度，監察司監官向剛整編的將士大力宣傳漢軍軍紀及優渥待遇，整肅軍風，河西軍風大變，大改以往明軍陋習。
歸順的將領接受隨軍軍學院教官宣傳培訓考核，跟著漢軍將士加緊操練配合作戰，準備出兵塞外痛擊韃子建功立業，獲得封賞。
蜀王府以應天府南京城皇宮為藍本，縮小規製而建。北起東西禦河，南到紅照壁，東至東華門，西達西華門，周長2500多米，麵積38公頃多。蜀王府坐北朝南，王宮內處處殿閣樓台、金碧輝煌。中軸線上的建築主要有承運門、承運殿、端禮殿、昭明殿等。
承運殿內，一身冕服的蜀王朱宣圻端坐皇位上，在張位、邢玠、譚希思、牛秉忠、劉承嗣、朱文達等文武擁立下稱帝，一眾明朝殘餘文武紛紛三唿道：“吾皇萬歲，萬歲，萬萬歲。”
蜀王朱宣圻揮手示意道：“眾卿平身”
“謝皇上”
蜀王府宦官拿出登基詔書宣讀道：“奉天承運皇帝，詔曰：
…………，勉循眾請，於萬曆二十二年六月十八日告祭天地於南京（成都）城南，即皇帝位於南京（成都）。…………，恭詣太廟，追尊四代考妣為皇帝皇後。立社稷於京師。立世子奉銓為皇太子。布告天下，鹹使聞知。”
朱宣圻在蜀王府稱帝，建立南明王朝，改元弘武，以張位為首輔，川貴總督邢玠為次輔，四川巡撫譚希思為吏部尚書，陝西總兵牛秉忠為兵部尚書，其餘文武皆有加封，同時還加封雲南巡撫陳用賓為兵部尚書兼雲貴總督，加封黔國公沐昌祚為沐王。
南明小朝廷迅速成立後，張位、邢玠收攏接連戰敗逃來成都的殘兵敗將三萬餘人，加上張位、牛秉忠率領的三萬救援成都明軍共計六萬餘大軍，南明朝廷決定分兵抵禦三路大舉進攻的十餘萬漢軍。
林江統率東路十萬漢軍接連攻破重慶府西部各縣，攻入成都府境內，接連攻下內江、資縣、資陽，在簡州攻破劉承嗣統率兩萬明軍駐守的陽安關，俘獲萬餘明軍，劉承嗣敗逃迴成都。
陸啟航率東海海軍第二編隊三萬水陸大軍沿涪江（嘉陵江）逆流而上，與薛長風統率的三萬餘南下漢軍攻陷順慶府後出兵西進接連攻破潼川州各縣，攻下成都府綿州，從成都府東北平原衝殺下來。
李毅、胡彪統率五萬水陸大軍接連攻下瀘州、敘州府各縣衛所，兩萬東海海軍第二編隊水陸大軍也隨後趕來，李毅胡彪統率六萬水陸大軍沿岷江逆流而上，接連攻破朱文達率兩萬明軍駐守的嘉定州、眉州各縣，直抵成都城南。
陸啟航、薛長風統率五萬漢軍接連攻破成都府北部德陽、漢州，直奔成都府城殺來。南明小朝廷麵對三路二十萬漢軍即將圍攻成都府，張位、邢玠商議後決定放棄成都南逃雅州，借助雅州一帶的險要地形及土司兵馬阻止漢軍大舉進攻。
南明小朝廷三萬兵馬護送著朱宣圻及蜀王藩宗室打開城西清遠門出逃，剛逃到岷江東岸準備渡江趕往崇慶州，遭到李毅、胡彪率領的三萬水陸大軍發炮阻止，陸啟航、林江隨後統率八萬步騎趕來，將南明小朝廷圍困在岷江東岸。
邢玠在馬上疾唿下令道：“快向北突圍”
“快向北突圍……”明軍將領紛紛高唿下令道：“快衝出去……”
‘轟轟……’岷江上的漢軍戰船上的迫擊炮營在胡彪指揮下再次發炮猛轟，轟炸得明軍將士死傷慘重，鬼哭狼嚎慘唿聲不斷響起：“啊啊……”
“朕不逃了”一身龍袍格外醒目的朱宣圻麵對漢軍重重圍困，朝著文武官員明軍將士下令道：“快向漢軍迎降，快迎降。”
‘轟轟……’陶翔統率飛天營順風趕來朝著南明小朝廷殘兵敗將一通炮彈、火藥包、手雷轟炸，炸得數萬南明文武、蜀王藩宗室、明軍將士死傷慘重，淒涼慘唿聲不絕於耳：“啊啊……”
“護駕，皇上，皇上被座駕壓住了，快救駕。”朱宣圻所乘戰馬被炮彈擊中倒下，將朱宣圻壓住，一眾南明文武慌忙去救朱宣圻，卻見朱宣圻已經沒了氣息，一眾南明文武紛紛嚎啕大哭道：“天要亡我大明啊”
一身魚鱗明光板甲頭戴紅纓鋼盔的林江在馬上高唿下令道：“傳令下去，降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。”
傳令兵紛紛打馬高唿傳令道：“主帥有令，降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。……。”
漢軍將士紛紛高唿道：“降者不殺，順我天漢者昌，逆我天漢者亡。……”
“我們願降，我們願降……。”陣前的明軍將士接連不斷棄械跪地請降，身後的明軍將士也紛紛跟著棄械跪地迎降。
漢軍火槍營將領見還有較少明軍及南明文武不願投降，當即下令道：“放銃”
‘砰砰……’千餘名明軍將士及南明文武沒有投降之意，隨即遭到漢軍開槍射殺，盡數倒在血泊之中。
邢玠、張位、牛秉忠、劉承嗣等文武被炮彈炸死或被射殺，朱文達、劉綎、吳廣等被俘獲或投降漢軍。南明小朝廷從建立到滅亡不到半月結束，已至天漢朝廷修《明書》時不將其當做政權看待。
漢軍攻破大明京城的消息也迅速傳到甘肅鎮各衛所，駐守涼州的三邊總督李汶打算擁立肅王朱紳堯稱帝，遭到甘肅巡撫田樂、總兵王允中、副總兵王鳴鶴等文武一致反對，雙方關係一度緊張起來。
大明滅亡已成既定事實，甘肅巡撫田樂派人與甘肅總兵王允中聯係阻止李汶擁立肅王朱紳堯，同時派使者趕往蘭州向天漢西征軍主將李承勳表明願主動歸順，請李承勳派兵阻止李汶擁立肅王朱紳堯為帝。
李承勳正與尤繼先統率五萬漢軍從蘭州城渡河大舉進攻占據大小鬆山地區的蒙古右翼多羅土蠻部，迅速收複黃河北岸一帶，李承勳與尤繼先兵分兩路出擊，接連擊破突襲進攻的多羅土蠻部首領著力兔率領的部眾。
著力兔忙向大小鬆山之中的鬆山堡撤退，李承勳、尤繼先率四萬漢軍東西夾攻鬆山堡，圍攻著力兔及其部眾，憑借著百餘門各類火炮一舉攻破鬆山堡，俘獲多羅土蠻部婦孺部眾萬餘人，斬殺著力兔在內的貴族數百人，留下五千漢軍將士駐守鬆山堡，將俘獲的多羅土蠻部婦人女子分給駐軍將士為妻妾，施行軍民完全融合發展。
李承勳得知三邊總督李汶在涼州欲擁立肅王朱紳堯為帝，留下尤繼先率五千漢軍接管莊浪衛，李承勳親率三萬大軍進攻涼州衛，直抵涼州衛城下，甘肅總兵王允中也率一萬餘大軍趕來涼州城西。
李承勳派人在城外要求涼州明軍主動開城迎降，惶恐不安的涼州城中明軍將士紛紛打開城門向城外漢軍迎降，李承勳率漢軍攻入城中，寧夏總兵蕭如薰率一萬餘寧夏精兵迎降，肅王朱紳堯也率肅王府宗室迎降。固執的李汶不願迎降，在總督府自盡殉國。
甘肅總兵王允中率甘肅各衛所將士主動歸順漢軍，李承勳率漢軍接管甘肅河西走廊防務，在歸順的明軍邊軍中抽調精銳收編入大軍，提拔驍勇善戰下級將領，加大整頓力度，監察司監官向剛整編的將士大力宣傳漢軍軍紀及優渥待遇，整肅軍風，河西軍風大變，大改以往明軍陋習。
歸順的將領接受隨軍軍學院教官宣傳培訓考核，跟著漢軍將士加緊操練配合作戰，準備出兵塞外痛擊韃子建功立業，獲得封賞。