其實這段劇情把綱手寫的太弱了點，這還沒到暈血的時候，堂堂三忍，有些顏麵掃地。好在綱手憑借恢複能力緩了過來，給了兜一擊，並打亂了他的神經係統。此時兜的身體不受控製，想要動右手，卻發現動的是左腳，綱手則趁這個間隙為自己療傷。但兜絕頂聰明，既然神經係統錯亂了，那麽就適應新的係統，短短數秒，他就掌握控製身體的規律。綱手顯然沒想到對方能這麽快適應，危急關頭，自來也和鳴人登場，擋在了綱手麵前。
兜感到不妙，他可不敢同時對付三忍中的兩位，於是他幫大蛇丸結印，通靈出了兩條大蛇助陣，也多虧自來也被綱手下藥，還無法順利凝聚查克拉，被大蛇纏住。而綱手這邊，兜利用她暈血的弱點讓她失去了戰鬥力，現在兜的對手，就隻有鳴人和綱手的隨從靜音了。
靜音的實力不錯，善於用毒，但仍不是兜的對手。兜又是熟練的一掌襲胸，接著用土遁從地底鑽出，抓住了靜音的腳踝，你…在檢查人家的身體嘛？？靜音無法招架，剩下的隻有鳴人了。兜在中忍考試中知道鳴人的實力，本不把他放在眼裏，沒想到短短數月，這個少年已經在自來也的教導下鹹魚翻身了。鳴人徒手抓住兜的苦無，突然使出螺旋丸，把兜打了個措手不及。這是一顆值得紀念的丸子，這是鳴人第一次成功搓出螺旋丸，兜榮幸的成為了第一位體驗用戶。
看到兜被螺旋丸結結實實的命中，本以為是非死即傷，沒想到兜隻是被擊退數十米，甚至沒有倒下。原來在被螺旋丸擊中前的瞬間，他就對受擊部位施加了醫療忍術，當螺旋丸結束的時候，他的傷已經治愈的差不多了，從這個方麵來看，隻要不是瞬間致命的攻擊，對於兜來說都沒有太大效果。不過輪番作戰，兜早已耗費了大量查克拉，這次為了抗住螺旋丸，他的查克拉終於見底，踉蹌間還是倒下了。
在剛才的交手中，兜已經用查克拉手術刀切斷了鳴人的心肌，不過綱手的醫療忍術加上九尾的力量最終救迴了鳴人。綱手曾因為弟弟和戀人的死，對鮮血患上了恐懼，這次她為了守護鳴人，為了以第五代火影之名守護木葉村，終於克服了暈血的弱點。她解開陰封印，使用忍法·創造再生逆轉了戰局；而自來也也從藥效中漸漸恢複，重獲戰力。大蛇丸和藥師兜也意識到了形勢嚴峻，立即撤退。
這一戰兜的表現著實不錯，一人單挑了綱手、靜音、鳴人三人，雖說綱手那時沒有用出全力，但看來之前大蛇丸說兜的實力和卡卡西相當，並不是吹的。
大蛇丸此行沒有得到綱手的幫助，但他們還有一個方案，就是佐助。隻要大蛇丸轉生到佐助體內，自然能夠重獲新生，於是他們派出音忍四人眾，讓他們立刻把佐助帶來。但想帶走佐助並不容易，木葉的追兵一路攔截，音忍四人眾的行動幾乎就要失敗。
病重的君麻呂聽說後想去幫他們，而兜說：“你的使命已經完成，還是保重身體吧。”但君麻呂堅持要用最後的生命幫大蛇丸奪迴佐助，兜隻好讓他去了。最後佐助來到了大蛇丸麵前，還好來遲一步，大蛇丸因為身體崩壞，已經轉生到了另一個人身上，而下次轉生要間隔三年。
多年來，大蛇丸和兜已將忍界大部分力量收入囊中，現存的各類禁術，甚至是仙術和千手柱間的細胞，他們想要探尋的，隻剩宇智波一族的奧秘了。於是他們前往木葉，費盡周折後終於得到了佐助，但大蛇丸也被三代火影的屍鬼封盡所傷，被迫轉生到臨時找來的容器中，想要奪取佐助的身體，要再等三年。
可在大蛇丸盯上佐助的同時，佐助同樣也想奪取大蛇丸的力量，而三年時間，已經足夠讓他變強。在最後的轉生儀式中，大蛇丸敗給了佐助的寫輪眼。當兜看到大蛇丸被反噬的場景時，他以為大蛇丸就這麽死掉了，最初便沒有記憶的兜一直渴望一個身份，他曾屬於木葉孤兒院，但被最親的院長遺忘，他曾屬於根組織，卻又被團藏迫害，跟了大蛇丸後，他覺得自己終於找到了一個靠譜的老大，但現在大蛇丸也死了，他連“大蛇丸的部下”這個身份也失去了。
不過兜很快振作起來，雖然大蛇丸死了，但他的理想，以及多年搜集與研究的成果還在，沒有了他，我就自己當老大。於是兜賦予了自己新的身份，繼續著未盡的事業，但很可惜，他賦予自己的身份僅僅是“大蛇丸的替代品”。他繼承了包括穢土轉生在內的大蛇丸流全部科研成果，甚至將他的殘骸注入體內，想要成為新的大蛇丸。
自以為找到人生方向的兜，特意拿著這些年來搜集到的曉的情報去感謝鳴人。他對鳴人一直有種特殊的感情，出生便父母雙亡的鳴人同樣是孤兒，作為人柱力深受排擠，渴望得到村裏人的認可。兜將他的身影與自己重合，看到他在中忍考試時，戰勝了被稱為天才的寧次；三忍之戰時，用螺旋丸打倒了自己，以及天地橋上；爆發九尾查克拉對抗大蛇丸。麵對強敵，仍然相信自己的力量，兜從他上獲得了勇氣，才敢於取代自己一直所依附的大蛇丸。
看到兜變成了一個半人半蛇的怪物，還口口聲聲說這是受到了他的鼓舞，要感謝他，鳴人感到無言以對，好好的人怎麽就瘋了？他接受了那份曉的情報，然後立刻出手想要抓住兜。兜從容脫身：“等我能完全掌握大蛇丸的力量後，再和你好好戰鬥一場”。不過兜給鳴人的這份情報最終幫到了他自己，被鳴人他們幹掉的曉組織成員，後來成為他穢土轉生的重要戰力。
大蛇丸的力量沒那麽好消化，兜的身體很快被侵蝕，而且除了大蛇丸，他還植入了水月、香磷甚至音忍五人眾的細胞。將這麽多人的力量融入體內無疑是在作死，但藥師兜最後全部消化了，這恐怕是因為他獲得了擁有強大生命力的白蛇仙人體，這也是兜一躍成為boss的原因，他到達了龍地洞。這個在研究重吾的身體時發現的咒印之力源頭，與妙木山、濕骨林齊名的仙術傳承之地。
此前他們找到龍地洞時，大蛇丸的身體已經不行了，無法承受仙術的力量。或許大蛇丸本想奪取佐助的身體後再來，但他沒有這個機會了，於是兜取代他，向白蛇仙人學習了仙術，成為了忍界第一位能夠開啟白蛇仙人模式的人。從龍地洞出來後，藥師兜膨脹了，他突然意識到自己不止可以成為大蛇丸，甚至可以成為任何人，隻要擁有絕對的力量，便可將世界收入囊中，到那時，“身份”、“自我”也隻是無關緊要的問題。但他發現，這段時間忍界已經大變，一位自稱宇智波斑的麵具男率先向五大忍村宣戰，而他的首要目標佐助竟然投靠了這個人。
雖然兜擁有了仙術，但他還是沒有把握從傳說中的斑手上搶人，因此他通過自己掌握的情報和黑絕的指引，找到了忍界史上大部分強者的遺體，將他們全部通過穢土轉生召喚了出來。在這個過程中，他也知道了那個麵具男並不是宇智波斑，因為真正的斑被他找到了。此時的兜手握忍界最強的一支軍隊，有恃無恐的來了麵具男麵前。
麵具男，也就是打著宇智波斑旗號的帶土，起初並沒有把這個曾是蠍的部下的人放在眼裏。兜剛開始客套：“我曾經也是曉的一員…”帶土就不屑的說：“你隻是個叛徒”，便對他出手了。而兜使出穢土轉生，一口氣招出了五名曉組織成員，帶土大吃一驚，竟然連長門和鼬都在其中，他不得不正視眼前這位叫做兜的人。
帶土問他：“你有什麽目的？”兜迴答：“我隻是想跟你聯手，你就要開戰了吧，我能為你提供戰力。”帶土微微眯眼：“那你想要什麽報酬？”兜：“宇智波佐助。”
帶土思忖片刻，他知道如果將佐助交給這個人會發生不得了的事情。帶土：“如果我拒絕呢？”他已經做好了戰鬥的準備即使一人對抗曉組織全員，他仍有把握。而兜微微一笑，再次招出了一具穢土轉生。
棺材板揭開，帶土大驚失色：“這是…”。“你無法拒絕！”，兜自信的說著。因為這具棺材裏的，是僅有的能讓帶土低頭的人，真正的宇智波斑。
帶土故作鎮定，幹笑了兩聲：“藥師兜，沒想到你是這樣的人才。好吧，我跟你聯手，不過要等戰爭有了結果，我才能交出佐助。”
於是他們二人達成了同盟，但他們其實各懷心思，兜想借助帶土的力量，趁機將世界收入囊中，到時候佐助隻是額外的戰利品；而帶土連斑都敢背叛，一旦獲得戰爭勝利，擁有了十尾的力量，他才不會在乎和兜的約定。但在此之前，他們利益一致。
帶土手下擁有十萬白絕大軍，雖說隻是十萬炮灰，但他自身的實力極強，而且已經有了七隻尾獸；藥師兜雖然自身的實力沒有那麽強，但手中的穢土轉生光是影級實力的便多達數十位，忍刀七人眾這種級別的更是數不勝數，更重要的是還有宇智波斑這個bug。他們僅僅二人對抗整個忍界，但怎麽看都是他們勝券在握，隻要不發生太大意外。
但很快，第一個意外，也是引發之後所有意外的意外發生了，在兜控製鼬和長門去抓鳴人和奇拉比時，穢土轉生的鼬，擺脫了兜的控製。他通過生前在鳴人體內埋下的止水的寫輪眼，對自己施加了最強幻術別天神，強行覆蓋了穢土轉生。兜趕緊全力控製長門，想要幹掉這個威脅，並奪取止水的眼睛，但以一敵三，加上兜操作不佳，長門被鼬的十拳劍封印。於是兜給自己創造了一個大敵，一個沒有身體負擔、沒有查克拉與瞳力限製，絕頂聰明的鼬。
鼬通過穢土轉生的查克拉鏈接，逆向感應到了他的藏身之處，正疾速趕來，在路上還與剛剛開啟永恆萬花筒的佐助匯合，他們兄弟倆幾乎等於了目前忍者聯軍一半的戰力。而兜此時孤身一人，穢土轉生大軍在外，斑正在陪五影玩耍，但他一點也不怕。
看到鼬後，兜“善意”的提醒他：“穢土轉生隻能由術者主動解除，一旦我死了，便再也無法停止。“如此一來，鼬便不能殺他。
雖然兜知道鼬有強力的幻術月讀，但在白蛇仙人模式下，他可以徹底切斷視覺，隻靠熱感行動，加上從香磷那得到的恢複力、從水月那得到的液化能力，以及永恆生命力的白蛇仙人體，一切非致命的傷害他都可以無視。既不能殺他，又無法傷他，幻術也無效，這麽看來，兜麵對鼬和佐助，還沒開打便已立於不敗之地，按兜的話來說：“我完全想不到自己該怎麽輸。”
兜確實想不到，因為即使在他的情報裏，也沒有記載宇智波家族中有一招不靠視覺施加的幻術，以失去光明為代價發動的禁術，伊邪那美。鼬正是兜的天敵，按他的話來說：“穢土轉生唯一的弱點，就是我。”
開戰前，兜試圖拉攏佐助，他在龍地洞中待了一百多集，不清楚這段時間的劇情，以為他還是當年那個吵著要向鼬複仇的孩子。但佐助早已與鼬和好，現在的他是頭號鼬粉，又豈會受到挑撥？兜隻好正麵應敵。
他本以為現在的他能輕鬆拿下佐助，但沒想到獲得外掛的人不隻有他，佐助已經開啟了永恆萬花筒，實力直逼鼬，對方二人同時開啟須佐能乎，讓他無從下手。看來要先解決一個，兜使用了仙法·白激之術。
兜感到不妙，他可不敢同時對付三忍中的兩位，於是他幫大蛇丸結印，通靈出了兩條大蛇助陣，也多虧自來也被綱手下藥，還無法順利凝聚查克拉，被大蛇纏住。而綱手這邊，兜利用她暈血的弱點讓她失去了戰鬥力，現在兜的對手，就隻有鳴人和綱手的隨從靜音了。
靜音的實力不錯，善於用毒，但仍不是兜的對手。兜又是熟練的一掌襲胸，接著用土遁從地底鑽出，抓住了靜音的腳踝，你…在檢查人家的身體嘛？？靜音無法招架，剩下的隻有鳴人了。兜在中忍考試中知道鳴人的實力，本不把他放在眼裏，沒想到短短數月，這個少年已經在自來也的教導下鹹魚翻身了。鳴人徒手抓住兜的苦無，突然使出螺旋丸，把兜打了個措手不及。這是一顆值得紀念的丸子，這是鳴人第一次成功搓出螺旋丸，兜榮幸的成為了第一位體驗用戶。
看到兜被螺旋丸結結實實的命中，本以為是非死即傷，沒想到兜隻是被擊退數十米，甚至沒有倒下。原來在被螺旋丸擊中前的瞬間，他就對受擊部位施加了醫療忍術，當螺旋丸結束的時候，他的傷已經治愈的差不多了，從這個方麵來看，隻要不是瞬間致命的攻擊，對於兜來說都沒有太大效果。不過輪番作戰，兜早已耗費了大量查克拉，這次為了抗住螺旋丸，他的查克拉終於見底，踉蹌間還是倒下了。
在剛才的交手中，兜已經用查克拉手術刀切斷了鳴人的心肌，不過綱手的醫療忍術加上九尾的力量最終救迴了鳴人。綱手曾因為弟弟和戀人的死，對鮮血患上了恐懼，這次她為了守護鳴人，為了以第五代火影之名守護木葉村，終於克服了暈血的弱點。她解開陰封印，使用忍法·創造再生逆轉了戰局；而自來也也從藥效中漸漸恢複，重獲戰力。大蛇丸和藥師兜也意識到了形勢嚴峻，立即撤退。
這一戰兜的表現著實不錯，一人單挑了綱手、靜音、鳴人三人，雖說綱手那時沒有用出全力，但看來之前大蛇丸說兜的實力和卡卡西相當，並不是吹的。
大蛇丸此行沒有得到綱手的幫助，但他們還有一個方案，就是佐助。隻要大蛇丸轉生到佐助體內，自然能夠重獲新生，於是他們派出音忍四人眾，讓他們立刻把佐助帶來。但想帶走佐助並不容易，木葉的追兵一路攔截，音忍四人眾的行動幾乎就要失敗。
病重的君麻呂聽說後想去幫他們，而兜說：“你的使命已經完成，還是保重身體吧。”但君麻呂堅持要用最後的生命幫大蛇丸奪迴佐助，兜隻好讓他去了。最後佐助來到了大蛇丸麵前，還好來遲一步，大蛇丸因為身體崩壞，已經轉生到了另一個人身上，而下次轉生要間隔三年。
多年來，大蛇丸和兜已將忍界大部分力量收入囊中，現存的各類禁術，甚至是仙術和千手柱間的細胞，他們想要探尋的，隻剩宇智波一族的奧秘了。於是他們前往木葉，費盡周折後終於得到了佐助，但大蛇丸也被三代火影的屍鬼封盡所傷，被迫轉生到臨時找來的容器中，想要奪取佐助的身體，要再等三年。
可在大蛇丸盯上佐助的同時，佐助同樣也想奪取大蛇丸的力量，而三年時間，已經足夠讓他變強。在最後的轉生儀式中，大蛇丸敗給了佐助的寫輪眼。當兜看到大蛇丸被反噬的場景時，他以為大蛇丸就這麽死掉了，最初便沒有記憶的兜一直渴望一個身份，他曾屬於木葉孤兒院，但被最親的院長遺忘，他曾屬於根組織，卻又被團藏迫害，跟了大蛇丸後，他覺得自己終於找到了一個靠譜的老大，但現在大蛇丸也死了，他連“大蛇丸的部下”這個身份也失去了。
不過兜很快振作起來，雖然大蛇丸死了，但他的理想，以及多年搜集與研究的成果還在，沒有了他，我就自己當老大。於是兜賦予了自己新的身份，繼續著未盡的事業，但很可惜，他賦予自己的身份僅僅是“大蛇丸的替代品”。他繼承了包括穢土轉生在內的大蛇丸流全部科研成果，甚至將他的殘骸注入體內，想要成為新的大蛇丸。
自以為找到人生方向的兜，特意拿著這些年來搜集到的曉的情報去感謝鳴人。他對鳴人一直有種特殊的感情，出生便父母雙亡的鳴人同樣是孤兒，作為人柱力深受排擠，渴望得到村裏人的認可。兜將他的身影與自己重合，看到他在中忍考試時，戰勝了被稱為天才的寧次；三忍之戰時，用螺旋丸打倒了自己，以及天地橋上；爆發九尾查克拉對抗大蛇丸。麵對強敵，仍然相信自己的力量，兜從他上獲得了勇氣，才敢於取代自己一直所依附的大蛇丸。
看到兜變成了一個半人半蛇的怪物，還口口聲聲說這是受到了他的鼓舞，要感謝他，鳴人感到無言以對，好好的人怎麽就瘋了？他接受了那份曉的情報，然後立刻出手想要抓住兜。兜從容脫身：“等我能完全掌握大蛇丸的力量後，再和你好好戰鬥一場”。不過兜給鳴人的這份情報最終幫到了他自己，被鳴人他們幹掉的曉組織成員，後來成為他穢土轉生的重要戰力。
大蛇丸的力量沒那麽好消化，兜的身體很快被侵蝕，而且除了大蛇丸，他還植入了水月、香磷甚至音忍五人眾的細胞。將這麽多人的力量融入體內無疑是在作死，但藥師兜最後全部消化了，這恐怕是因為他獲得了擁有強大生命力的白蛇仙人體，這也是兜一躍成為boss的原因，他到達了龍地洞。這個在研究重吾的身體時發現的咒印之力源頭，與妙木山、濕骨林齊名的仙術傳承之地。
此前他們找到龍地洞時，大蛇丸的身體已經不行了，無法承受仙術的力量。或許大蛇丸本想奪取佐助的身體後再來，但他沒有這個機會了，於是兜取代他，向白蛇仙人學習了仙術，成為了忍界第一位能夠開啟白蛇仙人模式的人。從龍地洞出來後，藥師兜膨脹了，他突然意識到自己不止可以成為大蛇丸，甚至可以成為任何人，隻要擁有絕對的力量，便可將世界收入囊中，到那時，“身份”、“自我”也隻是無關緊要的問題。但他發現，這段時間忍界已經大變，一位自稱宇智波斑的麵具男率先向五大忍村宣戰，而他的首要目標佐助竟然投靠了這個人。
雖然兜擁有了仙術，但他還是沒有把握從傳說中的斑手上搶人，因此他通過自己掌握的情報和黑絕的指引，找到了忍界史上大部分強者的遺體，將他們全部通過穢土轉生召喚了出來。在這個過程中，他也知道了那個麵具男並不是宇智波斑，因為真正的斑被他找到了。此時的兜手握忍界最強的一支軍隊，有恃無恐的來了麵具男麵前。
麵具男，也就是打著宇智波斑旗號的帶土，起初並沒有把這個曾是蠍的部下的人放在眼裏。兜剛開始客套：“我曾經也是曉的一員…”帶土就不屑的說：“你隻是個叛徒”，便對他出手了。而兜使出穢土轉生，一口氣招出了五名曉組織成員，帶土大吃一驚，竟然連長門和鼬都在其中，他不得不正視眼前這位叫做兜的人。
帶土問他：“你有什麽目的？”兜迴答：“我隻是想跟你聯手，你就要開戰了吧，我能為你提供戰力。”帶土微微眯眼：“那你想要什麽報酬？”兜：“宇智波佐助。”
帶土思忖片刻，他知道如果將佐助交給這個人會發生不得了的事情。帶土：“如果我拒絕呢？”他已經做好了戰鬥的準備即使一人對抗曉組織全員，他仍有把握。而兜微微一笑，再次招出了一具穢土轉生。
棺材板揭開，帶土大驚失色：“這是…”。“你無法拒絕！”，兜自信的說著。因為這具棺材裏的，是僅有的能讓帶土低頭的人，真正的宇智波斑。
帶土故作鎮定，幹笑了兩聲：“藥師兜，沒想到你是這樣的人才。好吧，我跟你聯手，不過要等戰爭有了結果，我才能交出佐助。”
於是他們二人達成了同盟，但他們其實各懷心思，兜想借助帶土的力量，趁機將世界收入囊中，到時候佐助隻是額外的戰利品；而帶土連斑都敢背叛，一旦獲得戰爭勝利，擁有了十尾的力量，他才不會在乎和兜的約定。但在此之前，他們利益一致。
帶土手下擁有十萬白絕大軍，雖說隻是十萬炮灰，但他自身的實力極強，而且已經有了七隻尾獸；藥師兜雖然自身的實力沒有那麽強，但手中的穢土轉生光是影級實力的便多達數十位，忍刀七人眾這種級別的更是數不勝數，更重要的是還有宇智波斑這個bug。他們僅僅二人對抗整個忍界，但怎麽看都是他們勝券在握，隻要不發生太大意外。
但很快，第一個意外，也是引發之後所有意外的意外發生了，在兜控製鼬和長門去抓鳴人和奇拉比時，穢土轉生的鼬，擺脫了兜的控製。他通過生前在鳴人體內埋下的止水的寫輪眼，對自己施加了最強幻術別天神，強行覆蓋了穢土轉生。兜趕緊全力控製長門，想要幹掉這個威脅，並奪取止水的眼睛，但以一敵三，加上兜操作不佳，長門被鼬的十拳劍封印。於是兜給自己創造了一個大敵，一個沒有身體負擔、沒有查克拉與瞳力限製，絕頂聰明的鼬。
鼬通過穢土轉生的查克拉鏈接，逆向感應到了他的藏身之處，正疾速趕來，在路上還與剛剛開啟永恆萬花筒的佐助匯合，他們兄弟倆幾乎等於了目前忍者聯軍一半的戰力。而兜此時孤身一人，穢土轉生大軍在外，斑正在陪五影玩耍，但他一點也不怕。
看到鼬後，兜“善意”的提醒他：“穢土轉生隻能由術者主動解除，一旦我死了，便再也無法停止。“如此一來，鼬便不能殺他。
雖然兜知道鼬有強力的幻術月讀，但在白蛇仙人模式下，他可以徹底切斷視覺，隻靠熱感行動，加上從香磷那得到的恢複力、從水月那得到的液化能力，以及永恆生命力的白蛇仙人體，一切非致命的傷害他都可以無視。既不能殺他，又無法傷他，幻術也無效，這麽看來，兜麵對鼬和佐助，還沒開打便已立於不敗之地，按兜的話來說：“我完全想不到自己該怎麽輸。”
兜確實想不到，因為即使在他的情報裏，也沒有記載宇智波家族中有一招不靠視覺施加的幻術，以失去光明為代價發動的禁術，伊邪那美。鼬正是兜的天敵，按他的話來說：“穢土轉生唯一的弱點，就是我。”
開戰前，兜試圖拉攏佐助，他在龍地洞中待了一百多集，不清楚這段時間的劇情，以為他還是當年那個吵著要向鼬複仇的孩子。但佐助早已與鼬和好，現在的他是頭號鼬粉，又豈會受到挑撥？兜隻好正麵應敵。
他本以為現在的他能輕鬆拿下佐助，但沒想到獲得外掛的人不隻有他，佐助已經開啟了永恆萬花筒，實力直逼鼬，對方二人同時開啟須佐能乎，讓他無從下手。看來要先解決一個，兜使用了仙法·白激之術。