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但是在雲南那邊李定國的軍隊節節敗退，軍士死傷大半，無力保護永曆政權，緬甸這邊的態度也逐漸發生了變化。恰好此時，緬甸又發生了宮廷政變，對永曆政權還算友好的國王莽達被弟弟莽白處死。
神武八年五月二十三日，緬甸國王的弟弟莽白在群臣支持下發動宮廷政變，處死了莽達，自立為王。新國王看到許多大臣前來祝賀，惟獨朱由榔未到，感到很生氣。其實朱由榔並不是不想來，而是因為坐吃山空，經費上陷入窘境，拿不出多少像樣的賀禮。可莽白認為他們根本不像貧窮之人，覺得他們欺騙自己。國王對朱由榔等人的態度也發生了轉變，再加上永曆政權大勢已去，便生出了除掉他們的念頭。
莽白借口朱由榔不送賀禮，便派使節前去索要，結果也沒得到什麽，便命使節當麵責備道：“我已經勞苦兩載，你們的皇帝及大臣應該重重感謝我。前年五月，我王打算殺掉你們，還是我力保不肯。你們這些人毫不知恩報恩。”說完憤憤而去。永曆官員極力辯解，但對方不為所動，自此雙方關係逐漸惡化。
神武十年七月十六日，緬甸國王莽白決定鏟除永曆隨行官員。他派人通知永曆廷臣過金沙江議事。鑒於雙方關係緊張，永曆文武官員心懷疑懼都不敢去。十八日，緬甸使者又來說：“我王恐怕你們懷有別的企圖，因此想讓你們一起到河邊共同‘飲咒水’，對天盟誓。借此也可以加強貿易往來，否則我們就斷絕關係，你們的生活就會更加艱難。”
朱由榔和文武群臣不知道該怎麽辦，世鎮雲南的黔國公沐天波答複道：“你們的宣慰司原是我中國封的地方。今我君臣到來，是天朝上邦。你國王該在此應答，才是下邦之禮，如何反將我君臣困在這裏？今又如何行此奸計？爾去告知國王，就說我天朝皇帝，不過是天命所使，今已行到無生之地，豈受爾土人之欺？我君臣雖在勢窮，量爾國王不敢無禮。任爾國兵百萬，象有千條，我君臣不過隨天命一死而已。但我君臣死後，自有人來與爾國王算賬。”
漂亮話雖然好說，但在緬方堅持下，朱由榔還是不得不派人前往。可誰去赴約？朱由榔最後決定由大學士文安侯馬吉翔、太監李國泰等人前往，但兩人提出要由黔國公沐天波同去。沐氏是西南邊境各邦國、土司重視的人物，馬吉翔等認為有沐天波在場，不致橫生意外。
第二日黎明，馬吉翔等召集大小官員渡河前往緬軍駐地塔下，準備“飲咒水”盟誓，僅留內官十三人和跛足總兵鄧凱看守“行宮”。上午，文武官員到達塔下即被緬兵三千人團團圍定。緬方指揮官命人將沐天波拖出包圍圈。沐天波知道橫生變數，奪取衛士的刀奮起反抗，殺緬兵九人；總兵魏豹、王升、王啟隆也抓起柴棒還擊，終因寡不敵眾，都被殺害。
其他被騙來“飲咒水”的官員全部遇難，其中包括馬吉翔、馬雄飛、王維恭，總兵王自金、陳謙等，總兵改授通判安朝柱，錦衣衛掌衛事任子信和金書張拱極、丁調鼎等，內官李國泰、李茂芳等，吉王府官張伯宗等。後來統計，這次“咒水之難”共被殺四十二人。緬軍謀殺永曆王朝的扈從人員後，隨即蜂擁突入永曆君臣住所，共誅殺三百多人，同時搜掠財物女子。
朱由榔看到事情這樣，倉促中決定同中宮皇後一起自縊。侍衛總兵鄧凱規勸道：“太後年老，飄落異域。皇上丟失社稷已經是不忠，今丟下太後又不孝，何以見高皇帝於地下？”永曆帝才放棄了自盡的打算。
最後緬兵把永曆帝、太後、皇後、太子等二十五人集中於一所小屋內，對其餘人員及扈從官員家屬濫加侮辱。永曆帝的劉、楊二貴人，吉王與妃妾等百餘人大都自縊而死。緬兵搜刮已盡時，緬甸大臣才在通事導引下來到，假惺惺地喝令緬兵：“王有令在此，不可傷皇帝及沐國公。”可是，沐天波已經在“飲咒水”時被殺。
朱由榔的臨時行宮屍橫滿地，已無法居住，緬甸官員請朱由榔等移往別處暫住。沐天波屋內尚有內官、婦女二百餘人也聚作一處，“母哭其子，妻哭其夫，女哭其父，驚聞數十裏”。洗劫之後，幸存人員已無法生活，附近緬甸寺廟的僧眾送來飲食，才得以苟延殘喘。
二十一日，緬方把永曆君臣原住地清理以後，又請他們移迴此處，給他們送來了食物和衣服。二十五日，又送來鋪蓋、銀、布等物，說：“緬王實無此意，都是因為晉、鞏兩藩殺害地方百姓，緬民恨之入骨，因而報仇罷了。”
朱由榔經此番打擊，對前途已完全失望，但也不願意被送到朱宏三手上，那樣真比死了還難受。十月十八日，朱由榔對總兵鄧凱說：“太後又一次病倒了，如果天意不可挽迴，朱宏三那逆賊來殺朕就讓他來殺好了，你就不要管聯了。但是希望你能使太後骸骨得歸故土。”
這時緬甸當局之所以沒有立即殺掉朱由榔，是因為當時朱宏三的軍隊已經占領雲南，這時朱宏三的後軍大都督周玉帶著八萬士兵就在明緬邊境，周玉在半年前將李定國的一萬多殘軍全部消滅幹淨，李定國也死在軍中。
原本按照周玉的意思直接殺過去，什麽緬甸王、朱由榔，統統殺光完事。但是這時周玉已經不是當年那個副營長了，而是新朝九位公爵之一。周玉的身邊人有人進言，朱由榔身份十分特殊，雖然皇帝有令生死不論，但是大家都知道現在朝中很多人都是當年朱由榔的舊臣，比如現在的雲貴總督呂大器。殺了朱由榔很簡單，但是那幫讀書人不敢得罪皇帝，那作為直接執行人的周玉可就倒了大黴。
周玉一想也對，現在已經不是戰爭年代，朝中文人的勢力逐漸壓過武將的勢力，以防萬一還是留朱由榔一命吧！
這樣周玉才行文緬甸政府，要他們交出朱由榔。莽白看到清兵勢不可擋，也想借此討好新興的神武政權。在周玉的威逼利誘下，莽白於神武十年十一月，將朱由榔及其家屬送交周玉。
周玉接受朱由榔後，在身邊謀士的建議下並不去親自拜見朱由榔，而是好吃好喝的將朱由榔供起來，畢竟朱由榔現在開始生死就不是周玉能管的了，一切都要北京的皇帝做決斷。
對朱宏三威脅最大的永曆政權被消滅，朱由榔被抓住，但是周玉沒有皇帝的命令並不敢隨便班師，所以派出一千名士兵押解朱由榔迴昆明，周玉自己帶著剩下的軍隊駐紮在明緬邊境。
周玉對待朱由榔還不錯，也沒有孽待他，每日定時給朱由榔夫妻還有太後、太子等人供奉食物。但是朱由榔心中還是有些後悔，不如當時自殺了事。
經過半個月的旅程，朱由榔迴到自己已經離開三年多的昆明，城還是那個城，民還是那些民，但是都已經不是他朱由榔的臣民了。
雲貴總督呂大器早已經接到周玉的消息，今天早上就準備停當來到城門外等候。呂大器的幕僚都勸呂大器不要這樣，雖然呂大器當過朱由榔的臣子，可是現在畢竟吃朱宏三的飯。並且朱宏三這個皇帝明顯的小心眼，萬一真覺著你呂大器和朱由榔舊情未了可怎麽辦？
但是呂大器並不管手下人的勸阻，現在自己雖然是朱宏三的臣子，但是畢竟當過朱由榔的內閣閣老，做人不能這麽無恥。
呂大器看到桂王的車子到了，趕緊進走幾步，上前跪倒施禮說道：“老臣呂大器，拜見陛下！”如果朱宏三在這一定要氣歪鼻子，朱宏三為了收買人心，規定士大夫看到皇帝都不用下跪，現在呂大器領著朱宏三的工資，竟然跪拜前主子，實在有些過分了。
這時朱由榔已經將一身龍袍脫了下來，換上普通的布衣，這時看到舊人也留下了眼淚。朱由榔上前攙扶起呂大器說道：“呂先生，現在你是神武陛下的臣子，不用在給我這個親王行禮了，讓陛下知道不好！”朱由榔為了活命，已經給朱宏三上書自行退位，還是當自己的桂王。
呂大器在朱由榔的攙扶下站起來，老淚縱橫的說道：“臣隻要當過陛下一天的臣子，就永遠是陛下的臣子！”
朱由榔看到呂大器這麽忠貞，再加上感歎自己的命運，不禁和呂大器抱頭痛哭。
二人哭完呂大器將朱由榔迎進昆明城，還是住在朱由榔以前的行宮中，不過呂大器人老奸馬老猾，知道那個昏君朱宏三什麽事都幹得出來。呂大器很怕昆明城中的錦衣衛將朱由榔暗害，所以親自帶著自己的衛兵守衛在朱由榔門口，生怕朱由榔有什麽不測。
但是在雲南那邊李定國的軍隊節節敗退，軍士死傷大半，無力保護永曆政權，緬甸這邊的態度也逐漸發生了變化。恰好此時，緬甸又發生了宮廷政變，對永曆政權還算友好的國王莽達被弟弟莽白處死。
神武八年五月二十三日，緬甸國王的弟弟莽白在群臣支持下發動宮廷政變，處死了莽達，自立為王。新國王看到許多大臣前來祝賀，惟獨朱由榔未到，感到很生氣。其實朱由榔並不是不想來，而是因為坐吃山空，經費上陷入窘境，拿不出多少像樣的賀禮。可莽白認為他們根本不像貧窮之人，覺得他們欺騙自己。國王對朱由榔等人的態度也發生了轉變，再加上永曆政權大勢已去，便生出了除掉他們的念頭。
莽白借口朱由榔不送賀禮，便派使節前去索要，結果也沒得到什麽，便命使節當麵責備道：“我已經勞苦兩載，你們的皇帝及大臣應該重重感謝我。前年五月，我王打算殺掉你們，還是我力保不肯。你們這些人毫不知恩報恩。”說完憤憤而去。永曆官員極力辯解，但對方不為所動，自此雙方關係逐漸惡化。
神武十年七月十六日，緬甸國王莽白決定鏟除永曆隨行官員。他派人通知永曆廷臣過金沙江議事。鑒於雙方關係緊張，永曆文武官員心懷疑懼都不敢去。十八日，緬甸使者又來說：“我王恐怕你們懷有別的企圖，因此想讓你們一起到河邊共同‘飲咒水’，對天盟誓。借此也可以加強貿易往來，否則我們就斷絕關係，你們的生活就會更加艱難。”
朱由榔和文武群臣不知道該怎麽辦，世鎮雲南的黔國公沐天波答複道：“你們的宣慰司原是我中國封的地方。今我君臣到來，是天朝上邦。你國王該在此應答，才是下邦之禮，如何反將我君臣困在這裏？今又如何行此奸計？爾去告知國王，就說我天朝皇帝，不過是天命所使，今已行到無生之地，豈受爾土人之欺？我君臣雖在勢窮，量爾國王不敢無禮。任爾國兵百萬，象有千條，我君臣不過隨天命一死而已。但我君臣死後，自有人來與爾國王算賬。”
漂亮話雖然好說，但在緬方堅持下，朱由榔還是不得不派人前往。可誰去赴約？朱由榔最後決定由大學士文安侯馬吉翔、太監李國泰等人前往，但兩人提出要由黔國公沐天波同去。沐氏是西南邊境各邦國、土司重視的人物，馬吉翔等認為有沐天波在場，不致橫生意外。
第二日黎明，馬吉翔等召集大小官員渡河前往緬軍駐地塔下，準備“飲咒水”盟誓，僅留內官十三人和跛足總兵鄧凱看守“行宮”。上午，文武官員到達塔下即被緬兵三千人團團圍定。緬方指揮官命人將沐天波拖出包圍圈。沐天波知道橫生變數，奪取衛士的刀奮起反抗，殺緬兵九人；總兵魏豹、王升、王啟隆也抓起柴棒還擊，終因寡不敵眾，都被殺害。
其他被騙來“飲咒水”的官員全部遇難，其中包括馬吉翔、馬雄飛、王維恭，總兵王自金、陳謙等，總兵改授通判安朝柱，錦衣衛掌衛事任子信和金書張拱極、丁調鼎等，內官李國泰、李茂芳等，吉王府官張伯宗等。後來統計，這次“咒水之難”共被殺四十二人。緬軍謀殺永曆王朝的扈從人員後，隨即蜂擁突入永曆君臣住所，共誅殺三百多人，同時搜掠財物女子。
朱由榔看到事情這樣，倉促中決定同中宮皇後一起自縊。侍衛總兵鄧凱規勸道：“太後年老，飄落異域。皇上丟失社稷已經是不忠，今丟下太後又不孝，何以見高皇帝於地下？”永曆帝才放棄了自盡的打算。
最後緬兵把永曆帝、太後、皇後、太子等二十五人集中於一所小屋內，對其餘人員及扈從官員家屬濫加侮辱。永曆帝的劉、楊二貴人，吉王與妃妾等百餘人大都自縊而死。緬兵搜刮已盡時，緬甸大臣才在通事導引下來到，假惺惺地喝令緬兵：“王有令在此，不可傷皇帝及沐國公。”可是，沐天波已經在“飲咒水”時被殺。
朱由榔的臨時行宮屍橫滿地，已無法居住，緬甸官員請朱由榔等移往別處暫住。沐天波屋內尚有內官、婦女二百餘人也聚作一處，“母哭其子，妻哭其夫，女哭其父，驚聞數十裏”。洗劫之後，幸存人員已無法生活，附近緬甸寺廟的僧眾送來飲食，才得以苟延殘喘。
二十一日，緬方把永曆君臣原住地清理以後，又請他們移迴此處，給他們送來了食物和衣服。二十五日，又送來鋪蓋、銀、布等物，說：“緬王實無此意，都是因為晉、鞏兩藩殺害地方百姓，緬民恨之入骨，因而報仇罷了。”
朱由榔經此番打擊，對前途已完全失望，但也不願意被送到朱宏三手上，那樣真比死了還難受。十月十八日，朱由榔對總兵鄧凱說：“太後又一次病倒了，如果天意不可挽迴，朱宏三那逆賊來殺朕就讓他來殺好了，你就不要管聯了。但是希望你能使太後骸骨得歸故土。”
這時緬甸當局之所以沒有立即殺掉朱由榔，是因為當時朱宏三的軍隊已經占領雲南，這時朱宏三的後軍大都督周玉帶著八萬士兵就在明緬邊境，周玉在半年前將李定國的一萬多殘軍全部消滅幹淨，李定國也死在軍中。
原本按照周玉的意思直接殺過去，什麽緬甸王、朱由榔，統統殺光完事。但是這時周玉已經不是當年那個副營長了，而是新朝九位公爵之一。周玉的身邊人有人進言，朱由榔身份十分特殊，雖然皇帝有令生死不論，但是大家都知道現在朝中很多人都是當年朱由榔的舊臣，比如現在的雲貴總督呂大器。殺了朱由榔很簡單，但是那幫讀書人不敢得罪皇帝，那作為直接執行人的周玉可就倒了大黴。
周玉一想也對，現在已經不是戰爭年代，朝中文人的勢力逐漸壓過武將的勢力，以防萬一還是留朱由榔一命吧！
這樣周玉才行文緬甸政府，要他們交出朱由榔。莽白看到清兵勢不可擋，也想借此討好新興的神武政權。在周玉的威逼利誘下，莽白於神武十年十一月，將朱由榔及其家屬送交周玉。
周玉接受朱由榔後，在身邊謀士的建議下並不去親自拜見朱由榔，而是好吃好喝的將朱由榔供起來，畢竟朱由榔現在開始生死就不是周玉能管的了，一切都要北京的皇帝做決斷。
對朱宏三威脅最大的永曆政權被消滅，朱由榔被抓住，但是周玉沒有皇帝的命令並不敢隨便班師，所以派出一千名士兵押解朱由榔迴昆明，周玉自己帶著剩下的軍隊駐紮在明緬邊境。
周玉對待朱由榔還不錯，也沒有孽待他，每日定時給朱由榔夫妻還有太後、太子等人供奉食物。但是朱由榔心中還是有些後悔，不如當時自殺了事。
經過半個月的旅程，朱由榔迴到自己已經離開三年多的昆明，城還是那個城，民還是那些民，但是都已經不是他朱由榔的臣民了。
雲貴總督呂大器早已經接到周玉的消息，今天早上就準備停當來到城門外等候。呂大器的幕僚都勸呂大器不要這樣，雖然呂大器當過朱由榔的臣子，可是現在畢竟吃朱宏三的飯。並且朱宏三這個皇帝明顯的小心眼，萬一真覺著你呂大器和朱由榔舊情未了可怎麽辦？
但是呂大器並不管手下人的勸阻，現在自己雖然是朱宏三的臣子，但是畢竟當過朱由榔的內閣閣老，做人不能這麽無恥。
呂大器看到桂王的車子到了，趕緊進走幾步，上前跪倒施禮說道：“老臣呂大器，拜見陛下！”如果朱宏三在這一定要氣歪鼻子，朱宏三為了收買人心，規定士大夫看到皇帝都不用下跪，現在呂大器領著朱宏三的工資，竟然跪拜前主子，實在有些過分了。
這時朱由榔已經將一身龍袍脫了下來，換上普通的布衣，這時看到舊人也留下了眼淚。朱由榔上前攙扶起呂大器說道：“呂先生，現在你是神武陛下的臣子，不用在給我這個親王行禮了，讓陛下知道不好！”朱由榔為了活命，已經給朱宏三上書自行退位，還是當自己的桂王。
呂大器在朱由榔的攙扶下站起來，老淚縱橫的說道：“臣隻要當過陛下一天的臣子，就永遠是陛下的臣子！”
朱由榔看到呂大器這麽忠貞，再加上感歎自己的命運，不禁和呂大器抱頭痛哭。
二人哭完呂大器將朱由榔迎進昆明城，還是住在朱由榔以前的行宮中，不過呂大器人老奸馬老猾，知道那個昏君朱宏三什麽事都幹得出來。呂大器很怕昆明城中的錦衣衛將朱由榔暗害，所以親自帶著自己的衛兵守衛在朱由榔門口，生怕朱由榔有什麽不測。