穆帝這一罷工，整個朝野再次惶恐不安，一來是之前的反桓溫聯盟都是以穆帝為核心，有穆帝在這裏撐腰他們怎麽鬧都行，現在穆帝這個保護傘一撤，傘下的人立即就暴露在陽光下，自然是惶恐不安；二來桓溫這次實在太過強勢，直接帶兵進京，並且很快就控製了京城的防衛和禁軍宿衛，雖然沒有像王敦或蘇峻那樣直接帶兵上朝，但是也足以震懾群臣了，再加上前兩次叛亂時不少士族高官皆死於屠刀之下，這次顯然沒有人願意再當刀下之鬼。
當然，任何時代都不缺少忠臣與直臣，雖然東晉皇權是曆朝曆代最弱的，也是最讓人瞧不起的，但是在忠君思想的影響下，還是有忠臣的，廷尉王允之就是一位，在將武陵王等人打入大牢之後，王允之就立即著手審閱偵查，王允之即是一位忠臣又是一位難得的直臣，出身琅琊王氏的他根本就不懼桓溫的滔威，雖然桓溫的弟弟桓秘多次以協助調查的名義向王允之暗示，但是王允之依然不為所動，依然堅持秉公執法，郗超害怕王允之壞了大局，屢次向桓溫進諫殺掉王允之，但是桓溫認為王允之是難得的直臣，所以一直不肯下手，所以王允之得以秉公辦案。
而王允之的辦案能力確實是一流的，在短短的三天時間裏就全部調查完畢，最終的結果也是顯而易見的，那就是查無實據。
然而此時的朝堂已然不是三天前的朝堂了，在穆帝病倒之後，司馬昱主持朝政，在桓溫的要求下，司馬昱恢複了郗超的職務，同時罷免了一大批跟隨武陵王司馬曦反桓溫的大小官員，桓溫實際上已經控製了朝政。
所以對於王允之呈上來的“查無實據，並無謀反跡象”的偵辦結果，桓溫並不感到意外，這本來就是一起他故意製造的冤案，王允之又是出了名的直臣，若是能查出實據來那就怪了。
而桓溫之所以任由王允之秉公辦案，除了欣賞王允之這樣的直臣以外，另一個用意就是效仿秦國時的趙高，當年趙高為了檢驗自己的威望，於是便設局試探群臣，故意拉了一隻鹿來，當著皇帝的麵說這一匹馬，皇帝大笑說這明明是鹿，怎麽可能是馬呢？但是沒想到群臣懼怕趙高的淫威，紛紛順著趙高的意思說這確實是馬，而沒有順著趙高意思而說這是鹿的，自然也在日後被趙高用各種理由給處死了。
桓溫當然不想當趙高，但是為了徹底掌控朝政，將反對自己的勢力徹底打壓下去，然後自己才能放心的北伐，否則的話後方總有人給你搗亂，自然是鬧心的很。
於是在王允之偵辦結果出來之後，桓溫又再次上書要求誅殺武陵王司馬曦、新蔡王司馬晃等人，並且言詞異常激烈，在桓溫的帶動下，之前早已投靠桓溫的士族高官也紛紛上書要求誅殺二王其及黨羽，這讓主持朝政的司馬昱很是難堪，他明知道司馬曦是被冤枉的，並且廷尉也已經明確給出了偵辦結果的情況下，卻依然不敢釋放武陵王等人，身為攝政王卻連自己的親哥哥都救不了，這讓司馬昱很是悲傷。
為了保住自己哥哥的命，司馬昱最終還是放下身段，以近乎哀求的口吻向桓溫說道：“對於武陵王等人叛亂之事，即然廷尉已經查無實據，就已經證明此事子虛烏有，但是大司馬卻依然要誅殺武陵王等人，同室操戈的事情在晉惠帝時代已經上演過一次了，結果就是山河淪陷，生靈塗炭，我實在不忍再出現這樣的事情，所以對於這件事情，我既悲痛惋惜，又驚恐不安，這種事我連聽都不願意聽，何況還要我下令呢!還望大司馬再研究研究!”
見司馬昱如此低聲下氣，桓溫也不好再逼迫他，於是便不再進言，見桓溫不再進言，其他人自然也不會再進言，於是司馬曦等人再次逃過一劫。
但是桓溫殺人立威的決心十分的堅定，在退朝之後，桓溫再次召集郗超、江彪、桓秘等人商議，郗超的意思是桓溫不應該顧及司馬昱，此時的司馬昱已是跛腳之鴨，空有攝政的頭銜，其實啥事也指揮不動；
郗超建議桓溫應該一鼓作氣，繼續逼迫司馬昱，讓司馬昱親自下令誅殺武陵王等人，這樣既避免了桓溫誅殺宗室的壞名聲，又讓司馬昱聲望盡失，從此普天之下就再無人敢跟桓溫作對了。
郗超的建議痛快是痛快，但是桓溫並不想做的這麽絕，於是郗超便又說出了第二個建議，那就是讓宗室告宗室，從宗室當中再找一個不中用的王爺，上書請求誅殺武陵王等人，這樣就可以把桓溫給摘出來，避免了桓溫的尷尬。
“讓宗室告宗室？”桓溫默念了一句，這計好是好，但是再去哪裏找這樣的宗室呢？新蔡王司馬晃是個軟蛋，所以嚇唬嚇唬就行了，其他的王爺當中琅琊王司馬丕一心求仙，天天在家練丹玩，不問政事很多年，東海王司馬奕還小，所以近支親王肯定是不行了，隻能從其他旁支王爺當中選了。
經過反複討論，郗超等人覺得譙王司馬恬正合適，之所以說他合適，是因為此時的司馬恬正擔任禦史中丞的職務，而禦史中丞就是負責監督、彈劾官員的，所以讓司馬恬上書朝廷也算是職責所在。
而且司馬恬的父親司馬無忌還跟桓溫同過事，當年桓溫剛收複益州之時，朝廷為了限製桓溫勢力的發展，派司馬無忌前往成都擔任益州刺史，當時桓溫雖然很反對，但是因為當時的實力不行，最終也隻得默認了。
雖然司馬無忌去益州是朝廷監視桓溫的，但是司馬無忌到任成都之後，也並沒有給桓溫搗亂，相反還很積極的配合桓溫的工作，這讓桓溫很是感激，對司馬無忌讚譽有加。
司馬無忌去世後，他的兒子司馬恬繼承譙王的爵位。司馬恬很有才幹，曾任司雍秦梁四州的大中正，負責為國選材，後來又擔任太子詹事、吳國內史、尚書右仆射等職，因為是宗室當中少有的有才幹之人，所以在穆帝親政之後，又把司馬恬提拔為禦史中丞，負責監察百官。
譙王的始封王是司馬懿六弟司馬進的長子司馬遜，在宗室當中算是非常偏遠的旁支王爺了，雖然是旁支，但也是王爺，由譙王司馬恬出麵彈劾武陵王等人，不管從哪方麵看，都是最合適不過的了。
所以，桓溫在聽完郗超的分析之後，也覺得司馬恬最合適，這次他沒有讓桓秘出馬，而是直接派郗超去找司馬恬，郗超也發揮了自己不要臉的精神，在威逼利誘之下，司馬恬隻得答應第二天的時候上書彈劾武陵王司馬曦。
當然，任何時代都不缺少忠臣與直臣，雖然東晉皇權是曆朝曆代最弱的，也是最讓人瞧不起的，但是在忠君思想的影響下，還是有忠臣的，廷尉王允之就是一位，在將武陵王等人打入大牢之後，王允之就立即著手審閱偵查，王允之即是一位忠臣又是一位難得的直臣，出身琅琊王氏的他根本就不懼桓溫的滔威，雖然桓溫的弟弟桓秘多次以協助調查的名義向王允之暗示，但是王允之依然不為所動，依然堅持秉公執法，郗超害怕王允之壞了大局，屢次向桓溫進諫殺掉王允之，但是桓溫認為王允之是難得的直臣，所以一直不肯下手，所以王允之得以秉公辦案。
而王允之的辦案能力確實是一流的，在短短的三天時間裏就全部調查完畢，最終的結果也是顯而易見的，那就是查無實據。
然而此時的朝堂已然不是三天前的朝堂了，在穆帝病倒之後，司馬昱主持朝政，在桓溫的要求下，司馬昱恢複了郗超的職務，同時罷免了一大批跟隨武陵王司馬曦反桓溫的大小官員，桓溫實際上已經控製了朝政。
所以對於王允之呈上來的“查無實據，並無謀反跡象”的偵辦結果，桓溫並不感到意外，這本來就是一起他故意製造的冤案，王允之又是出了名的直臣，若是能查出實據來那就怪了。
而桓溫之所以任由王允之秉公辦案，除了欣賞王允之這樣的直臣以外，另一個用意就是效仿秦國時的趙高，當年趙高為了檢驗自己的威望，於是便設局試探群臣，故意拉了一隻鹿來，當著皇帝的麵說這一匹馬，皇帝大笑說這明明是鹿，怎麽可能是馬呢？但是沒想到群臣懼怕趙高的淫威，紛紛順著趙高的意思說這確實是馬，而沒有順著趙高意思而說這是鹿的，自然也在日後被趙高用各種理由給處死了。
桓溫當然不想當趙高，但是為了徹底掌控朝政，將反對自己的勢力徹底打壓下去，然後自己才能放心的北伐，否則的話後方總有人給你搗亂，自然是鬧心的很。
於是在王允之偵辦結果出來之後，桓溫又再次上書要求誅殺武陵王司馬曦、新蔡王司馬晃等人，並且言詞異常激烈，在桓溫的帶動下，之前早已投靠桓溫的士族高官也紛紛上書要求誅殺二王其及黨羽，這讓主持朝政的司馬昱很是難堪，他明知道司馬曦是被冤枉的，並且廷尉也已經明確給出了偵辦結果的情況下，卻依然不敢釋放武陵王等人，身為攝政王卻連自己的親哥哥都救不了，這讓司馬昱很是悲傷。
為了保住自己哥哥的命，司馬昱最終還是放下身段，以近乎哀求的口吻向桓溫說道：“對於武陵王等人叛亂之事，即然廷尉已經查無實據，就已經證明此事子虛烏有，但是大司馬卻依然要誅殺武陵王等人，同室操戈的事情在晉惠帝時代已經上演過一次了，結果就是山河淪陷，生靈塗炭，我實在不忍再出現這樣的事情，所以對於這件事情，我既悲痛惋惜，又驚恐不安，這種事我連聽都不願意聽，何況還要我下令呢!還望大司馬再研究研究!”
見司馬昱如此低聲下氣，桓溫也不好再逼迫他，於是便不再進言，見桓溫不再進言，其他人自然也不會再進言，於是司馬曦等人再次逃過一劫。
但是桓溫殺人立威的決心十分的堅定，在退朝之後，桓溫再次召集郗超、江彪、桓秘等人商議，郗超的意思是桓溫不應該顧及司馬昱，此時的司馬昱已是跛腳之鴨，空有攝政的頭銜，其實啥事也指揮不動；
郗超建議桓溫應該一鼓作氣，繼續逼迫司馬昱，讓司馬昱親自下令誅殺武陵王等人，這樣既避免了桓溫誅殺宗室的壞名聲，又讓司馬昱聲望盡失，從此普天之下就再無人敢跟桓溫作對了。
郗超的建議痛快是痛快，但是桓溫並不想做的這麽絕，於是郗超便又說出了第二個建議，那就是讓宗室告宗室，從宗室當中再找一個不中用的王爺，上書請求誅殺武陵王等人，這樣就可以把桓溫給摘出來，避免了桓溫的尷尬。
“讓宗室告宗室？”桓溫默念了一句，這計好是好，但是再去哪裏找這樣的宗室呢？新蔡王司馬晃是個軟蛋，所以嚇唬嚇唬就行了，其他的王爺當中琅琊王司馬丕一心求仙，天天在家練丹玩，不問政事很多年，東海王司馬奕還小，所以近支親王肯定是不行了，隻能從其他旁支王爺當中選了。
經過反複討論，郗超等人覺得譙王司馬恬正合適，之所以說他合適，是因為此時的司馬恬正擔任禦史中丞的職務，而禦史中丞就是負責監督、彈劾官員的，所以讓司馬恬上書朝廷也算是職責所在。
而且司馬恬的父親司馬無忌還跟桓溫同過事，當年桓溫剛收複益州之時，朝廷為了限製桓溫勢力的發展，派司馬無忌前往成都擔任益州刺史，當時桓溫雖然很反對，但是因為當時的實力不行，最終也隻得默認了。
雖然司馬無忌去益州是朝廷監視桓溫的，但是司馬無忌到任成都之後，也並沒有給桓溫搗亂，相反還很積極的配合桓溫的工作，這讓桓溫很是感激，對司馬無忌讚譽有加。
司馬無忌去世後，他的兒子司馬恬繼承譙王的爵位。司馬恬很有才幹，曾任司雍秦梁四州的大中正，負責為國選材，後來又擔任太子詹事、吳國內史、尚書右仆射等職，因為是宗室當中少有的有才幹之人，所以在穆帝親政之後，又把司馬恬提拔為禦史中丞，負責監察百官。
譙王的始封王是司馬懿六弟司馬進的長子司馬遜，在宗室當中算是非常偏遠的旁支王爺了，雖然是旁支，但也是王爺，由譙王司馬恬出麵彈劾武陵王等人，不管從哪方麵看，都是最合適不過的了。
所以，桓溫在聽完郗超的分析之後，也覺得司馬恬最合適，這次他沒有讓桓秘出馬，而是直接派郗超去找司馬恬，郗超也發揮了自己不要臉的精神，在威逼利誘之下，司馬恬隻得答應第二天的時候上書彈劾武陵王司馬曦。