卻說江陰被陷，明遺臣已亡了一半，隻有宜興、太湖、吳江、徽州等處，尚有抗清的明臣，至是勢孤力危。
適洪承疇到江南，遣降將蘇州提督吳兆勝進攻吳江，在長白蕩遇著吳易伏兵，被殺得大敗虧輸，清兵死傷無數，被繳獲戰船數十艘。恰巧貝勒博洛自杭州北還，擊敗徐石麟於嘉興，逐走陳梧於平湖，沿途略地，直至吳江，遇著吳兆勝敗軍，與之聯合，再攻吳易。
得勝以後吳昜對清軍疏於防範，豈知吳勝兆早先收買了一批亡命之徒，假稱反清打入內部伺機破壞。吳昜不聽孫兆奎、沈自炳的規勸，祝酒慶功毫無警惕。
誰知博洛命清兵四麵分攻，將長白蕩和何家漾團團包圍，封鎖了所有出入的港汊。老天又下起大雨，吳昜、孫兆奎、沈自炳發現敵情全力布防，在梅家柵一帶來迴督戰。清軍火炮齊鳴，箭如雨下，而吳易軍因雨兵器受潮，舉炮炮不響，拉弓弦脫膠，竟無迴手之力。又有混入的奸細作亂，吳易軍將士分不出敵我而自相殘殺，死傷眾多。清軍的包圍圈越來越小，吳昜感到形勢不妙，準備帶餘部從何家漾向南撤逃。這時孫兆奎被捕，沈自炳兄弟和諸多將領戰死，吳昜的老父和妻女、孫兆奎的妻女都投水而亡。吳昜全軍覆沒，落水隻身逃遁，隻剩下長白蕩和何家漾的湖水嗚咽哭泣。
江南民兵，至此已盡，洪承疇又遣都統葉臣，總兵張天璜，進攻徽州。明僉都禦史金聲在績溪起兵，招募義勇，分駐要塞，聯絡巡撫邱祖德，職方郎中尹民興，吳應箕等，互為援應，並遣使通表福州。此時唐王朱聿鍵已在鄭芝龍等人的擁立下，在福州監國稱帝，年號隆武。
朱聿鍵接閱金聲奏報，喜不自勝，命他為右都禦史，兼兵部右侍郎，總督諸道兵馬。金聲亦感激圖報，率門生江天一取旌德，拔寧國，聲威頗振。怎奈人心未死，天意難違，清兵從間道入叢山關，直趨績溪，金聲急麾兵迴援，與清兵相持。偏偏出了個黃澍，口口聲聲，說要恢複大明，金聲道他是故明臣子，可共患難，不意他竟暗通清將，乘夜開城，放入清兵。
績溪遂失陷，金聲及門生江天一、總兵範雲龍等皆被擒，隻逃脫一個尹民興。被押到南京後，洪承疇以同年進士身份勸金聲歸降，金聲雙目圓睜，大聲怒斥道：“豈有受恩如爾而降者！”
江天一朗誦崇禎帝祭文以辱之。說要學習洪亨九先生，洪承疇說我就是，金聲說道：“誰不知道洪先生已經殉國了！先帝（崇禎）慟哭輟朝，賜祭九壇，封妻蔭子，你竟敢假冒洪經略？“洪承疇被氣得無言以對。
清豫王多鐸看重金聲，洪承疇殺金聲有顧慮，就暗示金聲出家為僧。金聲說：“何以為忠臣！”洪承疇謂其“火性未除”，遂殺金聲。十二月五日，金聲在南京雨花台慷慨就義。江天一從死，臨刑前大唿：“流芳百世，遺臭萬年，此一息也！”金聲弟金經、總兵範雲龍一同就義。臨刑前，他遙拜明孝陵後端坐飲刃。
此時撫州被攻克，益王朱慈炲逃亡廣東。長江上下遊基本被清兵平定，捷報紛紛到京，隻剩唐王朱聿鍵、魯王朱以海盤踞浙閩，不得不再行進攻。
多爾袞意欲遣豪格前去，適流張獻忠又盤踞四川，任情屠掠，難民流徙他處，紛紛泣籲清廷。多爾袞遂趁這機會，命豪格為靖遠大將軍，與衍禧郡王羅洛渾、貝勒尼堪等一起西征，又令平西王吳三桂等西略四川。
浙閩的軍事，仍令博洛前行，南明隆武二年，清朝順治三年(1646年)，封博洛為征南大將軍，率費英東第七子一等公圖賴，貝子屯齊，南下杭州。
此時南明內部的黨派鬥爭異常嚴重，魯、唐二王之間為爭正統地位自相水火，各自為戰。按輩分而論唐王朱聿鍵是魯王朱以海的叔叔，從擁立時間上來看，朱聿鍵略早於朱以海，而且已經稱帝。唐王欲魯王退就藩屬，朱聿鍵命都禦史陸清源攜帶白銀十萬兩前往浙東犒師，卻被朱以海部將殺害，餉銀也被劫去。但由於朱以海政權中許多文官武將向隆武朝廷上疏效忠，朱聿鍵也加意籠絡，給他們進官封爵
朱以海針鋒相對采取挖牆腳措施，派左軍都督裘兆錦、林必達來以公爵封鄭芝龍兄弟。朱聿鍵聞訊大怒，將來使囚禁。不久，又殺朱以海所遣使者總兵陳謙。
由於朱以海堅持同隆武朝廷分庭抗禮，又因地理位置監國政權處於抗清的前線，給福建朱聿鍵政權提供了屏障，隆武朝廷的實權人物鄭芝龍對這種局麵心中竊喜，按兵不動有了借口。
恰此時清朝封博洛為征南大將軍征討浙東，五月，博洛率兵渡錢塘江，忽見來了一隻乘風鼓浪的大艦，艦首立著一位盔甲鮮明的主將，正是故明兵部尚書張國維。兩下麾眾摶戰，不一時，博洛的坐船，被明軍擊了一個大窟窿，驚駛迴岸，清兵亦相率奔迴，登岸返城。張國維乘勝至城下，竭力攻打，忽報方國安擁了魯王已至東岸，張國維隻得退迴迎駕，暫時休息。
方國安在朱常淓南明弘光政權成立時依附於馬士英，掛鎮南將軍印，鎮江浦。左良玉以“清君側”之名起兵南下時，方國安倉皇東走。
後清軍南下，方國安擁兵入浙，軍紀敗壞，百姓深受其害，民心不附。潞王朱常淓在杭州降清後，馬士英和阮大铖先後投靠於方國安。魯王朱以海監國後晉封方國安為越國公，並且築壇拜方國安為大將，節製諸軍。
此時方國安擁魯王朱以海紮營於錢塘江東岸，綿亙二百裏，又請調張國維守義烏。張國維一去，清兵遂運舟載炮，大舉渡江。
剛好這年夏天浙江久旱不雨，錢塘江水涸流細。清軍見水深不過馬腹，博洛遣統領圖賴等從上流渡江，分兵兩路進擊紹興，清兵策馬徑渡，方國安不敢力拒，錢塘江防線頓時土崩瓦解，大批明朝官吏投降清軍。方國安、阮大铖等亦帶領兵馬赴清營投降。
朱以海在張名振等人護衛下離開紹興，經台州乘船逃往海上。
博洛率清兵平定紹興後又連克溫州、台州等地，又在降將阮大铖引導下進圍金華。阮大铖馳書招降，朱大典裂書並殺招撫使，率全程軍民固守金華。
朱大典固守月餘，清軍未能越雷池一步。不久，清軍調來紅衣大炮，阮大铖知西門新築土未堅，以炮專攻其處，城崩。朱大典家中婦女先投井自殉，朱大典自己攜火繩與子孫、賓客聚於火藥庫中引爆殉國。城陷後，清兵屠城三日，殺戮甚慘，死者不可勝數。
適洪承疇到江南，遣降將蘇州提督吳兆勝進攻吳江，在長白蕩遇著吳易伏兵，被殺得大敗虧輸，清兵死傷無數，被繳獲戰船數十艘。恰巧貝勒博洛自杭州北還，擊敗徐石麟於嘉興，逐走陳梧於平湖，沿途略地，直至吳江，遇著吳兆勝敗軍，與之聯合，再攻吳易。
得勝以後吳昜對清軍疏於防範，豈知吳勝兆早先收買了一批亡命之徒，假稱反清打入內部伺機破壞。吳昜不聽孫兆奎、沈自炳的規勸，祝酒慶功毫無警惕。
誰知博洛命清兵四麵分攻，將長白蕩和何家漾團團包圍，封鎖了所有出入的港汊。老天又下起大雨，吳昜、孫兆奎、沈自炳發現敵情全力布防，在梅家柵一帶來迴督戰。清軍火炮齊鳴，箭如雨下，而吳易軍因雨兵器受潮，舉炮炮不響，拉弓弦脫膠，竟無迴手之力。又有混入的奸細作亂，吳易軍將士分不出敵我而自相殘殺，死傷眾多。清軍的包圍圈越來越小，吳昜感到形勢不妙，準備帶餘部從何家漾向南撤逃。這時孫兆奎被捕，沈自炳兄弟和諸多將領戰死，吳昜的老父和妻女、孫兆奎的妻女都投水而亡。吳昜全軍覆沒，落水隻身逃遁，隻剩下長白蕩和何家漾的湖水嗚咽哭泣。
江南民兵，至此已盡，洪承疇又遣都統葉臣，總兵張天璜，進攻徽州。明僉都禦史金聲在績溪起兵，招募義勇，分駐要塞，聯絡巡撫邱祖德，職方郎中尹民興，吳應箕等，互為援應，並遣使通表福州。此時唐王朱聿鍵已在鄭芝龍等人的擁立下，在福州監國稱帝，年號隆武。
朱聿鍵接閱金聲奏報，喜不自勝，命他為右都禦史，兼兵部右侍郎，總督諸道兵馬。金聲亦感激圖報，率門生江天一取旌德，拔寧國，聲威頗振。怎奈人心未死，天意難違，清兵從間道入叢山關，直趨績溪，金聲急麾兵迴援，與清兵相持。偏偏出了個黃澍，口口聲聲，說要恢複大明，金聲道他是故明臣子，可共患難，不意他竟暗通清將，乘夜開城，放入清兵。
績溪遂失陷，金聲及門生江天一、總兵範雲龍等皆被擒，隻逃脫一個尹民興。被押到南京後，洪承疇以同年進士身份勸金聲歸降，金聲雙目圓睜，大聲怒斥道：“豈有受恩如爾而降者！”
江天一朗誦崇禎帝祭文以辱之。說要學習洪亨九先生，洪承疇說我就是，金聲說道：“誰不知道洪先生已經殉國了！先帝（崇禎）慟哭輟朝，賜祭九壇，封妻蔭子，你竟敢假冒洪經略？“洪承疇被氣得無言以對。
清豫王多鐸看重金聲，洪承疇殺金聲有顧慮，就暗示金聲出家為僧。金聲說：“何以為忠臣！”洪承疇謂其“火性未除”，遂殺金聲。十二月五日，金聲在南京雨花台慷慨就義。江天一從死，臨刑前大唿：“流芳百世，遺臭萬年，此一息也！”金聲弟金經、總兵範雲龍一同就義。臨刑前，他遙拜明孝陵後端坐飲刃。
此時撫州被攻克，益王朱慈炲逃亡廣東。長江上下遊基本被清兵平定，捷報紛紛到京，隻剩唐王朱聿鍵、魯王朱以海盤踞浙閩，不得不再行進攻。
多爾袞意欲遣豪格前去，適流張獻忠又盤踞四川，任情屠掠，難民流徙他處，紛紛泣籲清廷。多爾袞遂趁這機會，命豪格為靖遠大將軍，與衍禧郡王羅洛渾、貝勒尼堪等一起西征，又令平西王吳三桂等西略四川。
浙閩的軍事，仍令博洛前行，南明隆武二年，清朝順治三年(1646年)，封博洛為征南大將軍，率費英東第七子一等公圖賴，貝子屯齊，南下杭州。
此時南明內部的黨派鬥爭異常嚴重，魯、唐二王之間為爭正統地位自相水火，各自為戰。按輩分而論唐王朱聿鍵是魯王朱以海的叔叔，從擁立時間上來看，朱聿鍵略早於朱以海，而且已經稱帝。唐王欲魯王退就藩屬，朱聿鍵命都禦史陸清源攜帶白銀十萬兩前往浙東犒師，卻被朱以海部將殺害，餉銀也被劫去。但由於朱以海政權中許多文官武將向隆武朝廷上疏效忠，朱聿鍵也加意籠絡，給他們進官封爵
朱以海針鋒相對采取挖牆腳措施，派左軍都督裘兆錦、林必達來以公爵封鄭芝龍兄弟。朱聿鍵聞訊大怒，將來使囚禁。不久，又殺朱以海所遣使者總兵陳謙。
由於朱以海堅持同隆武朝廷分庭抗禮，又因地理位置監國政權處於抗清的前線，給福建朱聿鍵政權提供了屏障，隆武朝廷的實權人物鄭芝龍對這種局麵心中竊喜，按兵不動有了借口。
恰此時清朝封博洛為征南大將軍征討浙東，五月，博洛率兵渡錢塘江，忽見來了一隻乘風鼓浪的大艦，艦首立著一位盔甲鮮明的主將，正是故明兵部尚書張國維。兩下麾眾摶戰，不一時，博洛的坐船，被明軍擊了一個大窟窿，驚駛迴岸，清兵亦相率奔迴，登岸返城。張國維乘勝至城下，竭力攻打，忽報方國安擁了魯王已至東岸，張國維隻得退迴迎駕，暫時休息。
方國安在朱常淓南明弘光政權成立時依附於馬士英，掛鎮南將軍印，鎮江浦。左良玉以“清君側”之名起兵南下時，方國安倉皇東走。
後清軍南下，方國安擁兵入浙，軍紀敗壞，百姓深受其害，民心不附。潞王朱常淓在杭州降清後，馬士英和阮大铖先後投靠於方國安。魯王朱以海監國後晉封方國安為越國公，並且築壇拜方國安為大將，節製諸軍。
此時方國安擁魯王朱以海紮營於錢塘江東岸，綿亙二百裏，又請調張國維守義烏。張國維一去，清兵遂運舟載炮，大舉渡江。
剛好這年夏天浙江久旱不雨，錢塘江水涸流細。清軍見水深不過馬腹，博洛遣統領圖賴等從上流渡江，分兵兩路進擊紹興，清兵策馬徑渡，方國安不敢力拒，錢塘江防線頓時土崩瓦解，大批明朝官吏投降清軍。方國安、阮大铖等亦帶領兵馬赴清營投降。
朱以海在張名振等人護衛下離開紹興，經台州乘船逃往海上。
博洛率清兵平定紹興後又連克溫州、台州等地，又在降將阮大铖引導下進圍金華。阮大铖馳書招降，朱大典裂書並殺招撫使，率全程軍民固守金華。
朱大典固守月餘，清軍未能越雷池一步。不久，清軍調來紅衣大炮，阮大铖知西門新築土未堅，以炮專攻其處，城崩。朱大典家中婦女先投井自殉，朱大典自己攜火繩與子孫、賓客聚於火藥庫中引爆殉國。城陷後，清兵屠城三日，殺戮甚慘，死者不可勝數。