亞特蘭蒂斯帝國禁軍分為皇家艦隊和近衛艦隊。
皇家艦隊有三大艦隊：冠以帝國之名的皇帝禦用艦隊（下轄十五支皇家禁衛軍團）以及南鬥北鬥兩大皇家支援艦隊（各自下轄六支和七支艦隊共十三支艦隊）。
近衛艦隊則以天空的八十八星座命名，共有八十八支艦隊。黃道十二宮為sss級，每個有三個s級近衛集團軍，共36個。其餘76個ss級艦隊每個有兩個s級近衛集團軍，共152個。
皇家支援艦隊下轄六十五個a級戰略支援集團軍，充當消防員的角色，屬於戰略預備隊。
皇家亞特蘭蒂斯艦隊（皇帝禦駕ex級）
第一皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神話
第二皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神聖
第三皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神跡
第四皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神祗
第五皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神武
第六皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神威
第七皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神勇
第八皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神怒
第九皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神憎
第十皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神啟
第十一皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神泣
第十二皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神權
第十三皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神座
第十四皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）
第十五皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神殤
南十字星近衛艦隊ss級（在編，八十八星座之一）
第十八近衛合成集團軍（s級）
第二十八近衛合成集團軍（s級）
皇家北鬥七星艦隊sss級（下轄天樞、天璿、天璣、天權、玉衡、開陽、搖光七支艦隊）第一到第三十五皇家戰略支援兵團
皇家南鬥六星艦隊sss級（下轄天府、天梁、天機、天同、天相、七殺六支艦隊）
第三十六到第六十五皇家戰略支援兵團
皇家艦隊有三大艦隊：冠以帝國之名的皇帝禦用艦隊（下轄十五支皇家禁衛軍團）以及南鬥北鬥兩大皇家支援艦隊（各自下轄六支和七支艦隊共十三支艦隊）。
近衛艦隊則以天空的八十八星座命名，共有八十八支艦隊。黃道十二宮為sss級，每個有三個s級近衛集團軍，共36個。其餘76個ss級艦隊每個有兩個s級近衛集團軍，共152個。
皇家支援艦隊下轄六十五個a級戰略支援集團軍，充當消防員的角色，屬於戰略預備隊。
皇家亞特蘭蒂斯艦隊（皇帝禦駕ex級）
第一皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神話
第二皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神聖
第三皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神跡
第四皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神祗
第五皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神武
第六皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神威
第七皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神勇
第八皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神怒
第九皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神憎
第十皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神啟
第十一皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神泣
第十二皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神權
第十三皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神座
第十四皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）
第十五皇家禁衛軍團（s級王牌部隊）神殤
南十字星近衛艦隊ss級（在編，八十八星座之一）
第十八近衛合成集團軍（s級）
第二十八近衛合成集團軍（s級）
皇家北鬥七星艦隊sss級（下轄天樞、天璿、天璣、天權、玉衡、開陽、搖光七支艦隊）第一到第三十五皇家戰略支援兵團
皇家南鬥六星艦隊sss級（下轄天府、天梁、天機、天同、天相、七殺六支艦隊）
第三十六到第六十五皇家戰略支援兵團