緊靠著木葉村的山穀夜裏突發大水，而且冒出來的還是濃稠如墨汁一般的黑水，這自然第一時間就驚動了村子裏巡邏的忍者。
暗部也迅速做出反應，派出人員前往查探的同時，連夜向三代火影和波風水門匯報了這個情況。
木葉村的組織能力和忍者的執行力都非常出色，一係列行動並沒有引起村子的騷亂，村民們也都大多不知所覺，依然沉睡在自己甜美的夢鄉裏。
但近日來到木葉的各國忍者幾乎都是本國的精銳，木葉的異常還是引起了他們之中不少人的注意。這些人都在猜測木葉究竟發生了什麽，一些交好國家的忍者甚至連夜互通消息，希望吃到第一手的好瓜。
當暗部開始進行調查的時候，上杉真司和大蛇丸已經離開了研究所了。暗部最終得出的調查結果就是，大蛇丸帶著一名不明身份的忍者洗劫了根組織的實驗室。
根據根組織實驗室中殘留的人體實驗的痕跡，暗部目前的推測就是兩方可能因為實驗出現了衝突，大蛇丸出手盜取了根組織的實驗成果。
當然，即使木葉明令禁止人體實驗，大蛇丸的這次行動也跟伸張正義搭不上邊。暗部搜查了大蛇丸的住所，發現大蛇丸早已經清空住所裏的東西，基本也可以判定他叛逃木葉。
三代火影和波風水門得到暗部迴報的時候，波風水門極為震驚，而三代火影也表現得極為震驚。
波風水門對於根組織和大蛇丸進行人體實驗的事並不清楚，而三代火影對於對此早就知曉了，隻不過一直以來他都是睜一隻眼閉一隻眼。甚至於大蛇丸會叛逃，三代火影心中隱隱都有了一絲預感。
波風水門和三代火影經過一番商議之後，決定關於根組織偷偷進行人體實驗的事情在木葉內部暫時先壓下，等到火影繼任儀式結束之後再處理。
至於幾乎已經確定叛逃的大蛇丸，則出動一支暗部精銳去尋找他的蹤跡，待找到之後再安排力量將其逮捕迴木葉。
此時三代火影和波風水門都還不知道，原本準備等自己弟子正式就任火影之後再離開的自來也，已經獨自一人去追大蛇丸了。
......
在大蛇丸和上杉真司分贓的臨時地點，上杉真司已經將剩餘的十幾卷實驗資料都大致過目了一遍，兩人這場交易也算是正式結束了。
正當他們準備離開的時候，一個一陣響亮的腳步聲卻突然響了起來，聲音也距離兩人越來越近。
這個腳步聲之所以用‘響亮’來形容，是因為來人腳上穿著的是木屐。踩在附近這片岩石地麵上聲音格外明顯，而且似乎對方也絲毫沒有想要隱藏行跡的意思。
“是他。”
大蛇丸眼中閃過一絲異色，顯然他已經知道了來者何人。
上杉真司則是轉眼看向腳步聲傳來的方向，月光之下映照出一個高大挺拔的身影。
這是一個大約四十歲左右的中年男人，粗獷的國字臉上在眼睛處畫著兩道油彩，一頭張揚的白發更是極為顯眼。
他的身上穿著一套深青色的武士短裝，腳下踩著木屐，背後則背著一個長度超過一米半徑接近一尺的巨大卷軸。
來者不是旁人，正是與大蛇丸同為三忍之一的自來也！
（備注：這個時期自來也的裝束與在動畫漫畫初登場時的經典造型並不一樣）
“大蛇丸，你想要去哪裏！？”
自來也先是看了上杉真司一眼，然後便將目光放在了大蛇丸的身上。此時的他還以為一旁的上杉真司是大蛇丸的手下。
聽到自來也略帶著憤怒的質問，大蛇丸臉上的表情則顯得無所謂。他攤開雙手笑著說道：“自來也，沒想到你板起臉來倒是有幾分氣勢，比平時那副好色的傻樣順眼多了。”
自來也並沒有理會大蛇丸的調侃，隻是目光依舊死死地盯著對方，然後大聲喝道：“大蛇丸，迴答我的問題！”
大蛇丸緩緩收起了笑容，狹長的雙眼閃過一絲危險的光芒。
“難道你以為...我做事還需要向你解釋嗎？識相的話就立刻讓開，否則我不介意在這裏了結了你。”大蛇丸沉聲說道。
自來也聞言卻是一動不動擋在洞窟出口處，這變相表明了他的態度。不過自來也也並不想和自己的夥伴大打出手，微微沉默後說話的語氣終於稍微軟化了一些。
“你現在迴頭還來得及！老師那邊我會幫你說情，無論你犯了什麽錯誤，都一定會給你改過自新的機會。”
聽到自來也的話，大蛇丸卻是仰頭大笑了起來。他的笑聲之中滿是嘲諷的意味，仿佛自來也所說的話十分可笑一般。
“自來也，你還是這麽的天真！有時候我真不知道，為什麽你這樣的蠢貨竟然也能做忍者！還有你那個和你一樣天真的弟子，又憑什麽能成為火影！？”
見到大蛇丸這輕視和嘲弄他的表現，自來也並沒有動怒，反而看向對方的目光充滿了同情和遺憾。
“大蛇丸，看來到現在為止，你都沒有明白什麽是真正的忍者！罷了，既然你如此執迷不悟，就讓我來打醒你吧！”
自來也話音剛剛落下，一股強大的氣勢從他身上爆發而出。
自來也平時表現得豪邁不羈，但嚴肅的時候卻又正氣凜然。這樣的人天生氣場就很強大，在氣勢上非常容易震懾住別人，就算是上杉真司也對這位三忍之一的表現有幾分心驚。
暗部也迅速做出反應，派出人員前往查探的同時，連夜向三代火影和波風水門匯報了這個情況。
木葉村的組織能力和忍者的執行力都非常出色，一係列行動並沒有引起村子的騷亂，村民們也都大多不知所覺，依然沉睡在自己甜美的夢鄉裏。
但近日來到木葉的各國忍者幾乎都是本國的精銳，木葉的異常還是引起了他們之中不少人的注意。這些人都在猜測木葉究竟發生了什麽，一些交好國家的忍者甚至連夜互通消息，希望吃到第一手的好瓜。
當暗部開始進行調查的時候，上杉真司和大蛇丸已經離開了研究所了。暗部最終得出的調查結果就是，大蛇丸帶著一名不明身份的忍者洗劫了根組織的實驗室。
根據根組織實驗室中殘留的人體實驗的痕跡，暗部目前的推測就是兩方可能因為實驗出現了衝突，大蛇丸出手盜取了根組織的實驗成果。
當然，即使木葉明令禁止人體實驗，大蛇丸的這次行動也跟伸張正義搭不上邊。暗部搜查了大蛇丸的住所，發現大蛇丸早已經清空住所裏的東西，基本也可以判定他叛逃木葉。
三代火影和波風水門得到暗部迴報的時候，波風水門極為震驚，而三代火影也表現得極為震驚。
波風水門對於根組織和大蛇丸進行人體實驗的事並不清楚，而三代火影對於對此早就知曉了，隻不過一直以來他都是睜一隻眼閉一隻眼。甚至於大蛇丸會叛逃，三代火影心中隱隱都有了一絲預感。
波風水門和三代火影經過一番商議之後，決定關於根組織偷偷進行人體實驗的事情在木葉內部暫時先壓下，等到火影繼任儀式結束之後再處理。
至於幾乎已經確定叛逃的大蛇丸，則出動一支暗部精銳去尋找他的蹤跡，待找到之後再安排力量將其逮捕迴木葉。
此時三代火影和波風水門都還不知道，原本準備等自己弟子正式就任火影之後再離開的自來也，已經獨自一人去追大蛇丸了。
......
在大蛇丸和上杉真司分贓的臨時地點，上杉真司已經將剩餘的十幾卷實驗資料都大致過目了一遍，兩人這場交易也算是正式結束了。
正當他們準備離開的時候，一個一陣響亮的腳步聲卻突然響了起來，聲音也距離兩人越來越近。
這個腳步聲之所以用‘響亮’來形容，是因為來人腳上穿著的是木屐。踩在附近這片岩石地麵上聲音格外明顯，而且似乎對方也絲毫沒有想要隱藏行跡的意思。
“是他。”
大蛇丸眼中閃過一絲異色，顯然他已經知道了來者何人。
上杉真司則是轉眼看向腳步聲傳來的方向，月光之下映照出一個高大挺拔的身影。
這是一個大約四十歲左右的中年男人，粗獷的國字臉上在眼睛處畫著兩道油彩，一頭張揚的白發更是極為顯眼。
他的身上穿著一套深青色的武士短裝，腳下踩著木屐，背後則背著一個長度超過一米半徑接近一尺的巨大卷軸。
來者不是旁人，正是與大蛇丸同為三忍之一的自來也！
（備注：這個時期自來也的裝束與在動畫漫畫初登場時的經典造型並不一樣）
“大蛇丸，你想要去哪裏！？”
自來也先是看了上杉真司一眼，然後便將目光放在了大蛇丸的身上。此時的他還以為一旁的上杉真司是大蛇丸的手下。
聽到自來也略帶著憤怒的質問，大蛇丸臉上的表情則顯得無所謂。他攤開雙手笑著說道：“自來也，沒想到你板起臉來倒是有幾分氣勢，比平時那副好色的傻樣順眼多了。”
自來也並沒有理會大蛇丸的調侃，隻是目光依舊死死地盯著對方，然後大聲喝道：“大蛇丸，迴答我的問題！”
大蛇丸緩緩收起了笑容，狹長的雙眼閃過一絲危險的光芒。
“難道你以為...我做事還需要向你解釋嗎？識相的話就立刻讓開，否則我不介意在這裏了結了你。”大蛇丸沉聲說道。
自來也聞言卻是一動不動擋在洞窟出口處，這變相表明了他的態度。不過自來也也並不想和自己的夥伴大打出手，微微沉默後說話的語氣終於稍微軟化了一些。
“你現在迴頭還來得及！老師那邊我會幫你說情，無論你犯了什麽錯誤，都一定會給你改過自新的機會。”
聽到自來也的話，大蛇丸卻是仰頭大笑了起來。他的笑聲之中滿是嘲諷的意味，仿佛自來也所說的話十分可笑一般。
“自來也，你還是這麽的天真！有時候我真不知道，為什麽你這樣的蠢貨竟然也能做忍者！還有你那個和你一樣天真的弟子，又憑什麽能成為火影！？”
見到大蛇丸這輕視和嘲弄他的表現，自來也並沒有動怒，反而看向對方的目光充滿了同情和遺憾。
“大蛇丸，看來到現在為止，你都沒有明白什麽是真正的忍者！罷了，既然你如此執迷不悟，就讓我來打醒你吧！”
自來也話音剛剛落下，一股強大的氣勢從他身上爆發而出。
自來也平時表現得豪邁不羈，但嚴肅的時候卻又正氣凜然。這樣的人天生氣場就很強大，在氣勢上非常容易震懾住別人，就算是上杉真司也對這位三忍之一的表現有幾分心驚。