故事從小醜帶著手下搶了一家黑道的銀行開始，
手下們被小醜的伎倆玩弄，開始自相殘殺。當假冒的蝙蝠俠試著阻礙黑道與稻草人之間的毒品交易。此時真的蝙蝠俠現身，而後他在戰鬥中因為盔甲太過笨重而受了傷，讓他想重新設計蝙蝠裝。蝙蝠俠、高登隊長和新的檢察長哈維丹特計劃將黑幫斬草除根，哈維就能當上公開的英雄。同時布魯斯發現瑞秋在與丹特交往。
黑幫老大開會討論如何對付蝙蝠俠、高登和丹特，華裔的黑幫會計劉先生告訴黑幫老大，他搶先在丹特所策劃的扣押黑錢計劃執行前，就將黑道的錢移往香港。小醜突然現身並提議用一半的黑錢，來雇用他殺死蝙蝠俠，遭到黑幫拒絕。
當蝙蝠俠順利抓住逃迴香港的劉並轉交給高登後，黑道同意雇用小醜殺死蝙蝠俠。此時小醜向全高譚市宣布，隻要蝙蝠俠一天不自首，往後每天都會有人死亡。
當小醜暗殺了警長羅伯和審判黑幫的法官等公眾官員後，布魯斯決定自首。在他自首前，丹特搶先宣稱自己就是蝙蝠俠，希望借此引出小醜。小醜中計現身想殺死丹特，卻被高登和蝙蝠俠阻止並被逮捕。
蝙蝠俠開始審問小醜，他透露瑞秋和丹特已被帶到城市的兩端，並放置了兩個遙控爆裂物，之間的距離讓蝙蝠俠無法同時救他們。蝙蝠俠立即出發去救瑞秋，同時高登和警察去救丹特。但小醜故意將瑞秋與丹特的位置說反，讓兩人救的對象相反。
通過炸彈的掩護，小醜和劉先生順利逃出警局。蝙蝠俠即時救到丹特，但丹特被火燒掉了左半張臉，被送往醫院。高登卻沒救到瑞秋，讓她在爆炸中身亡。丹特因瑞秋的死陷入瘋狂。此時小醜來到醫院釋放了丹特，並說服他必須向警察、黑幫、高登和蝙蝠俠複仇，丹特成為了雙麵人。
當哈維一一質問並用硬幣決定貪汙警察和幫派份子的生死時，小醜把一半黑幫的錢和劉先生一起燒掉。小醜再次向眾人宣布他將會統治街道，留在高譚市的市民在夜晚來臨時都將受他統治。橋和隧道因為小醜的炸彈威脅而封鎖，政府開始以渡輪撤離民眾。小醜已事先在兩艘渡輪上放了炸彈，一艘載著普通民眾，另一艘載著囚犯，並告訴兩邊的乘客，自救的方法就是先用他準備的引爆器，引爆另一艘船隻。否則，兩艘船都會在午夜時被遙控炸毀。蝙蝠俠鎖定了小醜的位置並阻止他炸毀船隻。被打倒後，小醜了解蝙蝠俠是不可能墮落腐敗的，丹特卻不是。
小醜已將丹特的憤怒釋放出來。蝙蝠俠發現丹特綁架了高登和他的家人，被帶到瑞秋死亡的大樓殘骸。丹特開始用擲硬幣來決定他自己、蝙蝠俠和高登
兒子的生死。丹特朝蝙蝠俠的腹部開了一槍。就在丹特決定小男孩的生死前，蝙蝠俠撲倒了丹特，兩人同時墜樓，丹特無意識地倒在地上。
蝙蝠俠和高登知道若哈維謀殺警察等5人的事傳出去，會讓城市混亂且道德淪陷，而這就是小醜的最大目的。蝙蝠俠說服高登，蝙蝠俠自己扛下這些罪名，以維持哈維的英雄形象。
片尾高登發出了蝙蝠俠的追捕令，砸毀了蝙蝠信號燈，並給了蝙蝠俠黑暗騎士的稱號。
手下們被小醜的伎倆玩弄，開始自相殘殺。當假冒的蝙蝠俠試著阻礙黑道與稻草人之間的毒品交易。此時真的蝙蝠俠現身，而後他在戰鬥中因為盔甲太過笨重而受了傷，讓他想重新設計蝙蝠裝。蝙蝠俠、高登隊長和新的檢察長哈維丹特計劃將黑幫斬草除根，哈維就能當上公開的英雄。同時布魯斯發現瑞秋在與丹特交往。
黑幫老大開會討論如何對付蝙蝠俠、高登和丹特，華裔的黑幫會計劉先生告訴黑幫老大，他搶先在丹特所策劃的扣押黑錢計劃執行前，就將黑道的錢移往香港。小醜突然現身並提議用一半的黑錢，來雇用他殺死蝙蝠俠，遭到黑幫拒絕。
當蝙蝠俠順利抓住逃迴香港的劉並轉交給高登後，黑道同意雇用小醜殺死蝙蝠俠。此時小醜向全高譚市宣布，隻要蝙蝠俠一天不自首，往後每天都會有人死亡。
當小醜暗殺了警長羅伯和審判黑幫的法官等公眾官員後，布魯斯決定自首。在他自首前，丹特搶先宣稱自己就是蝙蝠俠，希望借此引出小醜。小醜中計現身想殺死丹特，卻被高登和蝙蝠俠阻止並被逮捕。
蝙蝠俠開始審問小醜，他透露瑞秋和丹特已被帶到城市的兩端，並放置了兩個遙控爆裂物，之間的距離讓蝙蝠俠無法同時救他們。蝙蝠俠立即出發去救瑞秋，同時高登和警察去救丹特。但小醜故意將瑞秋與丹特的位置說反，讓兩人救的對象相反。
通過炸彈的掩護，小醜和劉先生順利逃出警局。蝙蝠俠即時救到丹特，但丹特被火燒掉了左半張臉，被送往醫院。高登卻沒救到瑞秋，讓她在爆炸中身亡。丹特因瑞秋的死陷入瘋狂。此時小醜來到醫院釋放了丹特，並說服他必須向警察、黑幫、高登和蝙蝠俠複仇，丹特成為了雙麵人。
當哈維一一質問並用硬幣決定貪汙警察和幫派份子的生死時，小醜把一半黑幫的錢和劉先生一起燒掉。小醜再次向眾人宣布他將會統治街道，留在高譚市的市民在夜晚來臨時都將受他統治。橋和隧道因為小醜的炸彈威脅而封鎖，政府開始以渡輪撤離民眾。小醜已事先在兩艘渡輪上放了炸彈，一艘載著普通民眾，另一艘載著囚犯，並告訴兩邊的乘客，自救的方法就是先用他準備的引爆器，引爆另一艘船隻。否則，兩艘船都會在午夜時被遙控炸毀。蝙蝠俠鎖定了小醜的位置並阻止他炸毀船隻。被打倒後，小醜了解蝙蝠俠是不可能墮落腐敗的，丹特卻不是。
小醜已將丹特的憤怒釋放出來。蝙蝠俠發現丹特綁架了高登和他的家人，被帶到瑞秋死亡的大樓殘骸。丹特開始用擲硬幣來決定他自己、蝙蝠俠和高登
兒子的生死。丹特朝蝙蝠俠的腹部開了一槍。就在丹特決定小男孩的生死前，蝙蝠俠撲倒了丹特，兩人同時墜樓，丹特無意識地倒在地上。
蝙蝠俠和高登知道若哈維謀殺警察等5人的事傳出去，會讓城市混亂且道德淪陷，而這就是小醜的最大目的。蝙蝠俠說服高登，蝙蝠俠自己扛下這些罪名，以維持哈維的英雄形象。
片尾高登發出了蝙蝠俠的追捕令，砸毀了蝙蝠信號燈，並給了蝙蝠俠黑暗騎士的稱號。