第二天，趙南星，王紀，孫慎行集體提出辭職的要求，說是年紀老邁，恐有負聖恩什麽的，朱由校也假意挽留了一下，看東林三人辭職的意願很強烈，就勉為其難地同意了，給三人一個一個榮銜，並派錦衣衛送迴家，這樣兩方的麵子都顧到了，一幅君臣和諧的樣子。
朱由校送別了三位老臣後，命大臣們推行接任的尚書名單，因為先已經和方從哲及徐光啟商量過了，所以呈上來的名單比較切合朱由校的要求，由何宗彥任戶部尚書，朱延禧為禮部尚書，盛以弘為刑部尚書，而原戶部尚書徐光啟任吏部尚書。
這是為徐光啟入閣做準備，本來徐光啟現在入閣也是水到渠成的事，但朱由校不想要他現在入閣，因為他想讓徐光啟接下方從哲的班，所以先讓他在各部經曆一下，且吏部尚書一直號稱天官，隱隱是尚書中的第一人，由吏部尚書入閣會給徐光啟帶來很大的威信加成，而明年的京察他準備要有大動作，徐光啟又沒有黨派，所以將徐光啟先放在吏部最好。
這個設置讓東林人一喜一憂，喜的是何宗彥本來是偏東林的人，說明皇帝確實不想大動東林，憂的是吏部由徐光啟主掌，讓天啟三年的京察變得不再對東林黨有利了。
各官就位後，朱由校要開始解決收稅問題了。於是在朝會上，畢自嚴提出了稅收現在麵臨的兩個問題，皇帝命大臣們議一議應該如何解決。
其實這兩個問題的根子都是相同的，因為開礦的大多是高官顯貴或者是他們的親屬下人之類的，所以問題一擺出來，大臣們都沉默了。
朱由校很不雅觀地敲了敲龍案，大聲說道：“怎麽了，都不出聲了，平時不是都挺能說的嗎？攻擊這個攻擊那個是小人，是邪黨，現在有個正經事了就都不作聲了呀。“
鄒元標出列道：”陛下，既然所收商業稅已經超過以往最好的時間，那不是好事嗎？“
朱由校看著這個東林幹將，問道：”鄒禦史覺得礦稅收不到很正常？那其它的稅收不到也應該算正常，那大家都不用交稅了，你的俸祿從何而來，朝廷用度從何而來？“
鄒元標道：”農稅當然要收，所收商業稅已經超過萬曆年間，請陛下不可苛待商家。“
朱由校笑道：”你要朕不要苛待商家，那要不要苛待農家呢？你下麵去看看，過不下去日子的是商家還是農家，然後再來和朕說說吧。傳旨，著左都禦史鄒元標為陝西巡訪使，體察陝西民情，即日啟程。“
皇帝這種一言不合就讓你滾遠點的作法讓眾臣無可奈何，鄒元標謝恩後就迴去準備了，皇帝說即日啟程，如果拖到明天，說不定就把你趕迴家去了。
鄒元標出去後，朱由校又看著大臣們道：”礦稅不好收，有人不交稅，或者用其他的方法逃稅，稅務署的人又沒法去封別人的礦，因為你總不能用筆去封吧，你一個收稅的讓別人不開別人就會不開嗎？大家都來說下，如何解決這個問題吧。“
大臣們都不說話，孫承宗無奈地出列道：”陛下，可否由戶部多派人手，幫助稅務署來收礦稅呢？讓礦場隻要出產後就先收礦稅，煉化後再收一道商稅。“
朱由校斷然道：”不行，直管的意思就是不能再由戶部管理，隻需要和戶部進行稅費交接就可以了。再說憑戶部的老吏們能把礦稅收起來嗎？“
大家都很會聽皇帝的意思，官應震立即出列道：”陛下，讓東廠或者錦衣衛抓捕不交礦稅的刁民，不就可以了嗎？“
朱由校還是否定：”不行，東廠負責監督稅務署，但不能參與到具體事務中來。“
徐光啟出列道：”陛下，可否給稅務署以調兵之權，一次最多可調當地衛所軍一百名，可以幫助強製收稅，封掉不交稅的礦場。“
朱由校道：”不妥，軍隊除非鎮壓叛亂，不然不能針對本國民眾。畢署長，你可想過有什麽好辦法嗎？“
畢自嚴出列道：”陛下，臣覺得徐尚書的方法如果變通一下就可以了，我們可以專門招收護稅的衙役，不用發給他們刀槍等武器，隻要常見的棍棒即可，請陛下聖裁。“
朱由校摸了摸並無胡子的下頜，想了一會道：”這樣也行，每個稅務司招收一百名，管理一個州應該是沒有問題了的，專門立個名目吧，就叫稅警，這名字一目了然，封了礦呀或者商鋪之類的綽綽有餘。招收的時候要注意不要招到刁滑的，免得到時胡亂勒索就不好了。“
這樣礦警成立後，就可以在礦場通過冶煉逃稅時封掉他的礦場了，而不交稅的當然也就可以封掉他了。不過朱由校又想到了一個問題，就是陳修他們遇到的問題，於是他把陳修的事情說了一遍，然後問道：”有人已經在某處開礦，然後另有人也想在此處開礦，那應該如何處理呢？“
畢自嚴道：”陛下，我們隻管收礦稅，先來者隻要交一份契稅即可在此地開礦，後來者要麽用錢讓先來者轉讓，要麽和先來者合營。“
朱由校搖了搖頭道：”此法不妥，象陳修在開平勘探，發現這是一個極大的煤礦，那朝廷想在這裏開礦，結果原主獅子大開口，難道朝廷就隻能乖乖地給錢嗎？這不行，重新想個辦法，要把礦場控製在朝廷手中。“
大家麵麵相覷，皇帝這意思是想把天下所有礦產都要拿到朝廷手裏呀。本來說起來礦產確實是皇帝所有的，不是說普天之下，莫非王土嗎，當然都是皇帝的，但現在別人已經開了礦，要收迴來說是朝廷的，這就有些困難了。
當然，這隻是有困難，方法還是有的，新任刑部尚書盛以弘出列道：”陛下，如果下一道聖旨，將所有礦產都收歸國有，其實也是可以的。隻是天下礦場都開不成了，隻有朝廷能開礦了。“
朱由校送別了三位老臣後，命大臣們推行接任的尚書名單，因為先已經和方從哲及徐光啟商量過了，所以呈上來的名單比較切合朱由校的要求，由何宗彥任戶部尚書，朱延禧為禮部尚書，盛以弘為刑部尚書，而原戶部尚書徐光啟任吏部尚書。
這是為徐光啟入閣做準備，本來徐光啟現在入閣也是水到渠成的事，但朱由校不想要他現在入閣，因為他想讓徐光啟接下方從哲的班，所以先讓他在各部經曆一下，且吏部尚書一直號稱天官，隱隱是尚書中的第一人，由吏部尚書入閣會給徐光啟帶來很大的威信加成，而明年的京察他準備要有大動作，徐光啟又沒有黨派，所以將徐光啟先放在吏部最好。
這個設置讓東林人一喜一憂，喜的是何宗彥本來是偏東林的人，說明皇帝確實不想大動東林，憂的是吏部由徐光啟主掌，讓天啟三年的京察變得不再對東林黨有利了。
各官就位後，朱由校要開始解決收稅問題了。於是在朝會上，畢自嚴提出了稅收現在麵臨的兩個問題，皇帝命大臣們議一議應該如何解決。
其實這兩個問題的根子都是相同的，因為開礦的大多是高官顯貴或者是他們的親屬下人之類的，所以問題一擺出來，大臣們都沉默了。
朱由校很不雅觀地敲了敲龍案，大聲說道：“怎麽了，都不出聲了，平時不是都挺能說的嗎？攻擊這個攻擊那個是小人，是邪黨，現在有個正經事了就都不作聲了呀。“
鄒元標出列道：”陛下，既然所收商業稅已經超過以往最好的時間，那不是好事嗎？“
朱由校看著這個東林幹將，問道：”鄒禦史覺得礦稅收不到很正常？那其它的稅收不到也應該算正常，那大家都不用交稅了，你的俸祿從何而來，朝廷用度從何而來？“
鄒元標道：”農稅當然要收，所收商業稅已經超過萬曆年間，請陛下不可苛待商家。“
朱由校笑道：”你要朕不要苛待商家，那要不要苛待農家呢？你下麵去看看，過不下去日子的是商家還是農家，然後再來和朕說說吧。傳旨，著左都禦史鄒元標為陝西巡訪使，體察陝西民情，即日啟程。“
皇帝這種一言不合就讓你滾遠點的作法讓眾臣無可奈何，鄒元標謝恩後就迴去準備了，皇帝說即日啟程，如果拖到明天，說不定就把你趕迴家去了。
鄒元標出去後，朱由校又看著大臣們道：”礦稅不好收，有人不交稅，或者用其他的方法逃稅，稅務署的人又沒法去封別人的礦，因為你總不能用筆去封吧，你一個收稅的讓別人不開別人就會不開嗎？大家都來說下，如何解決這個問題吧。“
大臣們都不說話，孫承宗無奈地出列道：”陛下，可否由戶部多派人手，幫助稅務署來收礦稅呢？讓礦場隻要出產後就先收礦稅，煉化後再收一道商稅。“
朱由校斷然道：”不行，直管的意思就是不能再由戶部管理，隻需要和戶部進行稅費交接就可以了。再說憑戶部的老吏們能把礦稅收起來嗎？“
大家都很會聽皇帝的意思，官應震立即出列道：”陛下，讓東廠或者錦衣衛抓捕不交礦稅的刁民，不就可以了嗎？“
朱由校還是否定：”不行，東廠負責監督稅務署，但不能參與到具體事務中來。“
徐光啟出列道：”陛下，可否給稅務署以調兵之權，一次最多可調當地衛所軍一百名，可以幫助強製收稅，封掉不交稅的礦場。“
朱由校道：”不妥，軍隊除非鎮壓叛亂，不然不能針對本國民眾。畢署長，你可想過有什麽好辦法嗎？“
畢自嚴出列道：”陛下，臣覺得徐尚書的方法如果變通一下就可以了，我們可以專門招收護稅的衙役，不用發給他們刀槍等武器，隻要常見的棍棒即可，請陛下聖裁。“
朱由校摸了摸並無胡子的下頜，想了一會道：”這樣也行，每個稅務司招收一百名，管理一個州應該是沒有問題了的，專門立個名目吧，就叫稅警，這名字一目了然，封了礦呀或者商鋪之類的綽綽有餘。招收的時候要注意不要招到刁滑的，免得到時胡亂勒索就不好了。“
這樣礦警成立後，就可以在礦場通過冶煉逃稅時封掉他的礦場了，而不交稅的當然也就可以封掉他了。不過朱由校又想到了一個問題，就是陳修他們遇到的問題，於是他把陳修的事情說了一遍，然後問道：”有人已經在某處開礦，然後另有人也想在此處開礦，那應該如何處理呢？“
畢自嚴道：”陛下，我們隻管收礦稅，先來者隻要交一份契稅即可在此地開礦，後來者要麽用錢讓先來者轉讓，要麽和先來者合營。“
朱由校搖了搖頭道：”此法不妥，象陳修在開平勘探，發現這是一個極大的煤礦，那朝廷想在這裏開礦，結果原主獅子大開口，難道朝廷就隻能乖乖地給錢嗎？這不行，重新想個辦法，要把礦場控製在朝廷手中。“
大家麵麵相覷，皇帝這意思是想把天下所有礦產都要拿到朝廷手裏呀。本來說起來礦產確實是皇帝所有的，不是說普天之下，莫非王土嗎，當然都是皇帝的，但現在別人已經開了礦，要收迴來說是朝廷的，這就有些困難了。
當然，這隻是有困難，方法還是有的，新任刑部尚書盛以弘出列道：”陛下，如果下一道聖旨，將所有礦產都收歸國有，其實也是可以的。隻是天下礦場都開不成了，隻有朝廷能開礦了。“